A型产气荚膜梭菌青海分离株virR基因序列与蛋白结构分析

论文摘要

为了探究产气荚膜梭菌virR基因功能及其蛋白结构特点,提取了产气荚膜梭菌青海分离株的基因组,设计引物对virR基因进行PCR扩增和测序,使用生物软件对该基因进行序列分析和蛋白预测。结果显示,产气荚膜梭菌分离株virR基因长为759 bp,其编码252个氨基酸;分离株virR基因与参考菌株SM101、13、ATCC 13124、CP15、Del1、EHE-NE18、FORC 003、FORC 025、JIR4025、JP55、JP838、LLY N11、NCTC2837以及NCTC13170的virR基因核苷酸序列同源性和氨基酸同源性均在97%以上;二级结构预测显示分离株virR蛋白主要由α螺旋结构和β折叠组成;三级结构预测表明分离株virR蛋白有5种可信度较高的结构,蛋白功能位点预测表明分离株virR蛋白具有1个N-糖基化位点、1个cAMP和cGMP依赖性蛋白激酶磷酸化位点、2个蛋白激酶C磷酸化位点、3个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点以及1个N-豆蔻酰化位点。

论文目录

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李清,冶贵生

关键词: 产气荚膜梭菌,基因,序列分析,蛋白结构

来源: 安徽农业大学学报 2019年05期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 青海大学农牧学院动物医学系

基金: 国家自然科学基金(31760739,31460672),青海省高端创新人才千人计划共同资助

分类号: S852.61

DOI: 10.13610/j.cnki.1672-352x.20190917.001

页码: 800-805

总页数: 6

文件大小: 1261K

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标签：产气荚膜梭菌论文;  基因论文;  序列分析论文;  蛋白结构论文;