导读:本文包含了牛基因组论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因组,斯坦,密码子,牦牛,白花,近交,基因芯片。
牛基因组论文文献综述
贤明,陈燕,梁永虎,宋禹昕,牛红[1]（2018）在《利用流式细胞术测定大额牛基因组大小的研究》一文中研究指出运用流式细胞术(FCM)测定大额牛基因组大小,并比较大额牛和普通牛基因组大小,为大额牛基因组学研究及其分类地位提供科学依据。分别提取人白细胞和鸡红细胞作为待选内参,用FCM测定经碘化丙啶(PI)染色的待选内参与大额牛白细胞的混合样品,通过比较大额牛与待选内参的荧光强度和DNA含量峰值的倍数关系,筛选出测定大额牛基因组大小最佳的标准内参,以此测定计算大额牛基因组大小;并比较大额牛和普通牛基因组大小关系。研究结果表明鸡红细胞是测定大额牛基因大小最佳的标准内参;以鸡红细胞(2C=2.5 pg)为参照,大额牛细胞核DNA含量C=2.780 9 pg,基因组大小为2.719 7×10~9 bp;大额牛与普通牛测定结果比较发现,大额牛基因组比普通牛基因组小。本研究筛选出测定大额牛基因组大小的最佳标准内参,并运用流式细胞术首次测定了大额牛基因组大小,证明了大额牛基因组较普通牛基因组小。本研究的结论将为后续大额牛De novo测序组装以及基因组学相关研究提供参考,也为确定大额牛进化提供科学依据。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2018年12期）
刘合松,肖衡,李蓉,陈善元[2]（2018）在《世界家牛基因组多样性研究进展》一文中研究指出家牛作为最重要的家畜之一和反刍动物的模式生物,因其独特的生物学特性和品种多样性及其在农牧业中的重要性,一直以来都是家养动物研究的重点对象,近年来随着高通量测序技术的飞速发展,家牛全基因组研究取得了很多重要的成果和突破,为揭示家牛独特的生物学特性和家牛分子育种提供了重要的科学依据,同时对于其它哺乳动物基因组研究也具有十分重要的参考意义。本综述结合家牛基因组学和近年来家牛研究所取得的系列成果,对家牛基因组多样性的意义、进展及实践应用进行综合论述,同时对家牛基因组及基因组多样性研究中存在的不足或问题进行了总结与概括,并对家牛基因组多样性的研究进行展望。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2018年03期）
本刊辑[3]（2017）在《“中国荷斯坦牛基因组选择分子育种技术体系的建立与应用”获国家科学技术进步奖二等奖》一文中研究指出本刊辑2017年1月9日,"2016年度国家科学技术奖励大会"在人民大会堂隆重召开,党和国家领导人出席大会并为2016年度国家科学技术奖获奖代表颁奖。经学科专业评审组、评审委员会和奖励委员会叁级评审,2016年度国家科学技术奖共评选出2名最高奖获奖人、279个项目、5名外籍专家和1个国际组织。其中,畜牧兽医领(本文来源于《中国乳业》期刊2017年01期）
杨湛澄,黄河天,闫青霞,王雅春,俞英[4]（2017）在《利用高密度SNP标记分析中国荷斯坦牛基因组近交》一文中研究指出畜禽育种中传统上利用系谱信息评估群体近交程度?近年来随着高通量单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)检测成本降低,使利用基因组信息分析真实的基因组近交程度成为可能?本研究利用牛54 K SNP芯片数据统计了北京地区2107头荷斯坦牛基因组上的长纯合片段(runs of homozygosity,ROH)的频率和分布,计算了2种基因组近交系数,即染色体上ROH的长度占基因组总长度的比例(Froh)及个体所有标记基因型中纯合子所占比例,即基因组纯合度(Fhom),进而分析了两种基因组近交系数之间的相关性以及基因组近交与系谱近交系数之间的相关性?结果表明,共检测到44 676个ROH片段,其长度主要分布在1~10 Mb之间?不同长度的ROH散布于个体基因组内,短ROH较长ROH更为常见?ROH在染色体上并非均匀分布,ROH频率最高的区域为10号染色体中部?两种基因组近交系数之间相关性很高(91%以上),但基因组近交与系谱近交之间的相关性较低(低于50%)?系谱完整性是影响基因组近交与系谱近交结果一致的重要因素,基因组近交系数能够反映个体真实的近交,本研究为评估群体近交水平提供了有力工具?(本文来源于《遗传》期刊2017年01期）
奚玉莲[5]（2016）在《秦川牛基因组遗传变异及其与脊椎数的关系研究》一文中研究指出多脊椎性状是存在于家畜上的有益突变。经调查,首次发现秦川牛存在多脊椎性状。为分析秦川牛脊椎数变异的候选基因,本研究利用测序的方法对12个脊椎发育候选基因(NR6A1、NR5A1、GDF11、ActRⅡB、VRTN、Hoxb9、Hoxc9、Hoxd9、Hoxa10、Hoxd10、Hoxa11和Hoxc11)的外显子区进行多态性分析。本研究还利用牛77 k基因芯片对秦川牛的多脊椎性状进行全基因组关联分析;为揭示秦川牛遗传变异,本研究利用77k芯片数据,结合已有的世界牛品种50k的芯片数据进行主成分分析(principal component analysis,PCA)和祖先估计;并通过PennCNV软件对秦川牛进行拷贝数变异分析,并对拷贝数变异区域(CNVRs)进行基因注释和功能富集分析,获得的主要结果如下:(1)分别在NR6A1、NR5A1、VRTN和Hoxd9基因上发现1、2、2和1个SNP突变。Hoxd9基因的突变位于非编码区;VRTN基因的2个突变在CDS区但未引起氨基酸改变,属于同义突变;NR6A1和NR5A1基因的突变位于CDS区,且均引起对应氨基酸改变,属于错义突变。但这些突变与牛脊椎数变异均无明显相关性。(2)全基因组关联分析显示VRTN基因可能与牛胸椎数差异有关。最显着的SNP位于牛10号染色体86060139 bp处,距该SNP位点最近的基因是VRTN基因,该基因已经被证实与猪的多胸椎性状相关。7号染色体上存在长连锁不平衡区域(LD),可能与胸椎-腰椎的选择有关;16号染色体上存在与牛脊椎总数相关的区域。(3)PCA分析显示秦川牛群体差异较大,具有丰富的遗传多样性。秦川牛与土耳其牛、日韩牛和欧洲牛亲缘关系最近,与印度牛和非洲牛相差较大。祖先估计结果显示秦川牛具有普通牛和瘤牛血统,属于混合起源。(4)共发现255个CNVRs,其中包括215个缺失事件(loss),31个获得事件(gain)和9个缺失-获得事件(both)。这些区域总长度约184 Mb,占牛常染色体区域的7.3%。(5)在155个CNVRs中共发现1503个基因,这些基因主要涉及46个生物学功能。在87个CNVRs中共发现127个QTLs,这些QTLs与肉牛的经济性状有关。(本文来源于《西北农林科技大学》期刊2016-04-01）
刘永峰,库婷,高俊岭,杨兴斌[6]（2015）在《超低温冻藏牛奶中牛基因组DNA的提取方法》一文中研究指出采用不同的解冻方法以及牛奶体细胞分离与SDS苯酚法相结合的手段,分离提取-80℃冻藏牛奶中牛基因组DNA,利用超微量核酸分析仪和琼脂糖凝胶电泳法分别对DNA浓度、纯度及分子量大小进行检测,采用PCR技术扩增牛特异性基因序列片段进行DNA质量鉴定。结果表明,"两步法"解冻提取的牛基因组DNA的质量优于"一步法"和"叁步法",且该方法所提取的DNA浓度为(52.46±2.40)μg/mL,DNA纯度为1.85±0.80,条带较清晰;PCR扩增证实这些DNA可以成功扩增出729bp的牛特异性基因序列片段。本研究成功优化了牛奶中DNA的分离提取方法,筛选出了冻藏牛奶的适宜解冻方法,建立了一种新的超低温冻藏牛奶中牛基因组DNA提取方法。(本文来源于《陕西师范大学学报(自然科学版)》期刊2015年06期）
宋乔乔,柴志欣,钟金城[7]（2015）在《牦牛和普通牛基因组的密码子使用分析》一文中研究指出遗传密码和密码子的发现加深了人们对生命本质的认识,促进了分子生物学、分子遗传学等学科的飞速发展。为了解牦牛和普通牛的基因组、基因和密码子使用的特性,本研究以牦牛和普通牛的全基因组数据为材料,首次对牦牛、普通牛基因组的密码子使用特征和影响因素以及牛亚科动物线粒体基因的密码子偏好性进行了分析研究。结果表明:1、牦牛基因组编码区的G+C含量为0.53±0.08,GC3s含量为0.59±0.16;牦牛基因的密码子偏好性更多地受到碱基突变的影响,少数基因的密码子偏好性受到选择的影响;在牦牛基因组中有18个主要偏爱密码子和5个高频密码子;在牦牛与普通牛、人、小鼠、果蝇、斑马鱼、酵母、水稻、拟南芥和大肠杆菌的1/1000比值中大于等于2或小于等于0.5的密码子分别有0、0、1、8、0、20、3、10、12个。2、普通牛基因组编码区的G+C含量为0.53±0.09,GC3s含量为0.60±O.16:普通牛基因组密码子偏好性更多地受到碱基突变的影响,少数基因的密码子偏好性受到选择的影响:在普通牛基因组中有20个主要偏爱密码子和5个高频密码子。第一轴(Axis1)是解释基因密码子使用偏好性的主要参考轴,对应分析表明普通牛的Axis1轴与G+C含量、G-C3s、T3s、C3s、A3s、G3s、ENC、CAI、Seqlen有较强的相关性,与Gravy、Aromo的相关性较弱;CAI值与ENC值呈极显着负相关,与G+C含量、GC3s呈极显着正相关,与G+C含量、GC3s呈极显着负相关;长度为1000~2000bp的蛋白编码基因表达水平较高,密码子偏好性较强;长度为300~1000bp或大于2000bp的蛋白编码基因表达水平较低,密码子偏好性也较低。3、牛亚科动物线粒体基因的ENC值都小于40.50,显示出明显的密码子偏好性。CUA、GUA、UCA等13个密码子的RSCU值均大于1,为牛亚科动物使用相对较多的密码子;在聚类分析中,基于线粒体基因密码子偏好性的聚类结果与基于线粒体基因序列的聚类结果基本一致;聚类分析表明美洲野牛与牦牛聚为一类,爪哇野牛、普通牛、原始牛和瘤牛聚为一类,这与以往的动物学分类结果一致。综上所述,由于受基因突变、选择等多种因素的影响,牦牛、普通牛的基因均有一定的密码子使用偏好性,这些研究结果在今后研究牦牛、普通牛的基因组结构和基因功能,以及与适应性的分析中均值得重视,为进一步的研究提供了基础。(本文来源于《遗传多样性：前沿与挑战——中国的遗传学研究（2013-2015）——2015中国遗传学会大会论文摘要汇编》期刊2015-08-14）
宋乔乔[8]（2015）在《牦牛和普通牛基因组的密码子使用分析》一文中研究指出遗传密码和密码子的发现加深了人们对生命本质的认识,促进了分子生物学、分子遗传学等学科的飞速发展。为了解牦牛和普通牛的基因组、基因和密码子使用的特性,本研究以牦牛和普通牛的全基因组数据为材料,首次对牦牛、普通牛基因组的密码子使用特征和影响因素以及牛亚科动物线粒体基因的密码子偏好性进行了分析研究。结果表明:1、牦牛基因组编码区的G+C含量为0.53±0.08,GC3s含量为0.59±0.16;牦牛基因的密码子偏好性更多地受到碱基突变的影响,少数基因的密码子偏好性受到选择的影响;在牦牛基因组中有18个主要偏爱密码子和5个高频密码子;在牦牛与普通牛、人、小鼠、果蝇、斑马鱼、酵母、水稻、拟南芥和大肠杆菌的1/1000比值中大于等于2或小于等于0.5的密码子分别有0、0、1、8、0、20、3、10、12个。2、普通牛基因组编码区的G+C含量为0.53±0.09,GC3s含量为0.60±0.16;普通牛基因组密码子偏好性更多地受到碱基突变的影响,少数基因的密码子偏好性受到选择的影响;在普通牛基因组中有20个主要偏爱密码子和5个高频密码子。第一轴(Axis1)是解释基因密码子使用偏好性的主要参考轴,对应分析表明普通牛的Axis1轴与G+C含量、GC3s、T3s、C3s、A3s、G3s、ENC、CAI、Seqlen有较强的相关性,与Gravy、Aromo的相关性较弱;CAI值与ENC值呈极显着负相关,与G+C含量、GC3s呈极显着正相关,与G+C含量、GC3s呈极显着负相关;长度为1000~2000bp的蛋白编码基因表达水平较高,密码子偏好性较强;长度为300~1000bp或大于2000bp的蛋白编码基因表达水平较低,密码子偏好性也较低。3、牛亚科动物线粒体基因的ENC值都小于40.50,显示出明显的密码子偏好性。CUA、GUA、UCA等13个密码子的RSCU值均大于1,为牛亚科动物使用相对较多的密码子;在聚类分析中,基于线粒体基因密码子偏好性的聚类结果与基于线粒体基因序列的聚类结果基本一致;聚类分析表明美洲野牛与牦牛聚为一类,爪哇野牛、普通牛、原始牛和瘤牛聚为一类,这与以往的动物学分类结果一致。综上所述,由于受基因突变、选择等多种因素的影响,牦牛、普通牛的基因均有一定的密码子使用偏好性,这些研究结果在今后研究牦牛、普通牛的基因组结构和基因功能,以及与适应性的分析中均值得重视,为进一步的研究提供了基础。(本文来源于《西南民族大学》期刊2015-03-30）
丁向东,张沅,张勤[9]（2014）在《中国荷斯坦牛基因组选择进展》一文中研究指出当前,利用覆盖整个基因组的高密度SNP标记进行基因组选择正在带来动植物育种的革命,在奶牛、猪、鸡、作物、林木和水产生物开始大量研究和应用,是动物育种中继表型选择、育种值选择之后,具有重大应用前景的分子育种方式。我国自2008年开始在主要奶牛品种中国荷斯坦牛中开展基因组选择研究,并于2012年正式应用于中国荷斯坦牛基因组遗传评估,作为我国奶牛遗传评估的一个新的有力工具。本文主要介绍我国荷斯坦牛基因组选择研究和应用进展,并对相关问题进行(本文来源于《第六届全国动植物数量遗传学学术研讨会论文摘要集》期刊2014-10-09）
曾国权,王德莲,陈汉金,陈景亮[10]（2014）在《牛肉干中牛基因组DNA提取方法的比较研究》一文中研究指出为得到一种快速、稳定、准确、优质的牛肉干DNA的提取方法,本研究比较了SDS法、改良CTAB法、酚-氯仿抽提法以及4种试剂盒提取法的提取效果。通过比较DNA的提取质量、提取效率,并对提取的DNA进行PCR扩增分析。DNA提取结果表明,7种提取方法均能从牛肉干中提取出DNA,其中采用SDS法、酚-氯仿法、试剂盒1法和试剂盒4法所提取的DNA质量较高,A260/A280比值在1.7~1.9之间。试剂盒3法提取所花的时间最少,DNA得率最高,但DNA的纯度最低。PCR扩增结果表明,7种方法所提取的DNA均能满足后续PCR扩增实验的要求。实验室可根据具体的实际情况选择使用DNA提取方法。(本文来源于《生物技术世界》期刊2014年02期）
牛基因组论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
家牛作为最重要的家畜之一和反刍动物的模式生物,因其独特的生物学特性和品种多样性及其在农牧业中的重要性,一直以来都是家养动物研究的重点对象,近年来随着高通量测序技术的飞速发展,家牛全基因组研究取得了很多重要的成果和突破,为揭示家牛独特的生物学特性和家牛分子育种提供了重要的科学依据,同时对于其它哺乳动物基因组研究也具有十分重要的参考意义。本综述结合家牛基因组学和近年来家牛研究所取得的系列成果,对家牛基因组多样性的意义、进展及实践应用进行综合论述,同时对家牛基因组及基因组多样性研究中存在的不足或问题进行了总结与概括,并对家牛基因组多样性的研究进行展望。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
牛基因组论文参考文献
[1].贤明,陈燕,梁永虎,宋禹昕,牛红.利用流式细胞术测定大额牛基因组大小的研究[J].基因组学与应用生物学.2018
[2].刘合松,肖衡,李蓉,陈善元.世界家牛基因组多样性研究进展[J].基因组学与应用生物学.2018
[3].本刊辑.“中国荷斯坦牛基因组选择分子育种技术体系的建立与应用”获国家科学技术进步奖二等奖[J].中国乳业.2017
[4].杨湛澄,黄河天,闫青霞,王雅春,俞英.利用高密度SNP标记分析中国荷斯坦牛基因组近交[J].遗传.2017
[5].奚玉莲.秦川牛基因组遗传变异及其与脊椎数的关系研究[D].西北农林科技大学.2016
[6].刘永峰,库婷,高俊岭,杨兴斌.超低温冻藏牛奶中牛基因组DNA的提取方法[J].陕西师范大学学报(自然科学版).2015
[7].宋乔乔,柴志欣,钟金城.牦牛和普通牛基因组的密码子使用分析[C].遗传多样性：前沿与挑战——中国的遗传学研究（2013-2015）——2015中国遗传学会大会论文摘要汇编.2015
[8].宋乔乔.牦牛和普通牛基因组的密码子使用分析[D].西南民族大学.2015
[9].丁向东,张沅,张勤.中国荷斯坦牛基因组选择进展[C].第六届全国动植物数量遗传学学术研讨会论文摘要集.2014
[10].曾国权,王德莲,陈汉金,陈景亮.牛肉干中牛基因组DNA提取方法的比较研究[J].生物技术世界.2014
论文知识图
