导读:本文包含了寡聚核苷酸芯片论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:核苷酸,芯片,白血病,基因芯片,基因,差异,血癌。
寡聚核苷酸芯片论文文献综述
赵黎,彭瑞云,高亚兵,王水明,马俊杰[1]（2006）在《寡聚核苷酸芯片技术筛选微波辐射后大鼠海马差异表达基因》一文中研究指出目的研究微波辐射后大鼠海马差异基因的表达改变,以探讨微波辐射致脑损伤的分子机制。方法采用大鼠寡聚核苷酸芯片筛选30 mW／cm2微波辐射后6 h和7 d大鼠海马差异表达基因,按照国际通用的分类标准(www．geneontology．org)对筛选结果进行功能分类;通过RT-PCR方法和图像分析技术验证部分基因在辐射前后表达的差异,并分析相关基因在微波辐射损伤中的作用。测量大鼠肛温以检测其体温改变情况。结果辐射后即刻和辐射前大鼠肛温相比未见显着性差异。寡聚核苷酸芯片检测了30 mW／cm2微波辐射后大鼠海马5705个基因的表达情况,筛选出33个差异表达基因。30 mW／cm2微波辐射后6 h,大鼠海马组织中共筛选出13个差异基因,其中4个基因表达上调,如突触素1等,9个基因表达下调,如钙结合蛋白和囊泡谷氨酸转运体等;辐射后7 d,差异表达基因为20个,其中4个基因表达上调,如早期生长反应蛋白2等,16个基因表达下调,如醛固酮合成相关基因和肾上腺素受体基因等。RT-PCR方法验证部分基因干辐射前后的差异表达情况并进行图像分析,其结果与芯片结果一致。差异基因功能涉及应激、转运、代谢、发育分化、细胞凋亡、信号转导、转录、细胞牯附等多类,进一步分析差异基因可能微波辐射后海马线粒体损伤、NMDAR信号通路开放、神经递质释放障碍、膜损伤等密切相关。结论微波辐射可使大鼠海马多个基因呈现差异表达,它们可能参与微波辐射损伤的病理生理过程,表明微波辐射脑损伤是多基因相互协同调控造成的,这为进一步研究微波辐射致脑损伤的机制提供新思路,并为寻找敏感诊断指标和防治措施提供依据。(本文来源于《第十一届中国体视学与图像分析学术会议论文集》期刊2006-10-01）
邱浪波,王广云,王正志[2]（2006）在《寡聚核苷酸芯片表达谱系统偏移的校正算法》一文中研究指出多芯片对比实验中,由于多方面的变异因素,使得芯片间存在明显的系统偏移.因此,芯片表达谱数据的校正处理是关键的数据预处理步骤.当前,已经提出了很多校正算法,比如:比例常数校正、非线性校正、分位数校正等.提出了一种新的校正算法.在选择的最小秩差异探针集上,进行非线性M-A校正.并采用迭代策略减弱基准芯片方法对基准芯片选择的敏感性.在标准测试集上,同几种已知的方法进行了对比分析.(本文来源于《生物化学与生物物理进展》期刊2006年06期）
高荣莲,陈肖华,饶亚岚,张军权,王治东[3]（2005）在《寡聚核苷酸芯片技术筛选电离辐射后大鼠PC12细胞的差异表达基因》一文中研究指出目的为探讨中枢神经系统辐射损伤的分子机理,采用寡聚核苷酸芯片技术研究16Gy60Coγ射线照射前后PC12细胞基因的表达变化。方法采用大鼠寡聚核苷酸芯片技术进行辐射相关基因的筛查,芯片探针进行荧光交换标记,且每个基因重复3次点阵;分析结果,选取感兴趣基因进行RTPCR半定量验证。结果基因芯片筛查有40个差异表达基因,其中上调基因37个,下调基因3个。这些差异基因主要涉及细胞周期、代谢、信号转导、免疫与应激、细胞增殖、生长发育及细胞凋亡等多个方面。RTPCR结果显示照射后48hPC12细胞OAS1、GARG16和IL6mRNA表达水平均上调,与芯片结果一致。结论PC12细胞可用于神经细胞辐射后信号转导、细胞代谢、生长发育、应激反应以及细胞增殖等方面的研究。(本文来源于《中华放射医学与防护杂志》期刊2005年03期）
孙薏,董陆佳,田方,王升启,贾治林[4]（2004）在《应用寡聚核苷酸芯片检测白血病与其同胞供者的白血病基因表达差异》一文中研究指出为了应用寡聚核苷酸基因表达谱芯片研究 9对白血病患者 /同胞供受者对之间的基因表达谱差异以识别主要的疾病相关基因 ,将 16 3条白血病 /肿瘤发病相关基因组群列入芯片设计 ,合成寡核苷酸探针 ,用点样仪点片制成基因芯片。提取病初白血病患者及其供者的骨髓 /外周血标本或其相对应的健康同胞供者经G CSF动员后并经CS 30 0 0细胞分离机采集的浓集的 9份外周血造血干细胞的总RNA ;分别逆转录并进行寡核苷酸探针杂交。结果表明 :与其相应的正常供者配对比较 ,发现 4例ALL患者中存在 6条显着差异表达基因 ,其中上调表达基因 5条(RIZ ,STK 1,T cellleukemia/lymphoma 1A ,Cbp/ p30 0 ,Op18) ,下调表达 1条 (hematopoieticproteoglycancorepro tein) ;5例AML M4和AML M5患者中亦存在 7条显着差异表达基因 ,其中上调表达 6条 (STAT5B ,ligandp6 2fortheLckSH2 ,CST3,LTC4S ,myeloidleukemiafactor 2 ,epb72 ) ,下调表达 1条 (CCR5 )。结论 :选择有高度遗传关联的兄弟姐妹供受者对作为差异研究比照对象 ,利用寡聚核苷酸基因芯片技术进行疾病基因的筛查 ,筛查出了 13条主要异常基因 ;进一步确认了上述基因在白血病分子发病机制中的关键性作用。(本文来源于《中国实验血液学杂志》期刊2004年04期）
梁静[5]（2004）在《应用DNA测序和寡聚核苷酸芯片对原发性肝癌中基因突变及变位剪接的研究》一文中研究指出目的：研究原发性肝癌中p53基因、β-catenin基因突变和DNMT3b基因、hTERT基因变位剪接的情况，及其在肝癌发生发展中的作用。 方法：通过RT-PCR、DNA测序结合寡聚核苷酸芯片杂交的方法对30例肝癌、30例癌旁及10例肝硬化、慢性肝炎、正常肝组织中p53基因、β-catenin基因突变和DNMT3b基因、hTERT基因变位剪接体进行检测，并将结果与肝癌病人临床指标进行统计学分析。 结果：RT-PCR结果显示β-catenin基因在96.7％(29／30)的肝癌、96.7％(29／30)的癌旁组织及全部正常肝组织有表达，表达强度在肝癌组强于癌旁组和正常组(p＜0.05)。p53基因在93.3％(28／30)的肝癌、93.3％(28／30)的癌旁组织、90.0％(9／10)的正常肝组织中有表达，表达强度在肝癌组与其他两组无差异(p＞0.05)。DNMT3b基因以四种变位剪接体(DNMT3b1、DNMT3b3、DNMT3b4、DNMT3b5)的形式表达，其总的表达率为肝癌组93.3％(28／30)、癌旁组93.3％(28／30)、正常组100.0％(10／10)。其中DNMT3b4在肝癌组中的表达高于癌旁组(p＜0.05)。hTERT基因在以四种变位剪接体(全长转录体、α剪接体、β剪接体及αβ剪接体)的形式表达，总的表达率为肝癌组77.3％(22／30)、癌旁组43.3％(13／30)、正常组30.0％(3／10)。hTERT基因全长转录体在肝癌中表达高于癌旁组织及正常组织、hTERT基因在癌旁组织和正常组织中以β变位剪接体表达为主。 DNA测序显示：β-catenin基因在肝癌中的突变率为43.8％(7／16)，突变位点主要集中在密码子33、37、40、45、50，β-catenin基因突变与肝癌中高表达有相关性(p＜0.05)，与病理分化和CLIP评分无相关性(p＞0.05)。p53基因在肝癌中突变率为15.4％(2／13)，肝癌中主要突变位点位于密码子235、248、278。 寡聚核苷酸芯片杂交结果显示在β-catenin基因45密码子检测到TCT→TTT的突变，在β-catenin基因其余位点及设计的p53基因的突变位点均未检测到突变型杂交信号。DNMT3b基因、hTERT基因均检测到全部四种变位剪接体的杂交信号。 结论:p一。atenin基因在肝癌中的突变及高表达可能与肝癌的发生相关。DNMT3b基因变位剪接体4可能参与肝癌的发生.hTERT基因在肝癌中的高表达及其全长转录体的再表达可能参与肝细胞由正常向肝癌的转变。(本文来源于《天津医科大学》期刊2004-05-01）
孙薏,董陆佳,李伍举,田方,王升启[6]（2003）在《利用寡聚核苷酸芯片对急性白血病进行分类预测及初步分型》一文中研究指出目的ALL与AML的鉴别诊断是化疗成功的关键。虽然目前基于细胞形态学、组织化学、免疫表型以及细胞遗传学分析的白血病诊断分型方法业已建立,但还远不足以全面反映临床白血病各亚型之间的异质性。基因组分析已成为目前白血病分型、诊断的重要指标,是对于原有白血病分类分型方法的进一步验证、细化和补充。方法将163条白血病/肿瘤发病相关基因组群列入芯片设计1.Golub TR等从6817条基因中筛选出的50条具有ALL/AML分型意义的基因;2.Miyazato A等从2304条基因中筛选出的在骨髓增生异常综合症(MDS)和AML呈现过表达的41条基;3.近年经本室研究验证的以及GeneBank所登录的白血病/肿瘤相关新基因72条。4.11条看家基因mRNA序列。采用计算机软件MProbe(本文来源于《第九届全国实验血液学会议论文摘要汇编》期刊2003-11-01）
孙薏[7]（2003）在《利用寡聚核苷酸芯片进行急性白血病疾病基因组检测及基因分型的初步研究》一文中研究指出白血病是一种复杂的、以庞杂的基因水平异常为特征的疾病。有关白血病特异性基因的研究有助于我们了解该病的复杂机制及其多态性。现有的诊断和预后分类法仍不足以反映白血病的异质性。新近有关人类基因组研究以及高通量的基因芯片技术的发展，使我们有可能最终揭示恶性疾病的复杂的分子机制。疾病基因组分析能够揭示本病复杂的转录水平异常所导致的基本的生物学改变。例如，特异性刺激反应产生的细胞信号转导以及细胞增殖、分化及凋亡改变。自从1999年将基因芯片技术应用于急性白血病分型以来，越来越多的资料提示，虽然白血病发生发展过程中累积异常基因群可能十分庞大，但是起关键的，核心作用的基因数量有限。从庞杂的基因群体中筛选影响白血病发生发展的主要基因，有的放矢地进行药物筛选和设计，将有可能得到事半功倍的效果。基因芯片技术作为一种高通量、快速、平行的基因表达信息监测和分析技术，对于研究白血病发病机理及基因分型是一个很好的方法。 本研究利用寡聚核苷酸基因芯片技术，初步筛选和鉴定出急性白血病相关基因，并对于急性白血病的基因分型诊断进行了有益的探讨。白血病相关基因的筛选基于以下两种设计比照：1．急性白血病患者与其有高度遗传关联的兄弟姐妹供者的差异比照；2．AML与ALL基因表达谱的差异比照。1、应用寡聚核苷酸芯片检测白血病与其同胞供者的白血病相关基因表达差异 目的 应用寡聚核苷酸基因表达谱芯片研究9对白血病患者／同胞供受者对之间的基因表达谱差异以识别主要的疾病相关基因。方法 将163条白血病／肿瘤发病相关基因组群列入芯片设计；合成寡聚核苷酸探针，用点样仪点片制成基因芯片。提取病初白血病患者及其相对应的健康同胞供者经G-CSF动员后经CS-3000细胞分离机采集的浓集的9份外周血造血干细胞总RNA，分别逆转录并进行寡聚核苷酸芯片杂交。结果 与其相应的正常供者配对比较，发现4中文摘要 例外L患者中存在6条显着差异表达基因：其中上调表达基因5条仅已打卜1， T－cellleukemia／lylllphoma IA，Cbp／p300，0P18），下调表达1条（he。atopoetic 9””上的g好闲nc。repr。tei巾；5例见卜M和巩卜MS患者中亦存在7条显着 差异表达基因：上调表达 6条（STATSB fig。ld p62 for th6 L。k SHZ，CST3， LTC4S，。veloid leukemia factor 2，enb72），下调表达1条（CCRS）。结论 选 择有高度遗传关联的兄弟姐妹供受者对作为差异研究比照对象，利用寡聚核着 酸基因芯片技术进行疾病基因的筛查，筛查出了13条基因表达上调或下调的 主要异常基因；进一步确认了上述基因在白血病分子发病机制中的关键性作 用。 2．急性白血病的分类及初步基因分型探讨 目的ALL与AML的鉴别诊断是化疗成功的关键。虽然目前基于细胞形 态学、组织化学、免疫表型以及细胞遗传学分析的白血病诊断分型方法业己建 立，但还远不足以全面反映临床白血病各亚型之间的异质性。基因组分析已成 为目前白血病分型、诊断的重要指标。方法本研究利用寡聚核着酸芯片技术 检测16例急性白血病样本；根据样本的基因表达谱数据进行初步分类预测及分 型研究。采用生物信息学方法（1）Tclass系统对AML和ALL样本进行分类精度 评估。（2）利用系统性聚类的方法分析16例急性白血病样本之间分子水平的 相似性。结果 通过对外L和A见的分类预测研究，发现基因XM－005707、 HUMMLCISA、NM－002524、HU’MBPIGE、HSMYHllFP在分类预测中有很高的分类精 确度，可以作为ALL和AML的分类预测因子。通过以变异系数（CV）为基础的 特征性基因选择，鉴定出了6个特征性基因：AF049498、HSDOCKP、AF202996、 HSA243995、HSU46751、HSWNCP，它们在急性白血病的初步基因分型中具有十 分重要的贡献。结论（二）通过生物信息学交叉有效性分析表明：寡聚核着酸 芯片技术能够基于少数几个基因表达谱聚类结果对于急性白血病样本来进行 精确的AML／ALL分类；o）系统聚类分析能够根据疾病的基因表达谱特征进行 聚类。其分型诊断与以往传统的分型结果呈现高度一致性。（3）与以往分类不 尽相同的是，寡聚核着酸芯片技术通过基因表达谱聚类分析能够发现更多的个 体特异性的基因异常。寡聚核着酸芯片技术作为继传统的细胞学、组化染色、 免疫学和遗传学分型以后所发展的重要的分子生物学研究技术可应用于急性 4中文摘要 白血病基因的进一步精细分类研究。(本文来源于《中国人民解放军军事医学科学院》期刊2003-06-01）
金亚,罗国安[8]（2000）在《DNA及寡聚核苷酸微型阵列芯片的研究进展》一文中研究指出1 引言近年来,ＤＮＡ及寡聚核苷酸的微型阵列(ｍｉｃｒｏａｒｒａｙ)芯片(也称ＤＮＡ芯片或基因芯片)在制造技术上得到了很大的发展,在生物学和医学等领域的应用更为世人瞩目。ＤＮＡ及寡聚核苷酸微型阵列芯片,概括说即使用光刻或点样技术将ＤＮＡ或寡聚核苷酸阵列制(本文来源于《药学学报》期刊2000年03期）
寡聚核苷酸芯片论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
多芯片对比实验中,由于多方面的变异因素,使得芯片间存在明显的系统偏移.因此,芯片表达谱数据的校正处理是关键的数据预处理步骤.当前,已经提出了很多校正算法,比如:比例常数校正、非线性校正、分位数校正等.提出了一种新的校正算法.在选择的最小秩差异探针集上,进行非线性M-A校正.并采用迭代策略减弱基准芯片方法对基准芯片选择的敏感性.在标准测试集上,同几种已知的方法进行了对比分析.
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
寡聚核苷酸芯片论文参考文献
[1].赵黎,彭瑞云,高亚兵,王水明,马俊杰.寡聚核苷酸芯片技术筛选微波辐射后大鼠海马差异表达基因[C].第十一届中国体视学与图像分析学术会议论文集.2006
[2].邱浪波,王广云,王正志.寡聚核苷酸芯片表达谱系统偏移的校正算法[J].生物化学与生物物理进展.2006
[3].高荣莲,陈肖华,饶亚岚,张军权,王治东.寡聚核苷酸芯片技术筛选电离辐射后大鼠PC12细胞的差异表达基因[J].中华放射医学与防护杂志.2005
[4].孙薏,董陆佳,田方,王升启,贾治林.应用寡聚核苷酸芯片检测白血病与其同胞供者的白血病基因表达差异[J].中国实验血液学杂志.2004
[5].梁静.应用DNA测序和寡聚核苷酸芯片对原发性肝癌中基因突变及变位剪接的研究[D].天津医科大学.2004
[6].孙薏,董陆佳,李伍举,田方,王升启.利用寡聚核苷酸芯片对急性白血病进行分类预测及初步分型[C].第九届全国实验血液学会议论文摘要汇编.2003
[7].孙薏.利用寡聚核苷酸芯片进行急性白血病疾病基因组检测及基因分型的初步研究[D].中国人民解放军军事医学科学院.2003
[8].金亚,罗国安.DNA及寡聚核苷酸微型阵列芯片的研究进展[J].药学学报.2000
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