分子模拟指导核酸适配体文库设计

分子模拟指导核酸适配体文库设计

论文摘要

核酸适配体是利用配体指数富集的系统进化技术(SELEX)从随机文库中筛选获得一段有功能的单链寡核苷酸。但因筛选过程中的文库选择、洗涤次数、分离效率、缓冲液离子含量和pH值等多种因素的影响,迄今所报道的亲和力与特异性都很高的核酸适配体为数不多。初始文库是核酸适配体筛选的源头,作为SELEX技术的根本,其设计是否合理直接影响到筛选的成败和效率。分子模拟能以核酸适配体文库为主体,计算机为主要工具,发展多种结构模拟与分析工具,辅助核酸适配体文库的合理设计。本文综述了现阶段利用分子模拟进行核酸适配体初始文库设计的相关方法,希望能为从源头上提高核酸适配体筛选的成功率提供线索。

论文目录

  • 1 有指向性的文库设计
  •   1.1 已知野生型靶序列情况下的有指向性的文库设计
  •   1.2 已知核酸适配体序列的有指向性的文库设计
  • 2 无指向性的文库设计
  •   2.1 嵌入式文库设计法
  •   2.2 定向进化法
  •     2.2.1 一级结构序列定向进化法
  •     2.2.2 二级结构模块定向进化法
  •   2.3 图案化文库设计法
  •   2.4 图案化结合虚拟筛选法
  •   2.5 混合矩阵结合图论分析法
  • 3 问题与展望
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 雷云霞,李招发,林俊生

    关键词: 核酸适配体,文库设计,分子模拟,分子对接

    来源: 中国生物化学与分子生物学报 2019年03期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,医药卫生科技

    专业: 生物学

    单位: 华侨大学医学院

    基金: 华侨大学研究生科研创新能力培育计划(No.1611316023),国家重点研发计划(No.2016YFE0101700),福建省科技厅引导性项目(No.2016Y0063)资助~~

    分类号: Q78

    DOI: 10.13865/j.cnki.cjbmb.2019.03.03

    页码: 251-258

    总页数: 8

    文件大小: 335K

    下载量: 353

    相关论文文献

    • [1].核酸适配体修饰与包载及其在疾病靶向性治疗和检测中的应用[J]. 中国药物化学杂志 2019(06)
    • [2].核酸适配体在沙门氏菌快速检测中的研究进展[J]. 农产品加工 2020(02)
    • [3].核酸适配体在微流控芯片中筛选及病毒性疾病中应用[J]. 分析科学学报 2019(06)
    • [4].全新靶向小分子核酸适配体特异性检测肺癌患者血清标志物的应用研究[J]. 临床医学研究与实践 2020(01)
    • [5].核酸适配体光学生物传感器在卡那霉素检测中的研究进展[J]. 生物技术通报 2020(01)
    • [6].基于计算机模拟技术优化筛选核酸适配体的初探[J]. 中国食品学报 2020(03)
    • [7].与草甘膦特异结合的核酸适配体筛选及应用[J]. 分析科学学报 2020(01)
    • [8].前列腺癌细胞核酸适配体支持向量机分类模型[J]. 分析科学学报 2020(01)
    • [9].便携式血糖仪联合血管内皮生长因子适配体传感系统的构建及其在骨肉瘤诊断中的应用[J]. 福建医药杂志 2020(02)
    • [10].毛细管电泳与核酸适配体高效筛选[J]. 分析化学 2020(05)
    • [11].毛细管电泳法研究核酸库容量对蛋白质适配体筛选的影响[J]. 分析化学 2020(05)
    • [12].蛋白质的核酸适配体筛选及应用的研究进展[J]. 分析化学 2020(05)
    • [13].基于荧光分子开关和核酸适配体的镉离子快速检测方法[J]. 食品与机械 2020(03)
    • [14].毛细管电泳法筛选脱铁转铁蛋白的核酸适配体及筛选影响因素分析[J]. 分析化学 2020(05)
    • [15].基于杂交链式反应的适配体传感器用于卡那霉素的比色检测[J]. 分析化学 2020(05)
    • [16].《核酸适配体筛选与分析应用》专辑序言[J]. 分析化学 2020(05)
    • [17].乳腺癌生物标志物钙网蛋白的核酸适配体筛选及血清检测和乳腺癌细胞识别[J]. 分析化学 2020(05)
    • [18].特异性检测珍珠龙胆石斑鱼虹彩病毒病的核酸适配体的筛选与鉴定[J]. 分析化学 2020(05)
    • [19].核酸适配体药物应用于肿瘤治疗的现状[J]. 医药论坛杂志 2020(03)
    • [20].核酸适配体技术在畜产品兽残检测中的应用[J]. 食品研究与开发 2020(14)
    • [21].核酸适配体介导脂质体靶向递送抗肿瘤药物的研究现状[J]. 中国实验方剂学杂志 2020(20)
    • [22].靶向寄生虫的核酸适配体应用研究进展[J]. 中国人兽共患病学报 2020(08)
    • [23].基于核酸适配体检测平台的设计模式[J]. 解剖学杂志 2020(04)
    • [24].非标记依赖的石墨烯核酸适配体传感器用于赭曲霉毒素A的均相快速检测[J]. 西南民族大学学报(自然科学版) 2020(05)
    • [25].核酸适配体和表面等离子体检测技术用于毒品检验的研究进展[J]. 分析试验室 2020(10)
    • [26].基于核酸适配体的牛奶和鸡蛋中雌二醇纳米金比色检测[J]. 农业机械学报 2020(09)
    • [27].不同癌症核酸适配体筛选的研究进展[J]. 山东化工 2020(17)
    • [28].基于核酸碱基猝灭荧光团的核酸适配体传感器检测赭曲霉毒素A[J]. 分析化学 2020(10)
    • [29].适配体在癌症诊断与靶向治疗中的研究进展[J]. 化学通报 2020(11)
    • [30].核酸适配体在肺腺癌诊断和治疗中的应用现状及研究进展[J]. 山东化工 2020(18)

    标签:;  ;  ;  ;  

    分子模拟指导核酸适配体文库设计
    下载Doc文档

    猜你喜欢