利用CRISPR/Cas9系统建立内生链霉菌SAT1的基因簇敲除体系

利用CRISPR/Cas9系统建立内生链霉菌SAT1的基因簇敲除体系

论文摘要

hyBl(hygB-like)基因簇是内生链霉菌SAT1中的次级代谢基因簇,经分析它与潮霉素B基因簇具有52%的相似性,可能在SAT1抑制栗疫菌(Cryphonectria parasitica)的过程中发挥主要作用。为了深入研究该菌的抑菌机制和hyBl基因簇的功能,以hyBl为目标,利用CRISPR/Cas9技术建立SAT1的基因簇敲除体系。在实验过程中,通过protospacer的筛选、敲除载体的构建、接合转移供体菌、Ca2+和Mg2+的选择以及接合时间等多个条件的探索,建立了SAT1的基因簇敲除体系。最终以E. coli ET12567(pUZ8002/pCRISPomyces2-CB)为供体菌,在MS培养基(含10 mmol Mg2+)上接合16-18 h,成功获得突变株SAT1△hyBl(缺失14 kb的hyBl基因簇)。突变株对栗疫菌的抑制带宽较野生株降低了77%,这说明该基因簇指导合成的次级代谢产物在抑制栗疫菌方面具有重要的功能。本研究证明了利用CRISPR/Cas9系统可以对内生链霉菌SAT1进行基因簇编辑,也为深入研究该菌的抑菌机制、基因工程法验证未知基因簇功能提供了良好的技术支撑。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •     1.1.1 菌株、质粒、试剂及引物
  •     1.1.2 培养基
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 Protospacer的筛选和sgRNA cassettes的合成
  •     1.2.2 CRISPR/Cas9敲除载体的构建
  •     1.2.3 SAT1与E.coli的属间接合转化
  •     1.2.4 突变株的鉴定及抑菌活性分析
  • 2 结果
  •   2.1 Protospacer序列的筛选、sgRNA cassettes的合成及敲除载体的构建
  •   2.2 供体菌株类型、离子和接合时间对接合效率的影响
  •   2.3 SAT1△hyBl抑菌活性分析
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 田文佳,窦桂铭,王莎,孙靖雅,马玉超

    关键词: 系统,内生链霉菌,接合,基因簇敲除

    来源: 生物技术通报 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学

    单位: 北京林业大学生物科学与技术学院,北京林业大学林学院

    基金: 中央高校基本科研业务费(2017ZY14),国家林业局公益项目(201304409),北京市科技新星项目(2011033)

    分类号: Q78

    DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2018-1080

    页码: 1-8

    总页数: 8

    文件大小: 2487K

    下载量: 416

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