SAC-1通过限制ARF-6的GTPase活性以保障囊泡循环运输

SAC-1通过限制ARF-6的GTPase活性以保障囊泡循环运输

论文摘要

在囊泡循环运输过程中,小G蛋白Arf6/ARF-6是调节细胞内体上磷脂酰肌醇4,5-二磷酸的一个决定性因子。为了进一步了解ARF-6的分子调节过程,我们在秀丽隐杆线虫中展开了对ARF-6结合蛋白的筛选,并从中获得了一个新的ARF-6结合蛋白SAC-1。SAC-1是酵母磷脂酰肌醇磷酸酶Sac1p在线虫中的同源物。在线虫极性肠上皮细胞中,ARF-6的缺乏会导致基底端内体丧失SAC-1的标记。货物蛋白的稳态分布实验显示,SAC-1缺失会特异性地影响顶膜端的分泌运输途径和基底端的循环运输途径。在sac-1突变动物中,PI(4,5)P2的水平以及ARF-6效应因子UNC-16标记的膜结构都显著增加,提示SAC-1可能是ARF-6的一个负调控因子。进一步研究发现,SAC-1能够与ARF-6的GEF蛋白BRIS-1相互作用,并且BRIS-1与SAC-1的互作能够以浓度依赖的方式减弱BRIS-1与无活性态ARF-6(GDP)的结合。因此,SAC-1缺失会促进细胞内ARF-6(GDP)与GEF蛋白BRIS-1的相互作用。而在sac-1突变动物中,敲降BRIS-1确实会降低PI(4,5)P2水平。值得注意的是,SAC-1禁锢BRIS-1使其与ARF-6隔离的这一功能并不受SAC-1自身磷酸酶活性的影响。我们的结果提示,SAC-1与BRIS-1的相互作用限制了ARF-6(GDP)与其GEF蛋白BRIS-1的接近,从而防止ARF-6的活性异常增高。目的:研究磷脂酰肌醇磷酸酶Sac1p/SAC-1参与调控秀丽线虫肠上皮细胞网格蛋白非依赖型内吞(clathrin-independent endocytic,CIE)循环运输的机制。方法:已知小G蛋白Rab10/RAB-10是调控CIE循环运输的关键因子,线虫rab-10突变体动物的肠上皮细胞内产生了异常增大的内体膜结构,并且CIE货物蛋白h TAC-GFP会在其中大量累积。据此,我们以rab-10(RNAi)作为阳性对照,对线虫全基因组进行RNAi筛选,检测哪一种基因表达被RNAi敲降后能够导致h TAC-GFP在肠细胞异常累积。通过筛选我们发现SAC-1缺失能引起h TAC-GFP的异常积累,说明SAC-1参与调控CIE循环运输。利用GST pull-down实验进一步发现SAC-1能特异性结合小G蛋白Arf6/ARF-6。已知在线虫肠细胞内,ARF-6对于CIE循环运输至关重要。随后,我们使用体细胞特异性CRISPR/Cas9基因编辑技术获得肠细胞特异性敲除的sac-1(ycx18)突变体,通过遗传学和细胞生物学的方法获得大量转基因荧光标记动物,并利用激光共聚焦显微成像技术对sac-1突变背景下线虫肠细胞内的ARF-6相关蛋白进行检测分析,探究SAC-1是否参与调控ARF-6活性及其调控机制。结果:在秀丽线虫肠上皮细胞内,我们发现SAC-1缺失导致CIE循环运输受阻,PI(4,5)P2水平异常增高,顶膜端细胞连接复合体错误定位以及ARF-6潜在效应因子JIP3/UNC-16在内体上大量积累。而ARF-6缺失导致SAC-1丧失其基底侧的内体定位。同时SAC-1可以特异性结合ARF-6-GEF蛋白BRIS-1,二者之间的相互作用不受SAC-1磷酸酶催化活性的影响。并且SAC-1与BRIS-1的结合以浓度依赖方式抑制了BRIS-1与ARF-6(GDP)的相互作用,从而限制ARF-6(GDP)的鸟苷酸交换防止ARF-6过度激活。另一方面,SAC-1缺失也导致网格蛋白依赖型内吞(clathrin-dependent endocytic,CDE)循环运输和顶膜端分泌运输出现异常。结论:在秀丽线虫肠上皮细胞内,SAC-1作为一个新发现的ARF-6结合蛋白,可能通过ARF-6-GEF蛋白BRIS-1介导了对ARF-6的负反馈调节。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 第1章 绪论
  • 第2章 材料和方法
  •   2.1 秀丽隐杆线虫的基本培养方法
  •     2.1.1 饲养
  •     2.1.2 清洁
  •     2.1.3 冻存
  •     2.1.4 杂交
  •     2.1.5 显微注射
  •   2.2 RNA干扰实验(RNAi)
  •   2.3 实验中使用的抗体
  •   2.4 CRISPR/Cas9 体细胞sac-1 基因敲除
  •   2.5 细胞培养和转染
  •   2.6 GST pull-down实验
  •     2.6.1 GST标签蛋白的表达
  •     2.6.2 GST标签蛋白的纯化
  •     2.6.3 HA标签蛋白的表达及结合
  •     2.6.4 SDS-PAGE
  •   2.7 载体构建和转基因线虫
  •   2.8 线虫的免疫共沉淀实验
  •   2.9 PIP免疫染色
  •   2.10 显微成像和数据分析
  • 第3章 研究结果
  •   3.1 SAC-1与ARF-6(GTP)和ARF-6(GDP)均相互作用
  •   3.2 SAC-1 在基底端点状膜结构上的定位依赖于ARF-6(GTP)
  •   3.3 在sac-1 突变体中CIE蛋白h TAC-GFP阻塞于早内体
  •   3.4 SAC-1缺失影响肠上皮细胞顶膜端的分泌运输
  •   3.5 SAC-1 缺失导致PI(4,5)P2 水平急剧上升
  •   3.6 SAC-1 缺失引起的ARF-6 过激活导致PI(4,5)P2及h TAC-GFP累积
  •   3.7 SAC-1 缺失导致ARF-6和UNC-16 的胞内累积
  •   3.8 SAC-1 缺失导致细胞连接蛋白HMP-1 定位异常
  •   3.9 SAC-1与ARF-6-GEF蛋白BRIS-1 相互作用
  •   3.10 SAC结构域的催化活性丧失不影响结合BRIS-1
  •   3.11 SAC-1与ARF-6(T27N)竞争结合BRIS-1/ARF-GEF
  • 第4章 讨论
  • 第5章 结论
  • 参考文献
  • 综述 ARF6 及其效应产物PI(4,5)P2 调控内吞运输
  •   内吞运输的主要途径
  •   Arf6调控囊泡循环运输
  •   PI(4,5)P2调控微丝动态并促进内吞
  •   参考文献
  • 附录A 转基因和突变线虫株
  • 附录B 常规试剂清单
  • 附录C 缩写词表
  • 附录D 发表论文
  • 致谢
  • 文章来源

    类型: 博士论文

    作者: 陈丹

    导师: 史岸冰

    关键词: 秀丽线虫,磷脂酰肌醇,二磷酸

    来源: 华中科技大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 华中科技大学

    分类号: Q25

    DOI: 10.27157/d.cnki.ghzku.2019.005038

    总页数: 106

    文件大小: 35695k

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