基于ND2基因的崖沙燕遗传多样性和遗传结构初探

基于ND2基因的崖沙燕遗传多样性和遗传结构初探

论文摘要

利用线粒体DNA中的NADH脱氢酶第二亚基(ND2)对来自齐齐哈尔市50个崖沙燕(Riparia riparia)样本进行扩增和测序,发现了11条新的单倍型序列。结合从GenB ank中下载的104条序列,对崖沙燕3个亚种种群(154只个体)进行序列变异及系统发育分析。结果显示,3个亚种种群中有2个共享单倍型。群体总的单倍型多样性(Hd)为(0. 885±0. 019),群体总的核苷酸多样性(Pi)为(0. 002 92±0. 000 18)。与其近缘物种淡色崖沙燕(Riparia diluta)相比较,崖沙燕种群表现出较低水平的遗传多样性。分子方差分析(AMOVA)显示变异主要来自种群内(72. 82%)。构建的单倍型系统发育树表明,62个单倍型没有形成明显的亚种分化和地理分化。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 PCR扩增与测序
  •   1.3 数据分析
  • 2 结果
  •   2.1 线粒体ND2基因片段序列特征及遗传多样性
  •   2.2 单倍型分布与系统发育分析
  •   2.3 种群间遗传分化
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 安博洋,安月,王兰芝,李波

    关键词: 崖沙燕,基因,遗传多样性,遗传结构

    来源: 野生动物学报 2019年02期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 东北林业大学野生动物资源学院,国家林业和草原局野生动植物检测中心

    基金: 国家重点研发计划项目(2016YFC1201602)

    分类号: Q953

    DOI: 10.19711/j.cnki.issn2310-1490.2019.02.016

    页码: 377-383

    总页数: 7

    文件大小: 911K

    下载量: 101

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