喜马拉雅旱獭线粒体DNA控制区遗传多样性及系统发育

论文摘要

喜马拉雅旱獭是青藏高原的优势种,数量多、分布广,全面了解其遗传背景对该地区旱獭资源的保护与合理利用具有重要的意义。本研究以青藏高原云南、西藏和青海三省区共13个地理种群计258只旱獭为研究对象,PCR扩增获得线粒体DNA控制区基因部分序列(887 bp),并运用种群遗传学方法进行遗传多样性分析。结果显示:258份样品共发现了84个变异位点(9.40%),定义了68种单倍型,其单倍型多样性(h)平均值为0.968±0.003、核苷酸多样性(π)平均值为0.017 25±0.016 37,种群总体遗传多样性较高。AMOVA方差分析显示13个地理种群间存在着明显的遗传分化(Fst=0.620 67,P<0.001),种群间基因交流多数较低(Nm<1)。基于单倍型构建的系统发育树中13个地理种群的喜马拉雅旱獭聚为两支,其中来自青藏高原西南地区(西藏安多、青海格尔木、青海囊谦、云南迪庆)的18个单倍型聚成一个大的分支(A支),其余50个单倍型聚为一个大的分支(B支),在NETWORK网络图中也可见到相似网络拓扑结构。研究结果显示青藏高原喜马拉雅旱獭种群以唐古拉山脉为界分为两个大的种群,说明地理隔离是影响喜马拉雅旱獭种群动态变化的主要因素。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 马英,李海龙,何建,赵延梅,杨汉青,鲁亮,刘起勇

关键词: 喜马拉雅旱獭,控制区,遗传多样性,系统发育

来源: 兽类学报 2019年03期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 青海省地方病预防控制所,中国疾病预防控制中心传染病预防控制所

基金: 青海省科技厅基础研究计划项目(2016-ZJ-770),国家自然科学基金项目(81560521,31060279),青海省鼠疫防控与研究重点实验室(2017-ZJ-Y22)

分类号: Q953

DOI: 10.16829/j.slxb.150229

页码: 285-294

总页数: 10

文件大小: 2405K

下载量: 122

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