22个Y-SNP在贵州满族人群的分布

22个Y-SNP在贵州满族人群的分布

论文摘要

目的:调查贵州满族人群Y染色体上22个单核苷酸多态性(SNP)位点的分布情况,并探讨该人群与其他民族群体的遗传关系。方法:采用SNapShot法对70例贵州满族男性个体22个Y-SNP位点进行复合扩增检测,用直接计数法计算等位基因频率、单倍型频率与单倍群频率,运用SPSS 24软件进行主成分分析;根据单倍群频率用Arlequin 3.5软件计算13个群体的遗传距离(Fst)值,并根据Fst值用MEGA 7.0软件中的Neighbor-Joining法绘制系统进化树。结果:贵州满族群体22个Y-SNP位点的基因多样性值(GD)为0.028 6~0.492 3,22个Y-SNP位点所组成的单倍型共检出11种,单倍型多样性值(HD)为0.740 4;与已报道的中国12个民族人群单倍群分布频率比较,贵州满族与其他群体的Fst值介于0.162 8~0.497 2,其中贵州满族与新疆锡伯族之间的遗传距离最小(0.162 8),与内蒙鄂伦春族之间的遗传距离最大(0.497 2);主成分分析和聚类分析的结果基本一致。结论:从父系遗传角度分析,贵州满族既受其他民族基因融合的影响,又保留了北方民族的特征。

论文目录

  • 1 材料和方法
  •   1.1 样本收集及 DNA 标化
  •   1.2 Y染色体基因分型
  •     1.2.1 多重 PCR扩增及提纯
  •     1.2.2 SNapShot 单碱基扩增及纯化
  •     1.2.3 ABI 3130 毛细管电泳检测
  •   1.3 数据统计分析
  • 2 结果
  •   2.1 贵州满族人群22个Y-SNP的遗传多态性
  •   2.2 贵州满族与12个少数民族的群体遗传学分析
  •     2.2.1 贵州满族与12个少数民族的主成分分析
  •     2.2.2 贵族满族与12个少数民族的系统进化树
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 张秀秀,喻艳琴,朱卫芳,张婷,王婵娟,单可人,何燕,吴昌学

    关键词: 满族,贵州,染色体,单核苷酸多态性,遗传多态性

    来源: 贵州医科大学学报 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,基础科学

    专业: 生物学,基础医学

    单位: 贵州医科大学地方病与少数民族疾病教育部重点实验室,贵州医科大学贵州省医学分子生物学重点实验室,贵州医科大学

    基金: 国家自然科学基金资助(31560306),贵阳市科技计划项目基金资助[(2017)5-9]

    分类号: R394

    DOI: 10.19367/j.cnki.1000-2707.2019.04.003

    页码: 386-392

    总页数: 7

    文件大小: 618K

    下载量: 74

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