论文摘要
目的:肺癌是一种最常见的恶性肿瘤疾病,其发病率和致死率在全球最高,超过全部恶性肿瘤发病率十分之一。其中,2018年全世界恶性肿瘤发病率中肺癌发病率排在第一位。肺癌严重影响人类生活与健康。现在,非小细胞肺癌的治疗手段诊断方式如X线和CT逐渐增多,但是在肺癌早期诊断方面仍存在较大不足,很多肺癌患者一旦发现就已经是中晚期。筛选有效的肺癌的生物标记物进行肺癌的早期诊断和预测患者预后是十分必要的,甚至这些异常表达标记物可以作为新药研究与开发的作用靶点。PITX基因家族与哺乳动物胚胎早期发育有关,其中包含三个同源基因PITX1、PITX2、PITX3。在癌症中,PITX基因家族异常表达,例如:PITX1的异常表达与食管鳞状细胞癌,皮肤恶性黑色素瘤,肝细胞癌和肺癌有关。PITX2与乳腺癌,结肠癌,前列腺癌等癌症有关联。PITX3的异常表达作为预测前列腺癌患者的复发情况的指标。一些研究报道了PITX基因家族的DNA甲基化与生存时间之间的关系。虽然PITX1在肺癌中有所报道,但是非小细胞肺癌中PITX1表达与总体生存之间的关系尚不清楚,PITX1的甲基化水平与总体生存之间的关系也尚不明确。研究方法:利用TCGA-LUNG数据库的数据和GEO数据库的数据进行分析,得到PITX家族在肺癌中的差异表达,通过UCSC Xena Browser对肺腺癌和肺鳞癌患者的预后进行分析。分析PITX1在肺腺癌不同亚型中的差异表达,并且分析了不同亚型患者的预后情况。之后分析了PITX1的甲基化水平和患者预后的关系。最后,GSEA分析了PITX1可能富集的通路。结果:1.与正常肺组织相比,PITX基因家族在非小细胞肺癌中显著上调（P<0.01）。在肺腺癌患者中PITX1和PITX2在癌组织中显著性高表达（P<0.0001）,PITX3表达在癌组织和正常组织中未见显著差异（P=0.1943）。与正常肺组织相比,在肺鳞癌组织中PITX基因家族表达上调（P<0.0001）。2.在肺腺癌患者中,PITX1高表达与2年（P=0.004754）,5年（P=0.01469）和10年（P=0.02935）内较差的总体生存显著相关,但在肺鳞状细胞癌患者中则未见明显差别。3.PITX1的表达增加与性别,TNM分期Ⅱ-Ⅳ期,T分期2-4期和淋巴结转移相关。4.PITX1在bronchioid亚型中表达最低,而在squamoid和magnoid亚型中表达最高。5.PITX1的高DNA甲基化预示肺腺癌患者的总体生存较差。6.GSEA显示PITX1高表达组中显著富集在炎症反应,NFκB介导的TNFα信号传导,TGFβ信号传导,IL6-JAK-STAT3信号传导和干扰素Gamma反应的通路上。结论:1.PITX1可作为肺腺癌患者早期判断和预后预测的潜在生物标志物。2.PITX1的表达与炎性和免疫反应通路相关。
论文目录
文章来源
类型: 硕士论文
作者: 宋昕樾
导师: 赵琳
关键词: 总体生存时间,甲基化,肺腺癌
来源: 中国医科大学
年度: 2019
分类: 基础科学,医药卫生科技
专业: 生物学,肿瘤学,生物医学工程
单位: 中国医科大学
分类号: R734.2;Q811.4
DOI: 10.27652/d.cnki.gzyku.2019.000595
总页数: 44
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