锡林郭勒牧场人畜肠道微生物及土壤微生物多样性的比较分析

论文摘要

以内蒙古锡林郭勒镶黄旗呼日敦高勒嘎查牧场内牛、山羊、绵羊、马、人的粪便和土壤为研究对象,利用Pac Bio SMRT测序平台对细菌16S rRNA基因全长进行测序,运用生物信息学分析方法对人畜肠道微生物及土壤微生物多样性进行全面评估.结果发现,人畜肠道菌群均以厚壁菌门和拟杆菌门为优势菌门,而土壤以酸杆菌门和变形菌门为优势菌门.在属水平,人畜以梭菌属、拟杆菌属为优势菌属,而土壤以Blastocatella和芽孢杆菌属为优势菌属.在种水平人以Escherichia/Shigella dysenteriae和Streptococcus salivarius为优势菌种,而4种家畜的优势菌种均为Oscillibacter valericigenes和Eubacterium coprostanoligenes.土壤以Blastocatella fastidiosa和Bacillus longiquaesitum为优势菌种.比较各样品α多样性发现,人肠道微生物的多样性显著低于其他食草动物.通过主坐标和层次聚类分析发现可将6种样品分为:组1(人)、组2(马)、组3(绵羊、牛、山羊)和组4(土壤)4组.本研究对差异OTU进行比对分析探究了造成该分组的原因.因此本研究揭示了土壤、人和家畜肠道微生物组成和结构存在显著的差异,为进一步研究不同生境中微生物多样性提供数据参考.

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 王佼,王彦杰,侯强川,徐海燕,孙志宏,张和平,孙天松

关键词: 肠道微生物,土壤微生物,单分子实时测序,多样性,基因全长测序

来源: 科学通报 2019年03期

年度: 2019

分类: 基础科学,农业科技

专业: 生物学,农业基础科学,农艺学,畜牧与动物医学

单位: 内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室农业农村部奶制品加工重点实验室

基金: 国家自然科学基金(31720103911,31622043),国家现代农业产业(奶牛)技术体系建设(CARS-36),内蒙古自治区科技重大专项资助

分类号: S154.3;S852.6

页码: 337-347

总页数: 11

文件大小: 3440K

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标签：肠道微生物论文;  土壤微生物论文;  单分子实时测序论文;  多样性论文;  基因全长测序论文;