论文摘要
念珠藻（Nostoc）固氮过程关键在于固氮酶的催化,而固氮酶复合物中的铁蛋白（NifH）是由高度保守的nifH基因编码的,该基因是进化史上现存最古老的功能基因之一。该研究选取念珠藻属及近缘类群的nifH基因序列共40条,采用最大似然法构建系统发育树;运行PAML4.9软件,对nifH基因编码蛋白进行生物信息学分析,并使用分支模型、位点模型和分支-位点模型检测该基因的选择位点,探讨nifH基因的适应性进化特征。结果表明:（1）最大似然树显示内类群中该研究物种共分为6个分支（A、B、C、D、E和F）,其中D和E是2个大的分支,每个大分支中又各包含2个特殊的小分支A、F和B、C,其中F分支包含新疆古尔班通古特沙漠采集到的9株念珠藻,A分支包含F分支及该研究测定序列的4株葛仙米,B分支包含本研究测定序列的4株地皮菜和3株未定种的念珠藻,C分支包含NCBI数据库中下载的5株念珠藻、鱼腥藻序列和本研究测定序列的1株念珠藻。（2）在所分析的3种进化模型中,仅通过分支-位点模型检测出14个统计学上显著的正选择位点,即1F、2S、3S、4T、5A、6F、7F、8I、9S、10C、17I、27Y、29D和31R位点,表明念珠藻属植物的nifH基因发生了适应性变化,分支-位点模型是研究藻类基因适应性进化较好的模型。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 王捷,徐羽,石瑛,王清华,孟志龙,谢树莲
关键词: 念珠藻,基因,分支模型,位点模型,分支位点模型,适应性进化
来源: 西北植物学报 2019年11期
年度: 2019
分类: 基础科学
专业: 生物学
单位: 太原师范学院生物系,山西大学生命科学学院
基金: 山西省“1331工程”重点创新团队建设计划(TD201718),山西省应用基础研究计划(201801D221282),山西省高等学校科技创新项目(201802102),山西省重点研发计划(社会发展)(201803D31054)
分类号: Q943
页码: 1961-1969
总页数: 9
文件大小: 4328K
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