螺旋桨家族蛋白质论文-许瑞珍,杨雄波

螺旋桨家族蛋白质论文-许瑞珍,杨雄波

导读:本文包含了螺旋桨家族蛋白质论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:蛋白质,对称性,四螺旋桨家族,氨基酸序列

螺旋桨家族蛋白质论文文献综述

许瑞珍,杨雄波[1](2008)在《四螺旋桨家族蛋白质序列——结构关系研究》一文中研究指出蛋白质的叁级结构唯一地由其氨基酸序列决定,这是广为人所接受的。然而,很多具有规则叁级结构的蛋白质其氨基酸序列接近随机,这使得人们感到很困惑。本文将以四螺旋桨家族蛋白质为例,通过简化氨基酸残基,根据相似性方法把序列中的隐含对称性显示出来。结果表明氨基酸序列中的隐含对称性与叁级结构的四重准对称性一致。(本文来源于《科技信息(科学教研)》期刊2008年12期)

王晓春[2](2006)在《螺旋桨家族蛋白质序列和结构关系研究》一文中研究指出自从安芬森的蛋白质变性-复性实验以后,人们广泛接受了蛋白质叁级结构是由其一级序列决定的理论,然而到目前为止,序列决定结构的具体机理我们仍然不是很清楚。同时多序列比对的经验告诉我们,当两个蛋白质的相似度达到30%以上时,那么它们很可能具有相似的叁级结构。这个规则对于单个蛋白质或许同样也成立,即如果蛋白质内部具有相似的子序列,那么很可能形成相似的子结构。基于这两点,我们期望在对称蛋白的序列中能发现决定结构的隐含信息,选取具有优美对称结构的螺旋桨家族蛋白作为研究对象。本论文的工作主要有以下叁点:首先,我们用相似性方法对研究对象做了一系列的分析,为了滤掉随机噪声的影响,考虑了统计显着性,置信概率设为95%,研究结果表明序列内部确实存在相似度很高的一些子片段,但是有些结果还不是很清晰。第二,用相似性方法给出的子相似矩阵的关联系数方法,能比较直观的揭示序列内部的重复片段,并可以清楚的给出相似子片段的边界。同时和另外两种方法(RADAR和TRUST)作了比较,研究结果表明我们的方法在寻找蛋白质的序列对称性上具有一定的优越性,对于解决蛋白质序列-结构的关系问题有一定的帮助,并且对蛋白质进化的复制机制可以提供证据。第叁,由于在序列比对过程中考虑了蛋白质二级结构的信息,也就是把氨基酸序列简化为NP模型序列,在此基础上我们讨论了NP序列的随机性,同时对螺旋桨家族序列做了深入的分析,通过计算全原子的相互作用能量的给出了决定结构对称的关键氨基酸。(本文来源于《华中科技大学》期刊2006-11-01)

螺旋桨家族蛋白质论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

自从安芬森的蛋白质变性-复性实验以后,人们广泛接受了蛋白质叁级结构是由其一级序列决定的理论,然而到目前为止,序列决定结构的具体机理我们仍然不是很清楚。同时多序列比对的经验告诉我们,当两个蛋白质的相似度达到30%以上时,那么它们很可能具有相似的叁级结构。这个规则对于单个蛋白质或许同样也成立,即如果蛋白质内部具有相似的子序列,那么很可能形成相似的子结构。基于这两点,我们期望在对称蛋白的序列中能发现决定结构的隐含信息,选取具有优美对称结构的螺旋桨家族蛋白作为研究对象。本论文的工作主要有以下叁点:首先,我们用相似性方法对研究对象做了一系列的分析,为了滤掉随机噪声的影响,考虑了统计显着性,置信概率设为95%,研究结果表明序列内部确实存在相似度很高的一些子片段,但是有些结果还不是很清晰。第二,用相似性方法给出的子相似矩阵的关联系数方法,能比较直观的揭示序列内部的重复片段,并可以清楚的给出相似子片段的边界。同时和另外两种方法(RADAR和TRUST)作了比较,研究结果表明我们的方法在寻找蛋白质的序列对称性上具有一定的优越性,对于解决蛋白质序列-结构的关系问题有一定的帮助,并且对蛋白质进化的复制机制可以提供证据。第叁,由于在序列比对过程中考虑了蛋白质二级结构的信息,也就是把氨基酸序列简化为NP模型序列,在此基础上我们讨论了NP序列的随机性,同时对螺旋桨家族序列做了深入的分析,通过计算全原子的相互作用能量的给出了决定结构对称的关键氨基酸。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

螺旋桨家族蛋白质论文参考文献

[1].许瑞珍,杨雄波.四螺旋桨家族蛋白质序列——结构关系研究[J].科技信息(科学教研).2008

[2].王晓春.螺旋桨家族蛋白质序列和结构关系研究[D].华中科技大学.2006

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