导读:本文包含了非编码区序列论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:序列,病毒,肠道,手足,基因,蛋白,豚鼠。
非编码区序列论文文献综述
韩绪春,何锡栋,黄宝钦,罗忠宝,吴晓平[1]（2015）在《鸡传染性支气管炎病毒HQ P_(10)毒株非编码区序列分析》一文中研究指出研究旨在探讨鸡传染性支气管炎病毒(IBV)的遗传变异情况,为鸡传染性支气管炎的防控提供基础数据。通过对IBV HQ毒株第10代鸡胚培养病毒的5′端非编码区(5′UTR)和3′UTR序列进行c DNA末端快速扩增(RACE)和序列分析。结果表明:HQ P10的5′UTR长度为525 nt,相较于Beaudette毒株,序列中发生4个位点的碱基缺失突变,1个位点的碱基插入突变,导致其SL1-SL4茎环结构有所改变,与参考毒株的相应序列同源性在94%~99%之间;而3′UTR长度为363 nt,与参考毒株相应序列的同源性在45%~98%之间,与H120的同源性在93.3%,而与H52株、M41株的同源性则较低,分别为46.4%和45.9%。UTR对病毒RNA的合成具有重要作用,HQ P10毒株UTR中的突变对病毒复制效率的影响还有待进一步研究。(本文来源于《中国家禽》期刊2015年08期）
封瑞,刘彦,胡慧媛,郭凤,赵美眯[2]（2015）在《豚鼠钙调蛋白2基因编码区及3'端非编码区序列分析》一文中研究指出目的比较分析豚鼠CaM2基因编码区及3'端非编码区序列,获得丰富的豚鼠CaM2基因生物遗传学信息。方法基因测序获得豚鼠CaM2基因编码区及3'端非编码区序列,通过genebank数据库获得不同种属CaM核苷酸序列,采用DNASTAR软件对CaM2不同部位序列进行多序列的比较分析。结果豚鼠CaM2基因编码区与人、小鼠和大鼠的同源率分别为96.7%、91.4%和90.5%,与人、小鼠、大鼠的CaMl和CaM3基因编码区序列的同源率在80%-85%之间。豚鼠CaM2基因3'端非编码区序列与人、小鼠和大鼠的同源率分别为94.2%、93.3%和90.0%,与人、小鼠、大鼠的CaM3基因3'端非编码区序列的同源率分别为26.8%、29.2%和25.9%,与CaMl的同源率在25%-63%之间。结论豚鼠CaM2基因编码区具有种属和亚型较高同源性特征,而CaM2基因3'端非编码区虽在不同种属中具有很高同源性,但在不同种属与其它亚型比对中同源性较低。(本文来源于《解剖科学进展》期刊2015年01期）
封瑞,刘彦,杨磊,胡慧媛,郭凤[3]（2015）在《豚鼠钙调蛋白2基因编码区及3′端非编码区序列克隆》一文中研究指出目的克隆豚鼠钙调蛋白2(Ca M2)基因编码区及3′端非编码区,为豚鼠Ca M基因功能等研究提供遗传学信息。方法以豚鼠心肌组织作为实验材料提取RNA,通过RT-PCR和3′-RACE PCR的方法扩增Ca M2的编码区和3′端非编码区序列,应用基因工程技术插入克隆载体构建重组质粒后基因测序及分析。结果克隆出豚鼠Ca M2基因编码区450 bp序列和3′端非编码区660 bp序列。分析编码区序列所编码的氨基酸序列与其他种属其他亚型完全一致。而3′端非编码区与其他亚型的同源性较低。结论成功获得了豚鼠Ca M2基因编码区和3′端非编码区序列,为进一步研究Ca M2的基因功能及其在相关疾病中的作用奠定基础。(本文来源于《中国医科大学学报》期刊2015年02期）
陶艳琳,赵雪涛,沈小婷,王雅新[4]（2014）在《2012年上海市徐汇区人肠道病毒5'非编码区序列分析》一文中研究指出目的通过分析HEV的5'-UTR基因序列,确定上海市徐汇区手足口病(HFMD)病例中HEV的型别。方法采集2012年HFMD患儿标本,采用Real time-RT-PCR分别检测HEV、EV71和CoxA16核酸,初步鉴定其型别。从中挑选未能分型的HEV毒株扩增其5'-UTR进行核苷酸序列测定,运用DNAStar和MEGA5.2软件进行序列分析。结果26例标本均为HEV阳性:10例EV71阳性,5例CoxA16阳性,11例其他型HEV阳性。扩增11例未能分型的HEV标本的5'-UTR序列,9例测序成功,通过序列比对确定病毒型别:CoxA16 8例,CoxA10 1例。结论上海市徐汇区HFMD患儿的主要病原是EV71和CoxA16,也存在着其他型别的HEV,如CoxA10,应加强HEV基因亚型的分布及流行特点的监测。(本文来源于《中国卫生检验杂志》期刊2014年12期）
李想,高超,李芹,王建忠,杨闽楠[5]（2014）在《新城疫病毒3′及5′末端非编码区序列的反向遗传研究》一文中研究指出以新城疫病毒(NDV)LaSota株感染性克隆PCI-La为平台进行反向遗传操作,并利用PCR技术将其3′端和5′端非编码区分别替换为鹅源NDV NA-1株3′端和5′端非编码区,以及3′端和5′端非编码区同时替换,通过生物学软件DNAStar对替换后的序列进行比对分析,所替换的序列未出现基因突变现象,证明非编码区替换成功,从而分别获得3株突变全长感染性克隆pCI-rL-NL、pCI-rL-NT、pCI-rL-NL-NT;将所获得的这3株突变感染性克隆分别与辅助质粒pCI-NP、pCI-P、pCI-L共转染BSR细胞,进行重组病毒的拯救。结果显示,pCI-rL-NL、pCI-rL-NT两种质粒表达系统均可拯救到有感染活性的病毒粒子,其HA效价为24,23,HI试验及间接免疫荧光试验结果均为阳性,并且通过电镜观察到具有典型副黏病毒科特征的、有囊膜的NDV颗粒。本试验成功构建了2株NDV LaSota突变株的反向遗传操作系统,为后期进行重组NDV致病性的研究奠定基础,也为进一步研究筛选新型分子标记疫苗、病毒活载体疫苗和抗病毒药物提供了可能。(本文来源于《中国兽医学报》期刊2014年05期）
安静,杨晋翔,贺梅娟,彭继升,魏玥[6]（2014）在《大鼠Pten和Runx3基因5'端非编码区序列的生物信息学分析》一文中研究指出目的分析大鼠Pten和Runx3基因5'端非编码区(5'-UTR)序列的CpG岛、启动子及其转录因子结合位点。方法通过NCBI获得大鼠Pten和Runx3基因全长序列及转录本,采用Blast中的可读框比对外显子、内显子及上游5'-UTR信息,所获得ATG上游2 kb、下游1 kb序列分别应用CpG island searcher软件、CpGPlot工具、Methprimer2.0工具预测CpG岛,NNPP工具、Promoter scan工具、FirstEF工具预测启动子,Matlspector、Match、Consite预测启动子区域转录结合位点。结果大鼠Pten基因和Runx3基因属于CpG岛关联基因,启动子可能分别位于-1 253~-684 bp和-690~-121 bp,Pten和Runx3基因在109和94种转录因子结合位点中,被≥2种软件共同预测有结合位点的转录因子分别有6和9种。结论初步获得大鼠Pten和Runx3基因5'-UTR序列的生物学信息,为进一步基因调控甲基化实验验证奠定了基础。(本文来源于《山东医药》期刊2014年12期）
李哲,周密,李凡[7]（2013）在《柯萨奇B3病毒5'非编码区基因序列及遗传进化分析》一文中研究指出目的:研究柯萨奇B3病毒(CVB3)/MKP株5'非编码区基因序列及变异性,探讨其致病性的分子基础。方法:用Hela细胞培养柯萨奇B3病毒,RT-PCR法扩增5'非编码区,测序后进行同源性、变异性及遗传进化分析。结果:CVB3/MKP株5'非编码区基因全长742个核苷酸,该株病毒与CVB3/20、CVB3/28、CVB3/0、CVB3/Nancy、CVB3/AS、CVB3/Woodruff(CVB3/W)及CVB3(CXA3CG)株5'非编码区同源性在91.9%～99.6%之间,而与CVB3/GA和CVB3/CO两种病毒株同源性分别为83.6%和83.3%。CVB3/MKP株的5'非编码区序列与既致胰腺炎又致心肌炎的病毒株共同聚簇,而与非致病毒株和仅致胰腺炎的病毒株距离较远。结论:CVB3/MKP株5'非编码区基因序列可能与病毒的毒力表型有关。(本文来源于《中国妇幼保健》期刊2013年34期）
郑丹书,张君毅,郭巧生[8]（2013）在《半夏及近缘种叶绿体非编码区序列分析》一文中研究指出目的通过测定半夏及近缘种的DNA叶绿体的非编码区序列,为半夏的分子鉴别和遗传多样性研究提供依据。方法在我国半夏主要分布区收集到43份半夏及滴水珠和虎掌半夏2个近缘种,采用PCR法克隆叶片基因组DNA中psbK-psbI和atpF-atpH两段序列,借助生物信息学软件进行比对分析。结果半夏atpF-atpH序列长为337～342bp,较为保守,仅含变异位点7个,其中信息位点1个,遗传距离为0～0.024。半夏psbK-psbI序列长为432～435bp,变异位点37个,其中信息位点17个,遗传距离为0～0.069。聚类分析结果均显示出与表型以及地理居群的不一致。结论 psbK-psbI序列较atpF-atpH有更好的鉴别能力,在半夏种内具有较丰富的变异位点。(本文来源于《中草药》期刊2013年07期）
高玉龙,贠炳岭,秦立廷,潘伟,王永强[9]（2012）在《蛋鸡J亚群禽白血病病毒3′非编码区序列特征分析》一文中研究指出蛋用型鸡虽在试验条件下可以感染ALV-J,但自然感染时很少引起发病。然而,近年来在中国蛋鸡群中ALV-J发病严重,本研究对2008年以来ALV-J蛋鸡分离株的3′非编码区(3′UTR)进行了系统的分析。结果表明,89.5%(17/19)的ALV-J蛋鸡分离株的3′UTR出现了205bp的缺失,94.7%(16/17)ALV-J蛋鸡分离株保留了完整的E元件。84.2%(16/19)的ALV-J蛋鸡分离株的U3区序列与肉鸡分离株的相似性低于92.5%,所有转录调控元件高度保守。ALV-J蛋鸡分离株的E元件和U3区均出现了多个碱基的突变。这些结果表明,ALV-J蛋鸡分离株的E元件和U3区正在迅速的演化,明显不同于肉鸡分离株的序列特征。这些发现有助于更好地了解ALV-J引起蛋鸡群发病的致病机理。(本文来源于《畜牧兽医学报》期刊2012年11期）
马元鹏,段广才,范张洁,张卫东,郗园林[10]（2012）在《2010年郑州肠道病毒71型VP1基因和5’非编码区核酸序列分析》一文中研究指出目的比较不同临床结局EV71毒株的VP1和5’UTR序列,确定2010年郑州EV71的型别。方法对采集自2010年3～5月的46个手足口病患儿的粪便标本进行处理,然后提取病毒的RNA,获得部分EV71株的VP1和5’UTR核酸序列,用MEGA5对序列信息进行分析。结果共检测EV71阳性标本30例;其中9个毒株的VP1核酸序列一致率在97.82%以上,氨基酸序列一致率为100%;这9个毒株的5’UTR核酸序列一致率在96.94%以上;经过系统进化分析发现2010年郑州EV71分离株属于C4a亚型;根据EV715’UTR核酸序列分型的结果与根据VP1核酸序列分型的结果一致。结论 2010年郑州EV71分离株属于C4a亚型,各毒株间VP1及5’UTR核酸序列的同源性较高;根据EV715’UTR核酸序列分型的结果与根据VP1核酸序列分型的结果一致。(本文来源于《现代预防医学》期刊2012年21期）
非编码区序列论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的比较分析豚鼠CaM2基因编码区及3'端非编码区序列,获得丰富的豚鼠CaM2基因生物遗传学信息。方法基因测序获得豚鼠CaM2基因编码区及3'端非编码区序列,通过genebank数据库获得不同种属CaM核苷酸序列,采用DNASTAR软件对CaM2不同部位序列进行多序列的比较分析。结果豚鼠CaM2基因编码区与人、小鼠和大鼠的同源率分别为96.7%、91.4%和90.5%,与人、小鼠、大鼠的CaMl和CaM3基因编码区序列的同源率在80%-85%之间。豚鼠CaM2基因3'端非编码区序列与人、小鼠和大鼠的同源率分别为94.2%、93.3%和90.0%,与人、小鼠、大鼠的CaM3基因3'端非编码区序列的同源率分别为26.8%、29.2%和25.9%,与CaMl的同源率在25%-63%之间。结论豚鼠CaM2基因编码区具有种属和亚型较高同源性特征,而CaM2基因3'端非编码区虽在不同种属中具有很高同源性,但在不同种属与其它亚型比对中同源性较低。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
非编码区序列论文参考文献
[1].韩绪春,何锡栋,黄宝钦,罗忠宝,吴晓平.鸡传染性支气管炎病毒HQP_(10)毒株非编码区序列分析[J].中国家禽.2015
[2].封瑞,刘彦,胡慧媛,郭凤,赵美眯.豚鼠钙调蛋白2基因编码区及3'端非编码区序列分析[J].解剖科学进展.2015
[3].封瑞,刘彦,杨磊,胡慧媛,郭凤.豚鼠钙调蛋白2基因编码区及3′端非编码区序列克隆[J].中国医科大学学报.2015
[4].陶艳琳,赵雪涛,沈小婷,王雅新.2012年上海市徐汇区人肠道病毒5'非编码区序列分析[J].中国卫生检验杂志.2014
[5].李想,高超,李芹,王建忠,杨闽楠.新城疫病毒3′及5′末端非编码区序列的反向遗传研究[J].中国兽医学报.2014
[6].安静,杨晋翔,贺梅娟,彭继升,魏玥.大鼠Pten和Runx3基因5'端非编码区序列的生物信息学分析[J].山东医药.2014
[7].李哲,周密,李凡.柯萨奇B3病毒5'非编码区基因序列及遗传进化分析[J].中国妇幼保健.2013
[8].郑丹书,张君毅,郭巧生.半夏及近缘种叶绿体非编码区序列分析[J].中草药.2013
[9].高玉龙,贠炳岭,秦立廷,潘伟,王永强.蛋鸡J亚群禽白血病病毒3′非编码区序列特征分析[J].畜牧兽医学报.2012
[10].马元鹏,段广才,范张洁,张卫东,郗园林.2010年郑州肠道病毒71型VP1基因和5’非编码区核酸序列分析[J].现代预防医学.2012
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