紫背天葵叶和花中花青素合成相关转录组基因分析

紫背天葵叶和花中花青素合成相关转录组基因分析

论文摘要

为获取紫背天葵(Gynura bicolor D C.)花青素合成代谢相关调控基因信息,该试验以紫背天葵叶片为材料,以其花朵为对照,进行转录组测序,并进行CHS、CHI、F3H等8类合成酶基因以及MYB、bHLH及WD40等3类转录因子检索,从中选取8个相关差异表达显著调控基因进行qRT-PCR验证分析。结果显示:(1)在紫背天葵中共获得72个花青素合成酶信息,其中差异表达明显的有1个F3′H和2个3GT下调,9个F3H基因中有上调基因4个和下调基因5个。(2)在紫背天葵中获取到238个MYB、113个bHLH和219个WD40转录因子,这3类转录因子中差异表达明显的分别为22个、16个和7个。(3)qRT-PCR结果显示,所选取的8个花青素合成相关调控基因,在紫背天葵叶及花朵中的下调表达趋势与转录组测序结果完全一致,但不同基因差异表达趋势略有不同。研究表明,在紫背天葵叶片和花朵中所存在的大量花青素合成代谢调控基因中,只有少量差异表达显著,但转录因子相比合成酶的调控更为复杂。

论文目录

  • 1 材料和方法
  •   1.1 材 料
  •   1.2 方 法
  •     1.2.1 转录组相关测序
  •     1.2.2 功能注释
  •     1.2.3 基因检索
  •     1.2.4 相关基因qRT-PCR分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 花青素合成代谢相关转录组信息
  •     2.1.1 调控相关基因统计
  •     2.1.2 差异表达显著相关合成酶
  •     2.1.3 差异表达显著的转录因子
  •   2.2 相关差异显著基因qRT-PCR分析
  •   2.3 8个基因的FPKM值与qRT-PCR结果比较
  • 3 讨 论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 张少平,郑开斌,洪佳敏,林宝妹,张帅,邱珊莲

    关键词: 紫背天葵,转录组基因,花青素,调控基因,合成酶,转录因子

    来源: 西北植物学报 2019年09期

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 福建省农业科学院亚热带农业研究所,福建省农业科学院作物研究所

    基金: 福建省农业科学院创新团队(STIT2017-2-11),福建省农业科学院青年创新团队(STIT2017-3-4),福建省公益类科研院所专项(2019R1030-4)

    分类号: Q943.2

    页码: 1551-1558

    总页数: 8

    文件大小: 901K

    下载量: 217

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