低温刺激对脂肪细胞基因差异表达的影响

低温刺激对脂肪细胞基因差异表达的影响

论文摘要

目的:分析低温刺激对脂肪细胞基因表达的影响,探讨低温刺激下脂肪细胞功能改变对临近组织与器官产生的影响。方法:从SD大鼠腹股沟皮下脂肪组织中成功分离培养原代脂肪间充质干细胞。原代ADSCs传代培养到第三代时开始成脂诱导培养13天,已分化好的脂肪细胞经油红O染色鉴定后,分为37℃对照组(C组)、30℃(D1组)、20℃(D2组)和10℃(D3组)四组。四组脂肪细胞放在不同温度组下培养8小时后,提取各组脂肪细胞RNA进行RNA-Seq检测,通过DEGseq R语言包处理数据获得差异表达基因。随机选取6个差异表达基因通过qRT-PCR实验验证测序数据的准确性。利用KOBAS3.0软件,STRING数据库和Cytoscape3.5.0软件对差异表达基因进行GO基因功能富集分析,KEGG生物通路富集分析和蛋白网网络互作分析。结果:ADSCs成功分化诱导成脂肪细胞。测序分析结果显示CD1组有55个差异表达基因其中35个上调,20个下调。CD2组有121个差异表达基因其中76个上调,45个下调.CD3组有92个差异表达基因其中64个上调,28个下调。GO基因功能富集分析显示差异基因功能主要富集在生物过程中与氧化应激,血管生成的及免疫反应有关。KEGG生物通路富集分析显示,差异表达基因主要富集的通路为PI3K-Akt信号通路,p53信号通路,致心律失常性右心室心肌病,TNF信号通路,糖尿病并发症中的AGERAGE信号通路,MAPK信号通路和矿物质吸收等。差异表达基因与糖尿病,心肌疾病和炎症反应存在一定联系。蛋白互作网络分析得出C组与D1,D2,D3组间关键性差异基因为Fos,Serpine1,Egr1,Cyr61,Gstp1,Rhob,Maoa,Nr4a1,Myc,Csf1和Junb。这些基因主要在细胞增殖,神经变性和血管再生方面起主要作用。结论:低温刺激下,脂肪细胞存在差异基因的表达。差异表达基因的功能主要富集于细胞增殖,免疫炎症,血管生成,神经病变等方面。低温刺激下脂肪细胞分泌功能的改变对脂肪及临近组织器官功能产生一定影响,为脂肪周围组织与器官相关疾病的发病原因提供新研究方向。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 常用缩写词中英文对照表
  • 前言
  • 1 材料与方法
  •   1.1 实验材料
  •   1.2 实验方法
  • 2 结果
  •   2.1 诱导ADSCs成脂及油红O染色
  •   2.2 RNA-Seq数据质量分析
  •   2.3 差异表达基因鉴定结果
  •   2.4 差异表达基因的功能分析
  •   2.5 qRT-PCR对测序准确性的验证
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 参考文献
  • 综述 不同部位白色脂肪组织的结构与功能
  •   参考文献
  • 附录
  • 致谢
  • 在学期间承担/参与的科研课题与研究成果
  • 个人简介
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 许雷

    导师: 李宪起

    关键词: 脂肪细胞,低温

    来源: 山西医科大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学,医药卫生科技

    专业: 生物学,基础医学

    单位: 山西医科大学

    分类号: R329.2

    总页数: 47

    文件大小: 1654K

    下载量: 52

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