海藻糖-6-磷酸(T6P)荧光探针的开发

海藻糖-6-磷酸(T6P)荧光探针的开发

论文摘要

海藻糖-6-磷酸(T6P)是海藻糖代谢的中间产物,也是调节植物糖代谢等生理过程的信号分子。T6P产生和降解的精确调节对于确保生物体在环境和营养变化下的适应性至关重要。近年来,随着研究的不断深入,发现T6P作为信号分子,在调控植物胚胎发育、气孔开放、叶片衰老以及开花时间等方面有着重要作用。尽管T6P在植物中有着重要作用,但对于T6P的检测却是当前的一大难点。这是因为细胞内T6P浓度较低,研究发现植物中T6P含量仅有0.1-15μM,且生物体内还存在T6P的同分异构体蔗糖-6-磷酸(S6P),使用质谱检测具有一定的困难,二者基线很难分离,也无法选择性地测量细胞内游离的T6P或者监测其在同一细胞内随时间的动态变化。为了更好地研究生物体内T6P的动态变化及生理作用,亟需一种新的方法来对体内T6P定量。近年来,基于荧光共振能量转移(FRET)的基因编码荧光探针被广泛应用于检测活细胞内多种信号分子以及代谢物(Ca2+、ROS、ATP、氨基酸、H2O2、糖类、激素类),这些细胞内小分子的实时定量监测对人们研究生物体内信号传递具有重要的意义。基于此,本研究设计了一种基于FRET原理的荧光探针来监测体内T6P的动态变化。基于FRET的基因编码的荧光探针是由嵌合蛋白组成,嵌合蛋白由中间配体结合蛋白与两种不同波长的荧光蛋白融合而成,靶分子的结合引起了中间配体结合蛋白构象的变化,改变了荧光团之间的距离,从而产生能量的传递。本研究使用突变后无活性但能和T6P特异性结合的海藻糖-6-磷酸磷酸酶(AtTPPG)作为T6P的特异性识别元件,将其插入供体绿色荧光蛋白(Clover)与受体红色荧光蛋白(mRuby2)之间,设计成用于监测T6P动态变化的荧光探针。通过对AtTPPG定点突变的筛选,以及利用激光共聚焦显微镜成像统计和体外荧光蛋白寿命检测,得到监测T6P的荧光探针,分别命名为CR-Mu1、CR-Mu2、CR-Mu3。在大肠杆菌体内,三种探针均能特异性识别T6P,监测不同浓度T6P的变化,三者都随T6P浓度的改变使得荧光强度发生变化,即供体荧光逐渐减弱,而受体荧光逐渐加强。综合对比几种探针,发现CR-Mu3的效果最好。本研究在体外以及大肠杆菌和酵母体内对T6P探针的性能进行了表征和验证,表明本实验设计的T6P探针可以监测T6P含量的变化,这对研究生物体内T6P的代谢过程以及响应胁迫机制,有重要的指导意义。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 缩略词表
  • 1 前言
  •   1.1 荧光蛋白简介
  •   1.2 基因编码的荧光探针
  •     1.2.1 基因编码的荧光探针简介
  •     1.2.2 基因编码的荧光探针原理
  •     1.2.3 FRET探针荧光对的选择
  •     1.2.4 报告蛋白的选择
  •   1.3 基因编码的荧光探针的优点与应用
  •     1.3.1 基因编码的荧光探针的优点
  •     1.3.2 基因编码的荧光探针的应用实例
  •   1.4 海藻糖-6-磷酸(T6P)简介
  •     1.4.1 生物体内几种不同的糖信号
  •     1.4.2 几种糖的化学性质
  •     1.4.3 T6P在生物体内的作用
  •     1.4.4 T6P的代谢
  •     1.4.5 T6P的体内检测
  •   1.5 立题依据
  • 2 材料与方法
  •   2.1 常用仪器
  •   2.2 常用实验软件及生物网站
  •     2.2.1 常用实验软件
  •     2.2.2 常用生物网站
  •   2.3 实验材料、载体及菌株
  •     2.3.1 实验材料
  •     2.3.2 载体和菌株
  •   2.4 实验溶液配制
  •     2.4.1 常用抗生素的配制
  •     2.4.2 常用培养基
  •     2.4.3 制备大肠杆菌感受态所用溶液的配制
  •   2.5 酵母筛选培养基的配制
  •   2.6 实验方法
  •     2.6.1 拟南芥RNA的提取
  •     2.6.2 拟南芥cDNA的合成
  •     2.6.3 DNA琼脂糖凝胶的配制
  •     2.6.4 载体构建
  •     2.6.5 重组质粒验证
  •     2.6.6 定点突变技术
  •     2.6.7 目的蛋白表达与纯化
  •     2.6.8 目的蛋白浓缩和浓度检测
  •     2.6.9 蛋白质量的检测
  •     2.6.10 蛋白活性的检测
  •     2.6.11 蛋白与小分子结合的测定
  •     2.6.12 荧光寿命的检测
  •     2.6.13 酵母感受态的制备和转化
  •     2.6.14 酵母的培养和诱导
  •     2.6.15 拟南芥原生质体瞬时转化
  •     2.6.16 激光扫描共聚焦显微镜的使用
  •     2.6.17 成像数据统计与分析
  • 3 结果与分析
  •   3.1 T6P荧光探针设计原理
  •   3.2 FRET荧光对的选择
  •     3.2.1 Clover-mRuby2 荧光光谱的验证
  •     3.2.2 Clover-mRuby2与CFP-YFP荧光对成像比较
  •   3.3 生物信息学分析
  •     3.3.1 不同物种间海藻糖-6-磷酸磷酸酶(TPP)氨基酸序列同源性比较
  •     3.3.2 海藻糖-6-磷酸磷酸酶(AtTPPG)突变位点分析
  •   3.4 蛋白酶活的检测及与T6P结合的测定
  •     3.4.1 AtTPPG及点突变载体的构建
  •     3.4.2 AtTPPG及突变体的蛋白纯化
  •     3.4.3 AtTPPG及其突变体蛋白酶活的测定
  •     3.4.4 AtTPPG及其突变体蛋白与T6P结合检测
  •   3.5 T6P荧光探针
  •     3.5.1 T6P探针的构建以及报告蛋白长度的筛选
  •     3.5.2 T6P探针荧光寿命的检测
  •     3.5.3 三种探针对T6P浓度的响应
  •     3.5.4 三种探针的衰退检测
  •   3.6 T6P探针的改造
  •     3.6.1 CR-MT对 T6P浓度的依赖性
  •     3.6.2 CR-MT对时间的依赖性
  •   3.7 T6P探针的应用
  •     3.7.1 T6P探针在酵母中的应用
  •     3.7.2 T6P探针在拟南芥原生质体中的应用
  • 4 讨论
  • 5 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 曹艳艳

    导师: 张宇

    关键词: 荧光探针,海藻糖磷酸磷酸酶

    来源: 河南大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 河南大学

    分类号: Q503

    总页数: 77

    文件大小: 6855K

    下载量: 78

    相关论文文献

    • [1].碱性磷酸酶荧光探针的研究进展[J]. 有机化学 2019(11)
    • [2].碳点荧光探针在农产品快速检测中的应用进展[J]. 包装工程 2020(03)
    • [3].量子点“开-关-开”型荧光探针的应用进展[J]. 广东化工 2020(10)
    • [4].荧光探针分子探测硫化氢机理的理论研究[J]. 江苏理工学院学报 2020(02)
    • [5].一种新型主客体荧光探针对人体氨基酸的识别研究[J]. 化学通报 2020(09)
    • [6].基于1,8-萘酰亚胺检测细胞内肼的荧光探针[J]. 精细化工 2020(09)
    • [7].一种比率型荧光探针用于成像活细胞中的过氧化氢[J]. 有机化学 2020(09)
    • [8].一种基于苯并噻唑衍生物的高选择性比率型高半胱氨酸荧光探针及生物成像(英文)[J]. 有机化学 2020(08)
    • [9].基于分子内电荷转移的多枝状荧光探针光学性质与响应机理分析(英文)[J]. Chinese Journal of Chemical Physics 2019(04)
    • [10].快速溶剂交换法制备疏水性二氧化硅气凝胶及其负载有机荧光探针的应用研究[J]. 有机化学 2019(02)
    • [11].选择性检测生物硫醇荧光探针的研究进展[J]. 轻工科技 2018(08)
    • [12].硫离子荧光探针的研究进展[J]. 山东化工 2018(14)
    • [13].小分子荧光探针的设计和展望[J]. 广州化工 2018(16)
    • [14].反应激活型酶荧光探针的研究进展[J]. 化工学报 2017(01)
    • [15].检测钾离子通道的小分子荧光探针的研究进展[J]. 药学进展 2017(01)
    • [16].基于罗丹明类荧光探针的研究进展[J]. 现代化工 2017(04)
    • [17].动植物体系中锌离子荧光探针的设计、合成及初步应用[J]. 分析仪器 2016(S1)
    • [18].铜离子比率荧光探针的研究进展[J]. 化学与生物工程 2017(06)
    • [19].碳点荧光探针在食品检测中的应用[J]. 食品研究与开发 2017(12)
    • [20].基于香豆素衍生物的锌离子荧光探针作用机理的理论研究[J]. 广东化工 2017(11)
    • [21].β-半乳糖苷酶荧光探针的研究进展[J]. 中国科学:化学 2017(08)
    • [22].前言:分子荧光探针专刊[J]. 中国科学:化学 2017(08)
    • [23].蛋白质保护的金纳米簇为荧光探针检测甲磺酸帕珠沙星[J]. 现代化工 2017(09)
    • [24].生物小分子巯基化合物荧光探针研究进展[J]. 分析测试技术与仪器 2017(03)
    • [25].以醛基为识别基团的荧光探针的探索[J]. 中学生数理化(学习研究) 2017(05)
    • [26].一种硒离子荧光探针及其制备方法和用途[J]. 化学分析计量 2013(06)
    • [27].富勒烯量子点荧光探针的合成及对铁离子的检测[J]. 分析试验室 2019(12)
    • [28].煤基碳点“关-开”型荧光探针检测多巴胺的研究[J]. 现代化工 2020(05)
    • [29].以喹啉酮为核心高选择快速检测谷胱甘肽的荧光探针[J]. 应用化学 2020(07)
    • [30].用于检测肼的小分子荧光探针的研究进展[J]. 应用技术学报 2019(03)

    标签:;  ;  

    海藻糖-6-磷酸(T6P)荧光探针的开发
    下载Doc文档

    猜你喜欢