大肠杆菌O157:H7氟苯尼考耐药菌株与敏感菌株的蛋白组学差异

大肠杆菌O157:H7氟苯尼考耐药菌株与敏感菌株的蛋白组学差异

论文摘要

【目的】分析大肠杆菌O157:H7氟苯尼考耐药菌株与敏感菌株的差异表达蛋白,从蛋白组学层面揭示大肠杆菌O157:H7对氟苯尼考耐药性的产生机制。【方法】提取大肠杆菌O157:H7氟苯尼考耐药菌株(RS2-256)和敏感菌株(RS2)的全菌蛋白,经同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)标记后进行液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)分析,质谱数据通过Mascot v2.2鉴定,并根据COGs数据库对差异表达蛋白进行GO功能注释和分类。【结果】RS2菌株获得3385个肽段,RS2-256菌株获得3955个肽段,合计7340个肽段,其中6975个肽段为特有肽段,分属于1039个蛋白。与RS2菌株相比,RS2-256菌株有145个蛋白表达差异显著(P<0.05),占检测蛋白总数的13.96%,其中,上调表达蛋白有87个、下调表达蛋白有58个。表达差异蛋白按照功能进行分类,可分为外排泵、转运蛋白、细胞膜形成、应激调控、核糖体结构、DNA复制、转录、翻译、翻译后修饰、能量产生和转化、氨基酸转运和代谢、辅酶转运和代谢、糖转运和代谢、脂肪代谢、离子转运和代谢、细菌运动性、转座及信号通路共18类;多药物外排泵亚基AcrA和AcrB、外膜蛋白TolC、外膜蛋白X等52个蛋白的表达变化在3.00倍以上,占表达差异蛋白总数的35.86%。【结论】外排泵AcrAB-TolC家族、ABC家族、外膜蛋白、毒性调节器B、饥饿蛋白等在大肠杆菌O157:H7对氟苯尼考耐药性产生过程中发挥重要作用,同时涉及细菌糖代谢、氨基酸代谢、离子转运、DNA损伤与修复、生物膜及毒素与抗毒素系统等生命活动。

论文目录

  • 0 引言
  • 1 材料与方法
  •   1.1 试验材料
  •   1.2 蛋白样品制备
  •   1.3 蛋白酶解及iTRAQ标记
  •   1.4 标记肽段SCX分离和LC-MS/MS分析
  •   1.5 蛋白鉴定和定量分析
  •   1.6 生物信息学分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 大肠杆菌O157:H7的生长曲线
  •   2.2 iTRAQ标记蛋白图谱整体分析结果
  •   2.3 表达差异蛋白分析结果
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李军,冯世文,曾芸,谢宇舟,彭昊,潘艳,贺会利,钟舒红,胡帅

    关键词: 大肠杆菌,氟苯尼考,耐药性,差异表达蛋白,技术

    来源: 南方农业学报 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 广西兽医研究所/广西兽医生物技术重点实验室,广西大学动物科学技术学院

    基金: 广西创新驱动发展专项(桂科AA17204057),广西自然科学基金项目(2013GXNSFAA019093)

    分类号: S852.61

    页码: 875-882

    总页数: 8

    文件大小: 1892K

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