桉树焦枯病菌MAPK的鉴定与生物信息学分析

桉树焦枯病菌MAPK的鉴定与生物信息学分析

论文摘要

利用多种生物信息学网站与软件,从全基因组水平鉴定桉树焦枯病菌的促分裂原活化蛋白激酶(MAPK),并对其理化性质、亚细胞定位、结构域、二级结构、三级结构等进行分析,并构建系统发育树。结果表明,在桉树焦枯病菌中发现4个MAPK,分别命名为CpKss1、CpSlt2、CpHog1和CpIme2,均属于亲水蛋白,亚细胞定位均在细胞核。拥有高度保守的结构域STKc及位于活化环上的双重磷酸化位点T-X-Y,三级结构显示拥有蛋白特异性底物结合口袋特征。通过系统进化分析,这4个MAPK相应基因分别与酵母Fus3/Kss1、Slt2、Hog1和Ime2类基因同源,均和禾谷镰刀菌中相应的MAPK亲缘关系最近。该研究结果为进一步了解桉树焦枯病菌中MAPK的生物学功能和构建MAPK级联途径奠定基础。同时对桉树焦枯病菌致病、桉树抗病相关重要基因功能及分子机制等研究具有重要意义,最终为桉树焦枯病防治工作提供技术支持。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 桉树焦枯病菌MAPK的鉴定
  •   1.2 MAPK蛋白理化性质分析
  •   1.3 多菌种比较分析
  •   1.4 MAPK高级结构预测
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 基因组序列来源
  •   3.2 试验方法
  •     3.2.1 MAPK途径的鉴定
  •     3.2.2 MAPK理化性质分析
  •     3.2.3 MAPK蛋白结构分析
  •     3.2.4 MAPK系统进化分析
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 陈慧洁,陆芝,丁奕,杨泽慧,宋漳,冯丽贞

    关键词: 桉树,焦枯病,促分裂原活化蛋白激酶,生物信息学分析

    来源: 基因组学与应用生物学 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,医药卫生科技,农业科技

    专业: 生物学,植物保护,林业

    单位: 福建农林大学林学院,福建农林大学森林保护研究所

    基金: 福建省财政厅资助项目(Scz10039,K8113001A),福建农林大学科技创新专项基金项目(KFA17053A)共同资助

    分类号: S763.7;Q811.4

    DOI: 10.13417/j.gab.038.001615

    页码: 1615-1622

    总页数: 8

    文件大小: 323K

    下载量: 92

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