基于传统培养和宏基因组测序分析泗洪小龙虾不同部位的菌群多样性

基于传统培养和宏基因组测序分析泗洪小龙虾不同部位的菌群多样性

论文摘要

通过传统培养和宏基因组测序方法分析泗洪地区小龙虾整体、表面、尾肉等不同部位的菌群多样性,确定不同部位的特定污染菌组成。结果表明:小龙虾整体的初始菌数达8.4 (lg(CFU/g)),且不同部位的微生物群落有明显差异;通过宏基因组测序发现,在科水平上,黄杆菌科(Flavobacteriaceaea)是泗洪小龙虾不同部位的优势菌科,丛毛单胞菌科(Comamonadaceae)、莫拉氏菌科(Moraxellaceae)和气单胞菌科(Aeromonadaceae)分别是小龙虾整体、表面和尾肉的优势菌科;在属水平上,金黄杆菌属(Chryseobacterium)、不动杆菌属(Acinetobacter)和气单胞菌属(Aeromonas)分别是小龙虾整体、表面和尾肉的优势菌属,黄杆菌属(Flavobacterium)在3个部位中相对丰度均较高。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料与试剂
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 样品处理
  •     1.2.2 菌数测定及优势腐败菌分离鉴定
  •     1.2.3 样品总DNA提取
  •     1.2.4 MiSep测序和数据分析
  •   1.3 数据处理
  • 2 结果与分析
  •   2.1 泗洪小龙虾不同部位的初始菌相分析
  •   2.2 泗洪小龙虾不同部位优势腐败菌的分离与鉴定
  •   2.3 泗洪小龙虾不同部位的宏基因组测序结果及OTU分析
  •   2.4 泗洪小龙虾不同部位菌群的Alpha多样性指数分析
  •   2.5 泗洪小龙虾不同部位的菌群组成和聚类分析
  •     2.5.1 基于科分类水平的分析
  •     2.5.2 基于属分类水平的分析
  •   2.6 泗洪小龙虾不同部位菌群变化的热图分析
  •   2.7 泗洪小龙虾不同部位菌群的主成分分析
  • 3 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 汤纯,诸永志,吴海虹,孙芝兰,朱云龙,刘芳

    关键词: 克氏原螯虾,培养基法,宏基因组测序,微生物多样性

    来源: 肉类研究 2019年10期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑

    专业: 轻工业手工业

    单位: 扬州大学旅游烹饪学院,江苏省农业科学院农产品加工研究所

    基金: 江苏省现代农业(克氏原螯虾)产业技术体系建设专项,国家自然科学基金面上项目(31871866),“十三五”国家重点研发计划重点专项(2016YFC1300200)

    分类号: TS254.1

    页码: 44-50

    总页数: 7

    文件大小: 2499K

    下载量: 173

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