寡核苷酸序列分析论文_陈名君,林俨,黄勃

导读:本文包含了寡核苷酸序列分析论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:核苷酸,序列,基因,卡拉,相似性,病毒,肝炎。

寡核苷酸序列分析论文文献综述

陈名君,林俨,黄勃^[1]（2019）在《根虫瘟霉和相关种的分类地位研究及其ITS核苷酸序列分析》一文中研究指出根虫瘟霉是最常见的一种虫霉,寄主广泛,世界广布。目前有学者认为该种是个复寄主的根虫瘟霉及其近缘类群总计19个菌株,进行3个靶位点(ITèU合种。S、LSU D本研究对世界不同地区和不同rDNA、RPB2)的分子系统发育学分析。结果显示,根虫瘟霉ITS长度较为保守性,介于1 321–1 324bp之间,而所研究的虫霉亚门的其他类群的长度范围较大,为556–1654bp。本研究确认根虫瘟霉是单系种,同时西虫瘟霉、矛孢虫瘟霉和英吉利虫瘟霉具有明确种的分类地位。鬼笔状虫瘟霉种应该被视为西虫瘟霉的异名。(本文来源于《菌物学报》期刊2019年10期）

刘炜炜,许文博,刘升学,黄家风^[2]（2012）在《蚕豆萎蔫病毒2的分子鉴定及RNA1组分5′末端核苷酸序列分析》一文中研究指出用蚕豆病毒属(Fabavirus)的兼并引物Fab5′R1F和Fab5R′1R对自然感病的4株加工番茄、1株辣椒和2株一串红病株进行RT-PCR,将扩增到的长约400bp的片段进行克隆和测序。结果发现:来自7个病株的9个病毒分离物均为蚕豆萎蔫病毒2(BBWV-2)基因组RNA1组分5′末端的353～392个核苷酸;同源性比较表明,9个序列之间的同源性为90.4%～99.2%,与已报道的BBWV2的同源性为89.5%～95.9%。序列比对发现,BBWV2基因组RNA1组分5′末端非编码区包含了由11个碱基(AAACAGCUUUC)组成的重复序列,而分别来自加工番茄分离物XJ14-1b和一串红的分离物S12在重复序列区段内比其它所有分离物缺少了包括2个重复序列在内的36个碱基。(本文来源于《石河子大学学报(自然科学版)》期刊2012年06期）

李鑫,丁镌,侯玲,刘杰^[3]（2012）在《新等位基因HLA-B~* 56:21的核苷酸序列分析》一文中研究指出目的确认HLA新等位基因HLA-B*56∶21并分析其有异常反应格局的核苷酸序列。方法标本DNA抽提采用美国Tiangen试剂盒,采用聚合酶链反应序列-特异寡核苷酸探针杂交技术(PCR-SSOP)进行HLA分型,发现1个与HLA-B*56相关的异常基因,使用DNA测序分型技术(PCR-SBT)直接测定其基因序列,并分析其与最接近的HLA-B*56∶05∶02和HLA-B*56∶07基因序列的差异。结果新基因与所有已知的HLA-B等位基因序列均不相同,与HLA-B*56∶05∶02基因序列相比在第2外显子有6个碱基发生替代,导致5个氨基酸发生改变;与HLA-B*56∶07相比,在第2外显子序列仅有2个碱基被替代,第3外显子序列有6个碱基被替代,也导致5个氨基酸发生改变。结论发现1个新的HLA-B等位基因,现已被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*56∶21,新等位基因HLA-B*56∶21与HLA-B*56∶05∶02、HLA-B*56∶07均有很高相似性。(本文来源于《中国输血协会第六届输血大会论文专辑（报告篇）》期刊2012-11-07）

李鑫,丁镌,侯玲,刘杰^[4]（2012）在《新等位基因HLA-B~* 56:21的核苷酸序列分析》一文中研究指出目的确认HLA新等位基因HLA-B*56∶21并分析其有异常反应格局的核苷酸序列。方法标本DNA抽提采用美国Tiangen试剂盒,采用聚合酶链反应序列-特异寡核苷酸探针杂交技术(PCR-SSOP)进行HLA分型,发现1个与HLA-B*56相关的异常基因,使用DNA测序分型技术(PCR-SBT)直接测定其基因序列,并分析其与最接近的HLA-B*56∶05∶02和HLA-B*56∶07基因序列的差异。结果新基因与所有已知的HLA-B等位基因序列均不相同,与HLA-B*56∶05∶02基因序列相比在第2外显子有6个碱基发生替代,导致5个氨基酸发生改变;与HLA-B*56∶07相比,在第2外显子序列仅有2个碱基被替代,第3外显子序列有6个碱基被替代,也导致5个氨基酸发生改变。结论发现1个新的HLA-B等位基因,现已被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*56∶21,新等位基因HLA-B*56∶21与HLA-B*56∶05∶02、HLA-B*56∶07均有很高相似性。(本文来源于《中国输血杂志》期刊2012年10期）

胡艳灵,陈统球,黄明,戚凤春,崔燕萍^[5]（2012）在《甲型肝炎病毒Js-4株经人二倍体细胞传代后的核苷酸序列分析》一文中研究指出目的分析甲型肝炎病毒(Hepatitis A virus,HAV)Js-4株经人二倍体细胞MRC-5传代后的核苷酸序列变异情况。方法将HAV Js-4株经Vero细胞适应14代获得的原始株Js-4-V14经人二倍体细胞MRC-5于35℃连续适应培养15代,取其中8个适应株(Js-4-M2、Js-4-M3、Js-4-M4、Js-4-M5、Js-4-M10、Js-4-M12、Js-4-M14、Js-4-M15)及原始株,提取病毒基因组RNA,通过RT-PCR扩增病毒全基因组,采用生物信息学软件DNAstar Lasergene 7进行序列分析。结果 8个适应株全基因组与Js-4-V14株的核苷酸序列同源性在99.8%～100.0%之间;第5代适应株在5′-NCR(101～200 bp)发生较大变异,表现为105～157 bp缺失,之后该突变稳定遗传;第10、12、14、15代适应株在2A(3 012～3 210 bp)区段3 122位点发生点突变;8个适应株和Js-4-V14毒株与野毒株HM175为同一基因亚型,均为IB型;9个毒株的主要抗原位点与野生株HM175完全一致。结论 HAV Js-4-V14株在MRC-5细胞传代适应过程中,主要抗原位点未发生突变,其与细胞适应性和病毒增殖有关的基因在传代早期已经变异,传代后期这些变异保持相对稳定。(本文来源于《中国生物制品学杂志》期刊2012年09期）

贺艳艳,潘辉,刘书东,左文斌,李莲瑞^[6]（2011）在《新疆卡拉库尔羊TNF-α基因的克隆及核苷酸序列分析》一文中研究指出根据普通绵羊的碱基序列和相关文献设计引物,用RT-PCR扩增并测定了卡拉库尔羊肿瘤坏死因子-α基因的cDNA序列。结果表明,TNF-αcDNA序列包含了一个705 bp的开放阅读框,通过GenBank中的Blastn序列比较分析,卡拉库尔羊的TNF-α基因与普通绵羊的同源性高达99.86%。这为将来制备卡拉库尔羊TNF-α基因探针及卡拉库尔羊分子免疫学的发展提供了理论依据。(本文来源于《塔里木大学学报》期刊2011年03期）

孙桂金,潘杰,刘可春,王雪,彭维兵^[7]（2011）在《毛蚶、泥蚶和魁蚶ITS1核苷酸序列分析》一文中研究指出对毛蚶、泥蚶和魁蚶3种贝类的ITS1序列进行PCR扩增、测序及分析,并用M ega3.1软件对其进行系统进化分析。毛蚶、泥蚶和魁蚶的ITS1序列长度分别为424、456和431 bp,3种蚶的479个序列位点中,共有330个保守位点,98个变异位点,94个单突变位点。系统进化分析表明,毛蚶和泥蚶先聚为一支,而后与魁蚶聚为一支。ITS1分析结果显示毛蚶和泥蚶种间的遗传关系较近。(本文来源于《生物技术通报》期刊2011年07期）

潘辉,贺艳艳,李莲瑞^[8]（2011）在《新疆卡拉库尔羊Fas基因的克隆及核苷酸序列分析》一文中研究指出为了分析新疆卡拉库尔羊的Fas基因,根据普通绵羊的碱基序列和相关文献设计引物,用RT-PCR扩增并测定了卡拉库尔羊Fas基因的cDNA序列。结果表明,Fas基因cDNA序列包含了一个750 bp的开放阅读框,通过GenBank中的Blastn序列比较分析,卡拉库尔羊的Fas基因与普通绵羊的同源性高达99.69%。这为将来制备卡拉库尔羊Fas基因探针及卡拉库尔羊分子免疫学的发展提供了理论依据。(本文来源于《塔里木大学学报》期刊2011年02期）

左文斌,潘辉,李莲瑞^[9]（2011）在《多浪羊IFN-γ基因克隆及核苷酸序列分析》一文中研究指出为了分析新疆多浪羊的IFN-γ基因,根据GenBank中NM_001009803的mRNA序列设计引物,以新疆多浪羊淋巴细胞的总RNA为模板,用RT-PCR扩增多浪羊IFN-γ基因序列。测序结果表明I,FN-γ基因序列包含了一个582 bp的开放阅读框,通过GenBank中的Blastn序列比较分析,多浪羊的IFN-γ基因与普通绵羊的同源性高达99.82%,为多浪羊IFN-γ的功能研究及多浪羊免疫应答基因的筛选奠定基础。(本文来源于《塔里木大学学报》期刊2011年02期）

刘志刚,曹宗喜,张得玉,秦宏阳,张亮权^[10]（2011）在《广东地区猪源戊型肝炎病毒的检测和核苷酸序列分析》一文中研究指出为了检测广东地区部分猪场猪群中的猪源戊型肝炎病毒(HEV)RNA,试验利用反转录巢式聚合酶链式反应(RT-nPCR)并应用生物学软件将经扩增和测序得到的猪源HEV核苷酸序列与GenBank上的各个基因型HEV进行相似性比较分析。结果表明:5个样品中检测到HEV RNA,它们的相似性为85.1%～96.3%,与GenBank上基因Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型和Ⅳ型HEV序列的相似性分别为76.1%～80.5%、76.5%～79.4%、76.4%～80.2%、82.1%～97.7%。说明广东地区存在的猪源HEV可能属于在国内猪群中流行的基因Ⅳ型。(本文来源于《黑龙江畜牧兽医》期刊2011年09期）

寡核苷酸序列分析论文开题报告

（1）论文研究背景及目的

此处内容要求：

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例：

用蚕豆病毒属(Fabavirus)的兼并引物Fab5′R1F和Fab5R′1R对自然感病的4株加工番茄、1株辣椒和2株一串红病株进行RT-PCR,将扩增到的长约400bp的片段进行克隆和测序。结果发现:来自7个病株的9个病毒分离物均为蚕豆萎蔫病毒2(BBWV-2)基因组RNA1组分5′末端的353～392个核苷酸;同源性比较表明,9个序列之间的同源性为90.4%～99.2%,与已报道的BBWV2的同源性为89.5%～95.9%。序列比对发现,BBWV2基因组RNA1组分5′末端非编码区包含了由11个碱基(AAACAGCUUUC)组成的重复序列,而分别来自加工番茄分离物XJ14-1b和一串红的分离物S12在重复序列区段内比其它所有分离物缺少了包括2个重复序列在内的36个碱基。

（2）本文研究方法

调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

寡核苷酸序列分析论文参考文献

[1].陈名君,林俨,黄勃.根虫瘟霉和相关种的分类地位研究及其ITS核苷酸序列分析[J].菌物学报.2019

[2].刘炜炜,许文博,刘升学,黄家风.蚕豆萎蔫病毒2的分子鉴定及RNA1组分5′末端核苷酸序列分析[J].石河子大学学报(自然科学版).2012

[3].李鑫,丁镌,侯玲,刘杰.新等位基因HLA-B~*56:21的核苷酸序列分析[C].中国输血协会第六届输血大会论文专辑（报告篇）.2012

[4].李鑫,丁镌,侯玲,刘杰.新等位基因HLA-B~*56:21的核苷酸序列分析[J].中国输血杂志.2012

[5].胡艳灵,陈统球,黄明,戚凤春,崔燕萍.甲型肝炎病毒Js-4株经人二倍体细胞传代后的核苷酸序列分析[J].中国生物制品学杂志.2012

[6].贺艳艳,潘辉,刘书东,左文斌,李莲瑞.新疆卡拉库尔羊TNF-α基因的克隆及核苷酸序列分析[J].塔里木大学学报.2011

[7].孙桂金,潘杰,刘可春,王雪,彭维兵.毛蚶、泥蚶和魁蚶ITS1核苷酸序列分析[J].生物技术通报.2011

[8].潘辉,贺艳艳,李莲瑞.新疆卡拉库尔羊Fas基因的克隆及核苷酸序列分析[J].塔里木大学学报.2011

[9].左文斌,潘辉,李莲瑞.多浪羊IFN-γ基因克隆及核苷酸序列分析[J].塔里木大学学报.2011

[10].刘志刚,曹宗喜,张得玉,秦宏阳,张亮权.广东地区猪源戊型肝炎病毒的检测和核苷酸序列分析[J].黑龙江畜牧兽医.2011

论文知识图

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