导读:本文包含了同源重复区论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:夜蛾,病毒,核型,斜纹,对虾,基因,综合症。
同源重复区论文文献综述
刘惠芬,刘文光,衣葵花,张志芳,李云芝[1]（2019）在《斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ型同源重复区的增强子功能分析》一文中研究指出斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ型(SpltNPVⅡ)基因组DNA含有7个同源重复区(hr)。采用脂质体介导转染法和瞬时表达实验对7个hr在异源病毒感染的BmN和Sf21细胞中增强异源ie1启动子转录活性的功能进行分析。结果表明,除hr5外,SpltNPVⅡhr均能增强BmNPV ie1启动子的转录活性,其中hr1、hr4和hr7增强效率较高,为对照的30～40倍;7个hr均能显着增强AcMNPV ie1启动子的转录活性,其中hr7增强效率高达1 246倍,其余增强效率在17～538倍之间。另外,SpltNPVⅡhr增强异源ie1启动子转录活性的效率与其所含的正反向重复序列、回文序列以及与复制相关的基序等特征结构的数目存在显着的正相关。(本文来源于《蚕业科学》期刊2019年04期）
刘惠芬,衣葵花,刘文光,李智峰,李云芝[2]（2017）在《斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ型分离株同源重复区hr5的结构功能分析》一文中研究指出对斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ(Splt NPVⅡ)基因组DNA中的同源重复区hr5的结构功能进行研究。结果表明,Splt NPVⅡhr5大小为389 bp,含有3个64 bp不完全回文序列,回文序列的中心均含有1个PvuⅠ限制性酶切位点,并且存在1个与病毒基因组DNA复制相关的motif(CGATT)基序。瞬时表达分析表明,hr5在野生型病毒感染和未感染的细胞中均具有增强早期基因ie1启动子活性的功能;实时荧光定量PCR结果显示,hr5在野生型病毒作为辅助病毒时,具有基因组DNA复制起始原点的功能。研究证明Splt NPVⅡhr5具有复制起始原点和增强子的双功能作用。(本文来源于《山东农业科学》期刊2017年08期）
刘惠芬,刘文光,衣葵花,张志芳,李轶女[3]（2017）在《斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ基因组DNA同源重复区生物信息学分析》一文中研究指出利用生物信息学方法,对斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ型分离株基因组DNA序列进行分析。结果表明,斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ基因组DNA含有7个同源重复区,分别包含3~8个64 bp不完全回文序列,在回文序列中心均含有一个Pvu I限制性酶切位点,并且存在多个正向或反向互补的重复序列和与病毒基因组DNA复制相关的motif基序,对7个hrs中40个回文序列进行比对分析,发现其序列的核苷酸一致性高达90%以上。(本文来源于《现代农业科技》期刊2017年11期）
刘惠芬,李云芝,衣葵花,刘文光,郭光[4]（2014）在《斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ型分离株同源重复区hr4结构功能分析》一文中研究指出斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ型分离株(Splt NPVⅡ)是近年来发现的一种繁殖率和毒力极强的新的病毒变异株,该病毒基因组DNA含有7个同源重复区。从Splt NPVⅡ基因组中克隆了hr4,进行了全序列测定和结构功能分析。序列分析发现,hr4大小为2212bp,位于基因组56264-58475bp,ORF57-ORF58之间。hr4含8个64 bp不完全回文序列,回文基序的中心均含有一个Pvu I限制性酶切位点,并且存在3个正向或反向互补的重复序列以及多个与病毒基因组DNA复制相关的motif基序。瞬时表达分析表明,hr4在野生型病毒Splt NPVⅡ感染和未感染的细胞中均具有增强早期基因ie1启动子活性功能;实时荧光定量PCR结果显示,hr4在野生型病毒Splt NPVⅡ作为辅助病毒时,具有复制起始原点功能。上述研究结果表明,Splt NPVⅡhr4具有复制起始原点和增强子双功能的作用,该研究将会进一步加深和丰富对杆状病毒增殖机制的认识。(本文来源于《中国蚕学会第八届青年学术研讨会论文集》期刊2014-08-13）
朱艳冰[5]（2009）在《白斑综合症病毒基因组同源重复区结合蛋白WSSV021的鉴定》一文中研究指出利用噬菌体展示技术,发现wssv021是与病毒基因组同源重复区中一个包含高度保守结构域的小重复片断DNA结合的蛋白质的编码基因,可能参与病毒复制或调控.时相转录分析发现,wssv021属于病毒感染的早期基因.将wssv021基因克隆到pQE-30表达载体,在E.coliXL1-Blue中进行融合表达.凝胶阻滞分析显示,体外表达的(His)6-WSSV021蛋白可以和同源重复区中小重复片断DNA特异性相互作用.(本文来源于《台湾海峡》期刊2009年02期）
朱艳冰,杨丰[6]（2006）在《对虾白斑综合症病毒基因组同源重复区结合蛋白的筛选》一文中研究指出对对虾白斑综合症病毒(WSSV)基因组序列分析发现,基因组3%的区域均匀分布有与昆虫杆状病毒类似的9个同源重复区,很可能具有昆虫杆状病毒同源重复区参与病毒复制起始或转录调控的功能.以WSSV基因组同源重复区中一个包含高度保守结构域的小重复片断DNA(210bp)作为配体,利用WSSV基因组噬菌体展示库,经过5轮淘选出一个可与DNA特异结合的重组噬菌体克隆,包含的外源DNA片断长度为306bp.通过与WSSV基因组序列对比,发现该序列为WSSV的ORFs中wsv021的5′端部分.推测wsv021是一个可能与病毒复制或调控相关的重要功能基因.(本文来源于《台湾海峡》期刊2006年03期）
李嵚[7]（2003）在《白斑综合症病毒致病相关早期蛋白的鉴定及基因组同源重复区的功能研究》一文中研究指出对虾白斑综合症病毒(White Spot Syndromic Virus, WSSV)，又称为白斑杆状病毒(White Spot Bacilliform Virus, WSBV)，是严重危害对虾养殖业的主要病原之一。本论文从WSSV宿主广泛性出发，围绕着病毒致病关键蛋白，特别是病毒早期蛋白，以及病毒蛋白与宿主蛋白间的相互作用机制，从结构功能基因组学和蛋白质组学角度对该病毒快速致死性的原因和机制进行了深入的研究。 本文内容主要包括下列工作：(1)以卤虫(Artemia franciscana)为实验对象简单阐述了其在WSSV宿主链中的作用；(2)在WSSV感染过程中起关键作用的病毒早期蛋白，如：病毒类胶原蛋白(Collagen-like Protein，CLP)和胸腺嘧啶核苷酸合成酶(Thymidylate Synthase，TS)的结构功能作了深入的研究；(3)通过病毒基因组同源重复区特异性结合蛋白的纯化鉴定，对病毒早期基因表达产物与宿主蛋白间的相互作用和在病毒感染和复制过程的作用做了初步的分析。 实验结果显示：□卤虫是一种acute host和latent host之外的，非致病性的载体宿主(passive carrier)，病毒进入宿主体内并不增殖，宿主无大量死亡和其他典型的病理特征，病毒染色体DNA可随着宿主繁殖而传递到受精卵中，并随着子代个体的发育成熟逐渐消失；□作为一种双链DNA动物病毒，在WSSV中发现了独特的类胶原蛋白(WSSV-CLP)和高保守的病毒胸腺嘧啶核苷酸合成酶(WSSV-TS)，这两种蛋白在病毒感染宿主早期开始转录表达，其中WSSV-clp基因编码一个病毒糖蛋白，该蛋白位于病毒粒子核衣壳和病毒包膜之间，并可形成多聚体结构。WSSV-CLP是第一个被证实糖基化修饰的结构蛋白。WSSV-ts基因编码表达WSSV基因组中最为保守的一个蛋白，体外表达的重组TS具有特异的底物结合能力。虽沈阳药科大学博士学位论文摘要然没有明显的poly(A)加尾信号(AATAAA)，3‘一RAcE发现该基因在病毒感染过程中可以正常转录，其mRNA含有poly(A)尾巴;口通过改进的亲和层析技术，SDS一PAGE电泳及GMSA分析等手段的相互结合，纯化得到特异结合于病毒同源区(homologous repeat regions，hrrs)高保守结构域(highly eonserved domain，HCD)的一组蛋白。这些蛋白与病毒感染宿主，并启动宿主已封闭基因的重新表达，及病毒复制增殖相关的信号传导系统有关。 结果表明，WSSV一CLP是病毒结构蛋白，该蛋白经过糖基化修饰，可能在病毒感染宿主细胞，与宿主细胞表面受体结合，并促进宿主细胞膜融合的过程中起重要的作用。包括病毒胸腺嗜睫核昔酸合成酶在内的一系列由病毒早期基因编码表达的，与DNA代谢密切相关的酶组成的独立于宿主之外的病毒胸腺啼睫核昔酸合成系统，可能是WSSV感染宿主导致快速死亡的主要原因之一。病毒人尹脚特异性结合蛋白的发现，将为研究病毒核酸复制，表达调控提供了大量的信息。(本文来源于《沈阳药科大学》期刊2003-09-28）
范凌云[8]（2002）在《棉铃虫核多角体病毒解螺旋酶（helicase）基因的序列分析和含有HaSNPV同源重复区亚克隆的构建》一文中研究指出对棉铃虫单核衣壳核多角体病毒(Helicoverpa armigerd single-nucleocapsid nucleopolyhedrovirus，HaSNPV)基因组中EcoRI—N片段进行序列分析，获得了完整的解螺旋酶基因(hel)，其开放阅读框大小为3762bp，编码一个分子量为146kDa的蛋白质。在hel起始密码子ATG上游50位有强晚期启动子转录起始信号ATAAG，在—112位和—189位存在两个TATA box，但未发现早期转录信号CAGT。其在终止密码子下游第12位有—PolyA终止信号AATAAA。HaSNPV解螺旋酶与其它5种杆状病毒解螺旋酶相比，有5个基元序列(Ⅰ、Ⅰa、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ)保守，另外两个(Ⅴ和Ⅵ)完全不保守。同源性比较发现HaSNPV解螺旋酶的氨基酸序列与甜菜夜蛾核多角体病毒(Spodoptera exigue MNPV，SeMNPV)的解螺旋酶具有最高的同源性(66％)，与Xestia c-nigrum颗粒体病毒(XcGV)解螺旋酶同源性最低(43％)，HaSNPV解螺旋酶基因是第一个报道的单粒包埋核多角体病毒的解螺旋酶基因。 在HaSNPV基因组中存在5个同源重复区hr,它们可能对病毒的复制和转录调控等起重要作用。对HaSNPV的5个hr区域进行了亚克隆，为进一步的功能研究奠定了基础。(本文来源于《中国科学院研究生院（武汉病毒研究所）》期刊2002-06-25）
朱中泽[9]（2002）在《家蚕杆状病毒同源重复区hr3结构与功能分析及不同转移载体表达效率比较》一文中研究指出在杆状病毒(baculovirus)生命循环中，DNA复制是中心环节，杆状病毒基因组中的同源重复区(homologous regions，hr3)具有复制起始位点的功能，在杆状病毒基因转录过程中也可对早期基因行使增强子功能。本研究涉及的hr3来自BmNPV ZJ-8株，它含有3个重复单位，每个单位含有以EcoRI位点为核心的30bp不完全回文序列及其两侧13bp茎环结构序列组成的72bp保守序列，已证明其具有复制起始位点的功能，并有特异的家蚕细胞因子与之结合。为进一步研究BmNPV hr3对不同病毒极早期基因ie-1启动子的增强子功能及其与宿主细胞的相互关系，本研究分别将BmNPV、AcMNPV的ie-1基因启动子控制下的荧光素酶基因克隆在hr3的上游，构建成瞬时表达报告质粒，在家蚕Bm5、BmN细胞系、秋粘虫sf-21细胞系以及家蚕五龄幼虫中瞬时表达，通过检测荧光素酶活性研究在不同宿主中hr3对ie-1启动子的增强功能。 通过带有和不带有hr3序列的瞬时表达报告质粒在细胞系(BmN、Bm5、sf-21)和家蚕五龄幼虫的瞬时表达分析，表明hr3在细胞系和蚕体内对ie-1启动子都有显着增强功能，最高可达6980倍。在叁种细胞系中Luciferase基因表达量有差异，但hr3对ie-1启动子的活性的增强倍数大致相当，这说明hr3的增强机理在鳞翅目不同科昆虫细胞中可能是相同的。ie-1启动子的活性相对于多角体基因启动子虽偏低，但却是杆状病毒极早期启动子中活性最强的一个，用它可以使外源基因在病毒感染的极早期就得到表达，寄主细胞较少受病毒影响，表达产物可以得到很好的修饰。本研究中hr3是目前报道功能最强的增强子之一，因此，hr3和ie-1启动子的组合可应用于构建昆虫细胞稳定表达载体和转基因昆虫。本实验首创在家蚕幼虫中通过lipofectin介导，将外源基因导入家蚕血淋巴细胞进行瞬时表达，证明通过lipofectin将外源基因导入家蚕幼虫的可行性，另一方面开创了一种在活体条件下通过瞬时表达研究家蚕杆状病毒复制转录元件的更简易、更经济也可能更为真实的方法。 据已知hr3序列含有3个72bp的EcoRI微小片段的特殊结构特点构建出一系列带不同长度的hr3片段(108bp、200bp、700bp)瞬时表达报告质粒，这叁种片段各带有：两个被13bp茎环结构序列分隔的半回文序列，一个72bp的EcoRI微小片段，完整的hr3片段，通过在BmN细胞的瞬时表达分析，研究其不同区段的hr3亚结构片段增强子功能，以阐明其结构和功能的相关性，研究发现hr3序列行使增强子功能的结构主要是30bp的不完全回文序列，叁个成簇存在的结构单元协同作用。 在应用研究方面，为提高杆状病毒表达系统对植酸酶的表达效率，本研究构建了两 种不同植酸酶转移表达载体p VLVL13＊正y、p030p叶，通过比双p VLVL1393phv、p030p冲、 pAKphy（本室构建）叁种不同转移表达载体的植酸酶表达效率以筛选表达效率最高的转 移表达载体，研究发现转移表达载体f，VL1393phy植酸酶表达效率最高。(本文来源于《中国农业科学院》期刊2002-06-01）
朱中泽,张志芳,易咏竹,何家禄[10]（2001）在《一组成型超强增强子—家蚕核型多角体病毒同源重复区hr3》一文中研究指出在杆状病毒(baculovirus)发育循环中,DNA复制是中心环节,以数个拷贝散布于杆 状病毒的基因组中的同源重复区(homologous regions,hrs)具有复制起始点的功能,在杆状病毒的基因转录过程中也可对IE-1等极早期基因行使增强子功能。本实验涉及的hr3来自BmNPV ZJ-8株,它含有3个重复单位,每个单位含有以EcoRI位点为核心的30bp不完全回文序列及其两侧由13bp茎环结构组成的72bp保守序列,已证明具有复制起始点的功能,并有特异的家蚕细胞核因子和其结合。家蚕核型多角体病毒(Bombyx mori.Nuclear Polyhedrosis Virus,BmNPV)和苜蓿尺蠖核型多角体病毒(Autograph caiifonica Nuclear Polyhedrosis Virus,AcMNPV)同属杆状病毒科,其基因组DNA同源性高达90％左右,但两者具有各自独立的宿主域。BmNPV hr3的复制起始功能区在AcMNPV感染的sf细胞内复制,(本文来源于《中国生物工程学会第叁次全国会员代表大会暨学术讨论会论文摘要集》期刊2001-06-30）
同源重复区论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
对斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ(Splt NPVⅡ)基因组DNA中的同源重复区hr5的结构功能进行研究。结果表明,Splt NPVⅡhr5大小为389 bp,含有3个64 bp不完全回文序列,回文序列的中心均含有1个PvuⅠ限制性酶切位点,并且存在1个与病毒基因组DNA复制相关的motif(CGATT)基序。瞬时表达分析表明,hr5在野生型病毒感染和未感染的细胞中均具有增强早期基因ie1启动子活性的功能;实时荧光定量PCR结果显示,hr5在野生型病毒作为辅助病毒时,具有基因组DNA复制起始原点的功能。研究证明Splt NPVⅡhr5具有复制起始原点和增强子的双功能作用。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
同源重复区论文参考文献
[1].刘惠芬,刘文光,衣葵花,张志芳,李云芝.斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ型同源重复区的增强子功能分析[J].蚕业科学.2019
[2].刘惠芬,衣葵花,刘文光,李智峰,李云芝.斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ型分离株同源重复区hr5的结构功能分析[J].山东农业科学.2017
[3].刘惠芬,刘文光,衣葵花,张志芳,李轶女.斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ基因组DNA同源重复区生物信息学分析[J].现代农业科技.2017
[4].刘惠芬,李云芝,衣葵花,刘文光,郭光.斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ型分离株同源重复区hr4结构功能分析[C].中国蚕学会第八届青年学术研讨会论文集.2014
[5].朱艳冰.白斑综合症病毒基因组同源重复区结合蛋白WSSV021的鉴定[J].台湾海峡.2009
[6].朱艳冰,杨丰.对虾白斑综合症病毒基因组同源重复区结合蛋白的筛选[J].台湾海峡.2006
[7].李嵚.白斑综合症病毒致病相关早期蛋白的鉴定及基因组同源重复区的功能研究[D].沈阳药科大学.2003
[8].范凌云.棉铃虫核多角体病毒解螺旋酶（helicase）基因的序列分析和含有HaSNPV同源重复区亚克隆的构建[D].中国科学院研究生院（武汉病毒研究所）.2002
[9].朱中泽.家蚕杆状病毒同源重复区hr3结构与功能分析及不同转移载体表达效率比较[D].中国农业科学院.2002
[10].朱中泽,张志芳,易咏竹,何家禄.一组成型超强增强子—家蚕核型多角体病毒同源重复区hr3[C].中国生物工程学会第叁次全国会员代表大会暨学术讨论会论文摘要集.2001
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