基因指纹图论文_李伟伟,顾玲,叶珣,陈晓东,丁震

导读:本文包含了基因指纹图论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:微生物,指纹,基因,病原,大肠杆菌,引物,碱基。

基因指纹图论文文献综述

李伟伟,顾玲,叶珣,陈晓东,丁震[1](2009)在《rep-PCR基因指纹图微生物源追踪方法建立的研究》一文中研究指出[目的]建立重复序列聚合酶链反应(rep-PCR)微生物源追踪方法,应用于淮河流域某水库的粪便污染来源追踪。[方法]采集已知来源的人和动物粪便标本以及水样标本,分离并确认指示菌大肠杆菌,以BOXA1R为引物进行PCR扩增;用Bionumerics 4.0软件对rep-PCR基因指纹图进行判别分析和多元方差分析并计算各源种类的正确归类率。[结果]2分类、4分类和10分类的正确归类率分别为:85.60%、79.20%和70.98%。判别分析和多元方差分析结果显示rep-PCR基因指纹图能将已知源不同来源指示菌区分开。水样中主要粪便污染来源为猪、鸡和人。[结论]建立的rep-PCR微生物源追踪方法能较好地区分水体中指示菌的不同来源,该方法的建立为查找水体中粪便污染来源以及水体治理提供了新技术。(本文来源于《现代预防医学》期刊2009年17期)

李伟伟[2](2009)在《Rep-PCR基因指纹图微生物源追踪方法研究与应用》一文中研究指出水源性病原体危害人类健康,而粪便污染是造成水中病原体污染的最主要原因,确定粪便污染来源对于健康危害评估及对污染水体的整改和管理至关重要。传统的监测方法只能对水体做出卫生学评价,而无法查找水体中污染物的来源。Rep-PCR基因指纹图微生物源追踪技术则可以通过不同来源指示菌的源特征性基因指纹图,结合统计学分析来查找水体中粪便污染来源。目的本研究旨在建立桂五水库地区已知源特征性rep-PCR基因指纹库,并用正确归类率等统计学方法对其进行评价,检测桂五水库水样标本,追踪其为期一年的粪便污染来源。方法春、夏、秋和冬四季分别采集桂五水库周边村落已知来源的人和动物(家禽、家畜和野生动物)新鲜粪便标本,分离并确认指示菌大肠杆菌,以BOXA1R为引物进行PCR扩增。用Bionumerics 4.0软件对rep-PCR基因指纹图进行判别分析和多元方差分析并计算正确归类率,以评价该方法对不同种属来源指示菌的区分效果。按月采集水样标本,膜过滤法分离指示菌,进行rep-PCR扩增,将水样中指示菌rep-PCR基因指纹图与已知源特征性rep-PCR基因指纹库进行统计学比对,判断桂五水库中粪便污染来源。结果1.从650份已知源粪便标本中分离2705株指示菌,筛选并建立已知源特征性rep-PCR基因指纹库。2.将已知源库分为10类、5类、3类和2类统计分析,各种属平均正确归类率分别为:68.13%、74.76%、82.36%和86.03%。判别分析和多元方差分析结果显示rep-PCR基因指纹图能将已知源不同来源指示菌区分开。3. 84份未知源水样分离到534株指示菌,rep-PCR实验得到502条特征指纹图,指其中477条(95.02%)指纹图可判别污染来源。判别分析结果显示:桂五水库中粪便污染来源种类多,人、鸡、牛、羊、猪、鸭、鹅、野生动物、狗和鸽各占27.88%、15.51 %、11.53%、9.22%、8.39%、8.18%、6.01%、5.66%、4.19%和3.35%,其中人、鸡和牛3类共占54.92%。结论筛选并建立的已知源特征性rep-PCR基因指纹库具有宿主特异性,能较好地区分水体中指示菌的不同来源;水体标本监测显示桂五水库粪便污染来源种类多,其中人、鸡和牛相对较多,提示应对桂五水库地区加强人、家禽和家畜动物粪便的无害化管理。(本文来源于《南京医科大学》期刊2009-05-01)

欧媛,朱平,张英,顾江英,郭晓玲[3](2005)在《用TCR基因指纹图发现抗磷脂综合征患者优势T细胞克隆》一文中研究指出抗磷脂综合征(antiphospholipid syndrome,APS)是由抗磷脂抗体(aPL)引起并表现为反复动静脉血栓、习惯性流产和血小板减少的一组临床征象的总称。抗磷脂抗体是针对自身抗原产生的一组异质性抗体,其靶抗原包括带负电荷的磷脂和血浆中的磷脂结合蛋白,比较清楚的是β2-glycopro tein Ⅰ(β2-GPI),目前普遍检测的是抗心磷脂抗体(aCLs)和狼疮抗凝物(LA)。抗磷脂综合征患者体液免疫发生紊乱,产生了自身抗体,其体内也存在异常细胞免疫。Kazue Yoshida 1等用聚合酶链反应和单链构相多态性(PCR-SSCP)的方法分析了几例抗磷脂综合征患者用β2-GPI体外刺激得到(本文来源于《第10届全国实验血液学会议论文摘要汇编》期刊2005-11-01)

刘刚,陶传敏,翟朝阳[4](2004)在《利用M-RAPD技术绘制不同病原微生物基因指纹图》一文中研究指出目的 探讨一种多重随机引物 PCR方法 (M- RAPD)对不同种株病原微生物进行鉴定的可能性。方法 将 1 0个碱基的随机引物进行随机组合 ,利用叁条组合的随机引物在较高的退火温度下对不同种株病原微生物染色体 DNA进行扩增 ,通过 1 5 g/L 琼脂糖凝胶电泳获得不同种株病原微生物的扩增图谱 ,并用软件 Gelworks1 d Intermediate进行分析。结果 初步实验表明 ,M- RAPD技术可以得到稳定的种株特异的 DNA指纹图谱 ,其条带清晰、数目较多、片段大小分布均匀。叁引物的扩增产物包含了其中任意两引物的绝大多数扩增产物 ,大、小片段均可出现增减 ,但小片段更易增加 ;对同一种病原微生物叁引物所提供的基因信息要远多于两引物所提供的信息 ,增加的信息量约为原来的 5 0 % ;不同耐药菌株间及其与相应标准株间差异亦很明显 ,但同种不同株间相同的扩增产物要多于不同的扩增产物。软件 Gelworks1 d Interm ediate的分析数据亦支持我们的实验结果。结论  M- RAPD技术对不同种株病原微生物染色体 DNA扩增时 ,能获取较丰富的遗传信息 ,可迅速、简便地鉴定不同种株的病原微生物。(本文来源于《四川大学学报(医学版)》期刊2004年04期)

刘刚[5](2004)在《利用M-RAPD技术绘制不同病原微生物基因指纹图》一文中研究指出目的:建立一种多重随机引物PCR方法即Multiplex RAPD技术(M-RAPD技术),探讨其对不同种株病原微生物进行有效、快速鉴定的可能性及应用前景。方法:将10个碱基的寡核苷酸RAPD引物进行随机组合,利用叁条组合的RAPD引物在较高的退火温度(40℃)下对不同种株病原微生物染色体DNA进行扩增,通过15g/L琼脂糖凝胶电泳获得不同种株病原微生物的染色体DNA扩增指纹图谱,并用软件Gelworks 1d Intermediate对指纹图谱进行分析。结果:初步实验表明,利用特定的引物组合(S15、S18、S103,S14、S18、S66与S15、S18、S66),M-RAPD技术可以得到稳定的种株特异的DNA指纹图谱,其条带清晰、数目较多、片段大小分布均匀;叁引物的扩增产物包含了其中任意两引物的绝大多数扩增产物,大、小片段均可出现增减,但小片段更易增加;不同病原微生物间差异显示明显,不同种菌株对于同一RAPD引物组合未发现相同的扩增产物(包括亮度差异),有鉴定不同种类病原微生物的能力,具有临床意义;对同一种病原微生物叁引物所提供的基因信息要远多于两引物所提供的信息,增加的信息量约为原来的50%;不同耐药菌株间及其与相应标准株间差异亦很明显,但同种不同株间相同的扩增产物要多于不同的扩增产物。应用软件Gelworks 1d Intermediate对所得不同病原微生物的M-RAPD指(本文来源于《四川大学》期刊2004-05-10)

刘刚,陶传敏,翟朝阳[6](2003)在《利用RAPD技术绘制不同病原微生物基因指纹图》一文中研究指出传染性疾病是严重危害人类健康的一类疾病,但目前尚缺乏一种相对通用的检测方法对感染性因子做出准确的鉴定,因此,利用分子生物学技术从染色体水平上测定各类感染性因子的特征,从而建立新的分子诊断方法,具有重要意义。一、材料与方法1.菌株来源标准菌株:大肠埃希菌ATCC 25922、阴沟肠杆菌ATCC 13047均购自北京中国科学微生物(本文来源于《中国细胞生物学学会第八届会员代表大会暨学术大会论文摘要集》期刊2003-11-01)

方盛国,姜春晓,兰翎[7](1997)在《家猪基因指纹图的初步研究》一文中研究指出寡核苷酸探针(CAC)5/(GTG)5检测了五指山猪、枫泾猪、枫泾猪与长白山猪杂交子一代的基因指纹图.各个体的可分辨谱带,分布于0.7~21.2kb之间.在约1.3kb处的一条共有谱带,可能是家猪的特征带.(本文来源于《应用与环境生物学报》期刊1997年04期)

方盛国[8](1996)在《大山雀两亚种基因指纹图的比较研究》一文中研究指出寡核苷酸基因指纹探针LZFI对大山雀青藏亚种(Parusmajortibetanus)和华北亚种(P.m.artatus)随机个体进行了基因指纹图的比较检测,结果如下:(1)P.m.tibetanus个体在2.3kb处均有一条杂交谱带,而P.m.artatus个体的共有谱带则位于4.8kb处。不同的共有等位基因,是区别两亚种的遗传标记之一。(2)P.m.tibetanus和P.m.artatus随机个体的平均谱带数分别是14.65条和19.30条;个体间基因指纹图的相似系数分别是0.18和0.13;P.m.tibetanus和P.m.artatus个体之间基因指纹图的相似系数是0.09。结果表明:P.m.artatus群体内的遗传变异性高于P.m.tibetanus群体,且两亚种之间的变异性高于两亚种内部的变异性。(3)LZFI探针在P.m.tibetanus随机个体检测中的鉴别几率为2.04×10-12,在P.m.artatus则高达9.8×10-17。表明两亚种的基因指纹图均具有个体特异性,且P.m.artatus群体基因组的多态性较P.m.tibetanus强。该结果为开展对大山雀种内分化的基因多?(本文来源于《生物多样性》期刊1996年04期)

基因指纹图论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

水源性病原体危害人类健康,而粪便污染是造成水中病原体污染的最主要原因,确定粪便污染来源对于健康危害评估及对污染水体的整改和管理至关重要。传统的监测方法只能对水体做出卫生学评价,而无法查找水体中污染物的来源。Rep-PCR基因指纹图微生物源追踪技术则可以通过不同来源指示菌的源特征性基因指纹图,结合统计学分析来查找水体中粪便污染来源。目的本研究旨在建立桂五水库地区已知源特征性rep-PCR基因指纹库,并用正确归类率等统计学方法对其进行评价,检测桂五水库水样标本,追踪其为期一年的粪便污染来源。方法春、夏、秋和冬四季分别采集桂五水库周边村落已知来源的人和动物(家禽、家畜和野生动物)新鲜粪便标本,分离并确认指示菌大肠杆菌,以BOXA1R为引物进行PCR扩增。用Bionumerics 4.0软件对rep-PCR基因指纹图进行判别分析和多元方差分析并计算正确归类率,以评价该方法对不同种属来源指示菌的区分效果。按月采集水样标本,膜过滤法分离指示菌,进行rep-PCR扩增,将水样中指示菌rep-PCR基因指纹图与已知源特征性rep-PCR基因指纹库进行统计学比对,判断桂五水库中粪便污染来源。结果1.从650份已知源粪便标本中分离2705株指示菌,筛选并建立已知源特征性rep-PCR基因指纹库。2.将已知源库分为10类、5类、3类和2类统计分析,各种属平均正确归类率分别为:68.13%、74.76%、82.36%和86.03%。判别分析和多元方差分析结果显示rep-PCR基因指纹图能将已知源不同来源指示菌区分开。3. 84份未知源水样分离到534株指示菌,rep-PCR实验得到502条特征指纹图,指其中477条(95.02%)指纹图可判别污染来源。判别分析结果显示:桂五水库中粪便污染来源种类多,人、鸡、牛、羊、猪、鸭、鹅、野生动物、狗和鸽各占27.88%、15.51 %、11.53%、9.22%、8.39%、8.18%、6.01%、5.66%、4.19%和3.35%,其中人、鸡和牛3类共占54.92%。结论筛选并建立的已知源特征性rep-PCR基因指纹库具有宿主特异性,能较好地区分水体中指示菌的不同来源;水体标本监测显示桂五水库粪便污染来源种类多,其中人、鸡和牛相对较多,提示应对桂五水库地区加强人、家禽和家畜动物粪便的无害化管理。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

基因指纹图论文参考文献

[1].李伟伟,顾玲,叶珣,陈晓东,丁震.rep-PCR基因指纹图微生物源追踪方法建立的研究[J].现代预防医学.2009

[2].李伟伟.Rep-PCR基因指纹图微生物源追踪方法研究与应用[D].南京医科大学.2009

[3].欧媛,朱平,张英,顾江英,郭晓玲.用TCR基因指纹图发现抗磷脂综合征患者优势T细胞克隆[C].第10届全国实验血液学会议论文摘要汇编.2005

[4].刘刚,陶传敏,翟朝阳.利用M-RAPD技术绘制不同病原微生物基因指纹图[J].四川大学学报(医学版).2004

[5].刘刚.利用M-RAPD技术绘制不同病原微生物基因指纹图[D].四川大学.2004

[6].刘刚,陶传敏,翟朝阳.利用RAPD技术绘制不同病原微生物基因指纹图[C].中国细胞生物学学会第八届会员代表大会暨学术大会论文摘要集.2003

[7].方盛国,姜春晓,兰翎.家猪基因指纹图的初步研究[J].应用与环境生物学报.1997

[8].方盛国.大山雀两亚种基因指纹图的比较研究[J].生物多样性.1996

论文知识图

正常对照组和阿莫西林处理组IHFA小鼠肠...;图3-14DGGE条带位置分析:A~I是来自正常土...条带位置分析:A~I是来自正常土...堆肥化过程古细菌amoA基因DGGE电泳图鼠疫菌rRNA基因指纹图鼠疫菌rRNA基因指纹图

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