枯草芽孢杆菌α-乙酰乳酸脱羧酶基因(alsD)的克隆和生物信息学分析

枯草芽孢杆菌α-乙酰乳酸脱羧酶基因(alsD)的克隆和生物信息学分析

论文摘要

乙酰乳酸脱羧酶是2,3-丁二醇生物合成途径的关键酶之一,利用生物信息学方法对α-乙酰乳酸脱羧酶基因(alsD)进行分析。根据GenBank中α-乙酰乳酸脱羧酶基因(alsD)的基因序列设计引物,以枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)CICC10026基因组DNA为模板,通过PCR扩增得到Bacillus subtilis CICC10026基因片段alsD。对该片段进行序列测定,利用生物信息学分析软件对该序列进行同源性分析、二级结构和功能性分析及3D结构预测等。结果表明:获得的alsD片段为768 bp,未发生碱基突变,该片段为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis) CICC10026的α-乙酰乳酸脱羧酶基因(alsD)的基因序列。本研究结果为构建产2,3-丁二醇的工程菌株奠定了理论基础。

论文目录

  • 0 引言
  • 1 材料与方法
  •   1.1 试验材料
  •     1.1.1 菌种及质粒
  •     1.1.2 主要培养基
  •     1.1.3 工具酶和试剂盒
  •   1.2 试验方法
  •     1.2.1 引物序列
  •     1.2.2 Bacillus subtilis CICC10026基因组DNA的提取及alsD基因的克隆及测序
  •     1.2.3 生物信息学分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 Bacillus subtilis CICC10026基因组DNA的提取
  •   2.2 alsD基因的克隆及鉴定
  •     2.2.1 alsD基因的克隆
  •     2.2.2 alsD基因的筛选与鉴定
  •   2.3 alsD基因生物信息学分析
  •     2.3.1 序列分析
  •     2.3.2 二级结构和功能性分析
  • 3 结论与讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 刘文娟,黄守锋,葛菁萍

    关键词: 乙酰乳酸脱羧酶,生物信息学分析

    来源: 中国农学通报 2019年21期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 黑龙江大学生命科学学院微生物省高校重点实验室

    基金: 国家自然科学基金“从2,3-丁二醇代谢角度构建工程微生物群体及其生态学机制研究”(31570492),黑龙江省高等学校科技创新团队“农业微生物发酵技术”(2012td009)

    分类号: Q78

    页码: 96-102

    总页数: 7

    文件大小: 1921K

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