大鼠Neuritin基因启动子区克隆、鉴定及生物信息学分析

论文摘要

目的本研究旨在了解大鼠Neuritin基因启动子区特征,为明确神经受损后的再生中Neuritin基因在体内转录水平的调控提供理论依据。利用比较基因组学获取较为可靠的置信序列并设计上、下游引物克隆大鼠Neuritin基因5’调控区片段。方法采用生物信息学方法分析扩增片段序列特征,并采用多款转录因子预测软件预测大鼠Neuritin基因启动子主要调控区的转录因子结合位点。结果研究结果表明成功克隆出3447 bp大鼠Neuritin 5’调控区序列,大鼠Neuritin 5’调控区序列与小鼠同源率为91. 1%。生物信息学方法分析发现距大鼠Neuritin基因CDS区上游740～1012 bp位置处有一个Cp G岛,224 bp处有一个TATA-Box,初步推测大鼠Neuritin基因CDS区上游1100 bp为主要核心启动子区域。利用生物信息学软件预测主要调控区域含有AP-1,AP-2,AP-4和CREB等八个重要的转录因子结合位点。结论本研究大鼠Neuritin基因启动子的鉴定和相关转录因子结合位点的发现为进一步研究大鼠Neuritin基因的表达调控奠定了数据基础。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李琼琼,王立民,徐梦思,万科幸,黄瑾,王成坦,毛福秀,高蕊

关键词: 大鼠,调控区,启动子,转录因子

来源: 石河子大学学报(自然科学版) 2019年02期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 石河子大学医学院/新疆地方与民族高发病教育部重点实验室,新疆农垦科学院省部共建绵羊遗传改良与健康养殖国家重点实验室

基金: 国家自然科学基金项目(31560269,31601030),石河子大学高层人才科研启动项目(RCZ201448)

分类号: Q78

DOI: 10.13880/j.cnki.65-1174/n.2019.02.016

页码: 244-250

总页数: 7

文件大小: 3518K

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标签：大鼠论文;  调控区论文;  启动子论文;  转录因子论文;