鸟类基因组的进化模型

鸟类基因组的进化模型

论文摘要

鸟类是四足类动物中最丰富的一类脊椎动物,鸟类快速演化形成了超过10,000个不同物种,但产生这些鸟类生物多样性的机制仍不清楚。鸟类的基因组资料为定量研究基因组进化提供了重要的依据。一方面,基于47种鸟类的全基因组核苷酸序列数据,验证了已建立的鸟类基因组核苷酸频率的进化方程,研究了核苷酸频率的演化机制和规律。通过对鸟类的基因组数据进行拟合,确定了进化惯性参数、耗散参数和环境参数。在此基础上,对每种碱基的进化速率进行了估计,并推导出了鸟类整个基因组长度的演化规律。我们发现,鸟类基因组的增长和信息在短时间内迅速积累起来。基因组迅速扩展后,基因组的核苷酸频率达到相对稳定的值,这与所谓的“进化停滞”相对应。另一方面,验证了鸟类基因组的量子进化方程,从基因组突变出发研究了新鸟产生的统计学规律。通过计算新生鸟类的量子跃迁几率,构造出能够反映鸟类进化过程的鸟类量子进化树,从量子角度研究了鸟类的起源与进化。从中发现:(1)新种产生是随机事件,遵循统计学规律;(2)鸟类性成熟时间在进化中具有重要的物种特征性;(3)量子跃迁几率的相近程度可以用来判定鸟类的亲缘关系。本文的研究结果为了解新生鸟类在后白垩纪时期的快速产生的规律提供了一条新的线索,获得了关于鸟类进化更全面的图景。本文提出的方法为鸟类和其他物种的进化问题定量研究提供了一种普遍的方法。

论文目录

  • 摘要
  • abstract
  • 第一章 绪论
  •   1.1 研究背景及动机
  •   1.2 研究内容与目标
  •   1.3 论文结构
  • 第二章 数据和假设
  •   2.1 数据的来源与处理
  •   2.2 假设和命名
  • 第三章 鸟类基因组核苷酸频数的进化模型
  •   3.1 鸟类基因组核苷酸频数的进化方程
  •   3.2 参数的估计和确定
  •   3.3 方程的解
  •   3.4 结果与讨论
  •     3.4.1 鸟类核苷酸频数的进化轨道
  •     3.4.2 参数的选择问题
  • 第四章 鸟类基因组的量子进化模型
  •   4.1 鸟类基因组的量子进化方程
  •   4.2 参数的选取
  •     4.2.1 参数γ的选取
  •     4.2.2 参数c’的估计
  •   4.3 跃迁几率的计算以及鸟类量子进化树的构建
  •     4.3.1 A类鸟的跃迁几率计算以及量子进化树主体结构的确定
  •     4.3.2 B类鸟的跃迁几率计算以及量子进化树的构造
  •     4.3.3 量子进化树质量的评定
  •   4.4 结果与讨论
  • 第五章 总结与展望
  •   5.1 全文总结
  •   5.2 工作展望
  • 参考文献
  • 致谢
  • 硕士期间发表的论文
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 周勋

    导师: 张利绒

    关键词: 鸟类,基因组,进化方程,进化停滞,量子跃迁,量子进化树

    来源: 内蒙古大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 内蒙古大学

    分类号: Q951

    总页数: 46

    文件大小: 4939K

    下载量: 162

    相关论文文献

    • [1].利用流式细胞术测定大额牛基因组大小的研究[J]. 基因组学与应用生物学 2018(12)
    • [2].连翘基因组大小的流式细胞仪测定[J]. 时珍国医国药 2019(03)
    • [3].内蒙古草原不同基因组大小植物对氮水添加的响应[J]. 应用生态学报 2019(08)
    • [4].流式细胞术测定巴戟天基因组大小[J]. 中药新药与临床药理 2018(05)
    • [5].动植物高质量基因组的获取及其主要应用[J]. 生命科学 2019(07)
    • [6].瓠瓜基因组测定[J]. 北方园艺 2016(02)
    • [7].基于流式细胞技术的灵芝基因组大小估测[J]. 菌物学报 2013(05)
    • [8].3种柴胡染色体数目测定及基因组大小估测[J]. 江苏农业科学 2019(11)
    • [9].早樱种系基因组大小的研究[J]. 安徽农业大学学报 2017(06)
    • [10].毛冠鹿基因组大小的研究[J]. 扬州大学学报(农业与生命科学版) 2008(04)
    • [11].云南芒果种质基因组大小测定与变异分析[J]. 热带亚热带植物学报 2015(04)
    • [12].4种人参属植物基因组大小的测定[J]. 植物分类与资源学报 2014(02)
    • [13].基于流式细胞技术的两种槭属植物基因组大小测定[J]. 南京林业大学学报(自然科学版) 2018(05)
    • [14].流式细胞仪测定荔枝倍性和基因组大小的细胞核提取液筛选与应用[J]. 果树学报 2019(07)
    • [15].基于流式细胞术和K-mer分析的好好芭基因组大小估测[J]. 北京师范大学学报(自然科学版) 2018(06)
    • [16].药用黄芪基因组大小的研究[J]. 中国中医基础医学杂志 2019(09)
    • [17].PCV-3/CN/Guizhou/ASXX/2017321株全基因组克隆与序列分析[J]. 黑龙江畜牧兽医 2019(12)
    • [18].决定真核生物基因组大小的因素[J]. 生物学教学 2012(07)
    • [19].专家破解大白鲨全基因组发现抗癌进化机制[J]. 肿瘤防治研究 2019(03)
    • [20].网柄菌属9个种形态特征及其基因组大小分析[J]. 中国农业大学学报 2019(08)
    • [21].基于本草基因组学应用流式细胞术和高通量测序技术检测人参基因组大小[J]. 世界科学技术-中医药现代化 2017(10)
    • [22].流式细胞术估测枣染色体倍性和基因组大小方法的建立及应用[J]. 农业生物技术学报 2018(03)
    • [23].黄麻全基因组SSR鉴定与特征分析[J]. 作物学报 2019(01)
    • [24].基于流式细胞术的旱柳染色体倍性与基因组大小测定[J]. 江苏农业科学 2018(22)
    • [25].基于流式细胞术和K-mer分析的黄芪基因组大小估测[J]. 中草药 2019(06)
    • [26].黄藤染色体核型及基因组大小分析[J]. 热带亚热带植物学报 2019(03)
    • [27].植物基因组大小进化的研究进展[J]. 遗传 2009(05)
    • [28].5种经济鱼类基因组大小的测定[J]. 华中农业大学学报 2018(03)
    • [29].新疆沙冬青基因组调查测序与基因组大小预测[J]. 植物遗传资源学报 2018(01)
    • [30].流式细胞仪测定三种鸢尾科植物基因组的大小[J]. 中药材 2018(10)

    标签:;  ;  ;  ;  ;  ;  

    鸟类基因组的进化模型
    下载Doc文档

    猜你喜欢