导读:本文包含了全基因组测序论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因组,霍尔,东北地区,宏基,基因,叶斑病,叶绿体。
全基因组测序论文文献综述
李明曲[1]（2019）在《全基因组测序技术在抗脓毒症感染中的精准应用及集束化护理干预》一文中研究指出[目的]探讨全基因组测序技术在抗脓毒症感染中的精准应用,观察集束化护理干预效果。[方法]选择2017年1月—2018年6月医院重症监护室(ICU)收治的90例脓毒症病人作为研究对象,并将其随机分为干预组和对照组,每组各45例。对照组采用常规护理,干预组给予全基因测序技术及集束化护理。比较两组病人白细胞计数(WBC)、降钙素原(PCT)、C-反应蛋白(CRP)等炎性反应指标及动脉血乳酸(LAC)等组织灌注指标。比较两组病人序贯器官衰竭(sequential organ failure assessment,SOFA)评分及急性生理学与慢性健康状况评分系统Ⅱ(APACHEⅡ)评分。比较两组病人ICU住院时间。[结果]入住ICU第1天,两组病人WBC、PCT、CRP及LAC等指标比较差异无统计学意义(P>0.05)。入住ICU第3天及第7天,干预组病人WBC、PCT、CRP及LAC等各项指标比对照组均明显好转(P<0.05)。入住ICU第1天,两组病人APACHEⅡ评分、SOFA评分比较差异无统计学意义(P>0.05)。入住ICU第3天,干预组病人APACHEⅡ评分、SOFA评分与对照组比较均明显降低(P<0.05)。干预组病人ICU住院时间比对照组明显缩短(P<0.05)。[结论]全基因组测序技术能够精准诊断脓毒症,为科学制定治疗护理方案提供参考。集束化护理为脓毒症病人提供了优化的护理服务,有效地控制感染,加速病人康复。(本文来源于《全科护理》期刊2019年33期）
[2]（2019）在《我国完成小麦A基因组测序和精细图谱绘制》一文中研究指出中国科学院遗传与发育生物学研究所的科研团队完成了小麦A基因组的测序和染色体精细图谱的绘制,全面揭示了小麦A基因组的结构和表达特征,对深入和系统研究麦类植物的结构与功能基因组学以及进一步推动栽培小麦的遗传改良具有重要的理论意义和实用价值。科研人员指出,小麦A基因组测序和精细图谱(本文来源于《教学考试》期刊2019年51期）
杨光,孙兰英,段亚东,周双,张鹍[3]（2019）在《基于简化基因组测序的树莓(Rubus corchorifolius)遗传分析》一文中研究指出为了比较不同树莓种间的亲缘关系远近,分析群体的遗传进化关系,开发特异性SNP标记。本试验选用23份栽培种树莓利用简化基因组测序技术SLAF-seq测序,以黑树莓(Rubus occidentalis)基因组为参考基因组进行酶切预测,对照选择粳稻(Oryza sativa spp. japonica)品种日本晴的测序数据进行比对分析。本研究共获得59.93 Mb的读长数据,读长范围在1 960 847～5 046 748之间,对照数据的双端比对效率为95.60%,酶切效率为93.52%,测序质量值Q30平均为95.07%,所有样品GC含量均值为39.16%,共获得425 402个SLAF标签,其中多态性的SLAF标签共有121 610个。获得749 811个有效单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNP),利用这些SNP对23份树莓材料完成系统进化树,群体的PCA分析,从群体结构分析结果发现这23份树莓都来源于同一祖先,只是在生长发育过程中发生了遗传分化。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年22期）
邓雯文,李才武,赵思越,李仁贵,何永果[4]（2019）在《大熊猫源致病大肠杆菌CCHTP全基因组测序及耐药和毒力基因分析》一文中研究指出致病性大肠杆菌是引起动物泌尿系统感染的重要病原菌,本研究对泌尿生殖道感染出现潜血的大熊猫尿液中分离的一株致病性大肠杆菌(Escherichia coli CCHTP)进行全基因组测序,检测其中耐药基因和毒力因子的情况,同时对基因岛上耐药和毒力基因及其基因环境进行研究。研究发现,大肠杆菌CCHTP中存在多种类型的耐药基因,其中外排泵系统基因数量最多,包括mdf A、emr E和mdt N等介导多重耐药外排泵的基因。此外,该菌还携带166种毒力因子及563个相关毒力基因,其中属于黏附与侵袭类的毒力因子及相关基因数量最多。对19个基因岛分析发现,基因岛GIs011和GIs017中各有一段包含耐药和毒力基因的序列,两侧与可移动遗传元件(转座酶和插入序列)相连,这些结构可能介导耐药及毒力基因水平转移。本研究通过全基因组测序分析了大熊猫源致病性大肠杆菌中存在的耐药及毒力基因情况,对大熊猫相关疾病的科学治疗、合理用药有重要意义。(本文来源于《遗传》期刊2019年12期）
左文明,曾阳,杨春芳,李美雎,李锦萍[5]（2019）在《基于高通量技术的唐古特大黄叶绿体全基因组测序及应用研究》一文中研究指出目的获得野生唐古特大黄叶绿体全基因组信息特征,并对相关物种亲缘关系进行研究。方法本实验采用Illumina高通量测序技术构建了唐古特大黄叶绿体全基因组图谱。结果唐古特大黄基因组大小为161 054 bp,大(LSC)、小(SSC)单拷贝区大小分别为86 441 bp和12 745 bp,反向互补重复区(IR)大小为30 934 bp,共注释叶绿体基因132个,包括88个蛋白编码基因,36个转运RNA基因和8个核糖体RNA基因,其中每个IR区19个。结论选取唐古特大黄在内的7个蓼科物种、4个其他科物种构建系统发育树,形态极其相似的唐古特大黄与掌叶大黄在分子上亲缘关系也最近,但rpl32等基因存在差异位点,对有效区分近缘物种提供新依据。(本文来源于《中草药》期刊2019年22期）
汤纯,诸永志,吴海虹,孙芝兰,朱云龙[6]（2019）在《基于传统培养和宏基因组测序分析泗洪小龙虾不同部位的菌群多样性》一文中研究指出通过传统培养和宏基因组测序方法分析泗洪地区小龙虾整体、表面、尾肉等不同部位的菌群多样性,确定不同部位的特定污染菌组成。结果表明:小龙虾整体的初始菌数达8.4 (lg(CFU/g)),且不同部位的微生物群落有明显差异;通过宏基因组测序发现,在科水平上,黄杆菌科(Flavobacteriaceaea)是泗洪小龙虾不同部位的优势菌科,丛毛单胞菌科(Comamonadaceae)、莫拉氏菌科(Moraxellaceae)和气单胞菌科(Aeromonadaceae)分别是小龙虾整体、表面和尾肉的优势菌科;在属水平上,金黄杆菌属(Chryseobacterium)、不动杆菌属(Acinetobacter)和气单胞菌属(Aeromonas)分别是小龙虾整体、表面和尾肉的优势菌属,黄杆菌属(Flavobacterium)在3个部位中相对丰度均较高。(本文来源于《肉类研究》期刊2019年10期）
[7]（2019）在《共建东北地区首个全人类基因组测序中心》一文中研究指出本报讯28日,深圳华大基因科技有限公司与鞍山市人民政府在深圳签订战略合作协议,拟在鞍山北方国际健康城建设东北地区首个人类全基因组测序中心。同日,北方国际健康城(鞍山)有限公司与深圳华大智造科技有限公司签订了基因检测平台合作协议。双方达成的战略合作(本文来源于《鞍山日报》期刊2019-10-31）
唐庆华,覃伟权,于少帅,宋薇薇,余凤玉[8]（2019）在《槟榔细菌性叶斑病菌全基因组测序及比较基因组学分析》一文中研究指出由须芒草伯克霍尔德氏菌(Burkholderia andropogonis)侵染引起的槟榔细菌性叶斑病是槟榔生产上最严重的细菌性病害之一。对代表性菌株Y30 (中国典型培养物保藏中心编号:CCTCC AB2014035)进行了初步测序,通过Illumina Hiseq 2000平台测序,Y30共产生1 207 Mb数据。基于测序数据组装获得的Y30基因组大小为7 075 563bp,GC含量58.67%,共33个scaffold,155个contig。通过基因预测、重复序列预测、非编码RNA预测等方法获取Y30基因组的组成情况。Y30的基因组含有7 081个基因,总长度为6 231 444bp,平均长度880bp,占基因组全长的88.07%。串联重复序列共120个,总长为19 152bp,占基因组全长的0.27%。小卫星序列49个,微卫星序列38个。tRNA 58个,rRNA 12个。将菌株Y30与其他Burkholderia全基因组序列进行了共线性分析,结果显示Y30菌株与B.cenocepacia菌株J 2315和B.xenovorans菌株LB400全基因组核酸共线性最高。用Glimmer3.0软件对Y30基因组的ORF进行预测,获得7 081个编码基因,依据COG分类标准将7 081个基因划分为22类。通过与KEGG数据库进行比对,Y30的7 081个基因可划分为34类。(本文来源于《中国植物保护学会2019年学术年会论文集》期刊2019-10-23）
潘静,吴凯峰,周欢敏,张焱如[9]（2019）在《基于全基因组测序的蒙古马运动相关的正向选择基因筛选》一文中研究指出旨在从基因组水平对蒙古马运动性状涉及的相关基因进行分析。本研究利用全基因组测序技术,对蒙古马的血液进行采样和基因组测序,并且结合人、牛、小鼠等7种哺乳动物的基因组数据,对蒙古马的特有基因和正向选择基因进行筛选。分析数据得到已注释的蛋白编码基因19 475种,并筛选出了38种蒙古马特有基因和45种正向选择基因。根据GO富集、KEGG通路富集分析和前人研究,发现包括MAPK13、CCN2、FSCN3、BTG1、TF等17种正向选择的蛋白编码基因可能参与蒙古马的运动过程。这些运动相关正向选择基因的生物学功能涉及到肌动蛋白丝结构、心肌收缩的正调节、钙离子结合、调节细胞内pH、血管生成、胶原生物合成过程的正调节等。而7种miRNAs(包括eca-miR-302c、eca-miR-8974、eca-miR-9077等)则通过与mRNA的3′UTR区域作用分别潜在靶向调控运动相关的MAPK13、LOC100057755、EHD4、MICAL3、TMBIM1和F11R。以上涉及的运动相关正向选择的蛋白编码基因可以促进人们对于蒙古马运动性状的了解,并为靶向竞技型的家畜育种提供分子理论基础。(本文来源于《畜牧兽医学报》期刊2019年10期）
张小丽,孙德岭,单晓政,文正华,姚星伟[10]（2019）在《花椰菜全基因组测序初报》一文中研究指出测序材料为花椰菜高代纯合自交系C-8,成熟期80 d左右,生长势强,抗病性好,花球极紧实、洁白、无毛,配合力高。利用最新的叁代测序技术Pacbio SMART结合二代Illumina Hi Seq技术对该材料进行测序。测得原始数据115.05G,测序深度为190.78X,组装基因组大小为584.6Mb,contingN50为2.11 Mb,并对组装版本进行了多种方法评估,结果显示该版本基因组一致性、完整性及准确性均较好。共预测47 772个蛋白编码基因,其中46 628个(97.6%)可预测功能,其中重复序列比例高达56.65%。通过对21个物种基因家族的聚类分析,得到64 592个基因家族,共有基因家族为3109个。进一步利用434个单拷贝基因家族的序列进化系统分析,发现花椰菜与结球甘蓝、甘蓝TO1000DH、甘蓝型油菜C基因组聚在一支;物种分歧时间估算结果显示,甘蓝于300万年前(3.0Mya)从芸薹属共同祖先种中分化出来,且花椰菜(～2.0 Mya)分化时间晚于结球甘蓝(～2.6 Mya)约0.6Mya。通过共线性分析发现,花椰菜与结球甘蓝之间存在607个共线性模块,涉及到31380个基因;花椰菜与黑芥之间存在777个共线性模块,涉及到34 361个基因;花椰菜与白菜之间存在761个共线性模块,涉及到39 449个基因。这些共线性模块中,位于花椰菜3号染色体上的数量最多。进一步对花椰菜基因组9条染色体进行共线性分析比较,同样发现3号染色体上的共线性模块数量最多。这一结果证实3号染色体在进化过程中是最保守最古老的。利用共线性模块包含的重复基因对和直系同源基因对进行序列比对结果显示,在古六倍化(γ)事件之后,花椰菜经历了2次与拟南芥共有的全基因组(WGD)复制事件,以及1次与其他芸薹属作物共有的全基因组叁倍化(WGT)事件。通过比较基因组分析发现,花椰菜、结球甘蓝及甘蓝TO1000DH的3个基因组共有基因家族20 223个,花椰菜特有基因家族为2 116个,包括2 718个基因。功能富集分析显示这些特有基因与合成、代谢及核酸、蛋白修复等代谢通路相关,一些基因参与生长素的合成,可能与花椰菜形成特异的花球性状相关;花椰菜基因组中扩张基因家族共6个,包括128个基因,这些基因与蛋白折迭和锌离子结合相关;收缩基因家族仅有2个,分别为UDP-glycosyltransferase和elongation factor1-alpha 4,在细胞分裂素的合成中发挥重要作用;花椰菜基因组中共1 065个基因经历了正选择(P <0.05),这些基因主要参与核酸结合及复合物的代谢等途径。(本文来源于《中国园艺学会2019年学术年会暨成立90周年纪念大会论文摘要集》期刊2019-10-21）
全基因组测序论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
中国科学院遗传与发育生物学研究所的科研团队完成了小麦A基因组的测序和染色体精细图谱的绘制,全面揭示了小麦A基因组的结构和表达特征,对深入和系统研究麦类植物的结构与功能基因组学以及进一步推动栽培小麦的遗传改良具有重要的理论意义和实用价值。科研人员指出,小麦A基因组测序和精细图谱
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
全基因组测序论文参考文献
[1].李明曲.全基因组测序技术在抗脓毒症感染中的精准应用及集束化护理干预[J].全科护理.2019
[2]..我国完成小麦A基因组测序和精细图谱绘制[J].教学考试.2019
[3].杨光,孙兰英,段亚东,周双,张鹍.基于简化基因组测序的树莓(Rubuscorchorifolius)遗传分析[J].分子植物育种.2019
[4].邓雯文,李才武,赵思越,李仁贵,何永果.大熊猫源致病大肠杆菌CCHTP全基因组测序及耐药和毒力基因分析[J].遗传.2019
[5].左文明,曾阳,杨春芳,李美雎,李锦萍.基于高通量技术的唐古特大黄叶绿体全基因组测序及应用研究[J].中草药.2019
[6].汤纯,诸永志,吴海虹,孙芝兰,朱云龙.基于传统培养和宏基因组测序分析泗洪小龙虾不同部位的菌群多样性[J].肉类研究.2019
[7]..共建东北地区首个全人类基因组测序中心[N].鞍山日报.2019
[8].唐庆华,覃伟权,于少帅,宋薇薇,余凤玉.槟榔细菌性叶斑病菌全基因组测序及比较基因组学分析[C].中国植物保护学会2019年学术年会论文集.2019
[9].潘静,吴凯峰,周欢敏,张焱如.基于全基因组测序的蒙古马运动相关的正向选择基因筛选[J].畜牧兽医学报.2019
[10].张小丽,孙德岭,单晓政,文正华,姚星伟.花椰菜全基因组测序初报[C].中国园艺学会2019年学术年会暨成立90周年纪念大会论文摘要集.2019
论文知识图
