启动子检测论文_耿江桥,郭永丽,邰隽,张杰,王生才

导读:本文包含了启动子检测论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:基因,甲基化,蛋白,波形,拟南芥,油鸡,性别。

启动子检测论文文献综述

耿江桥,郭永丽,邰隽,张杰,王生才[1](2019)在《端粒酶逆转录酶启动子突变检测在儿童甲状腺癌个体化治疗方案制定中的应用》一文中研究指出目的探讨端粒酶逆转录酶(telomerase reverse transcriptase tert, TERT)启动子突变检测在儿童甲状腺癌个体化治疗方案制定中的应用。方法选取儿童甲状腺乳头状癌39例为研究对象,均进行TERT启动子突变检测,并收集相关临床资料,分析TERT启动子突变与儿童甲状腺乳头状癌临床特征相关性。结果儿童甲状腺乳头状癌39例中TERT启动子突变8例,突变率为20.51%。TERT启动子突变与未突变甲状腺乳头状癌患儿性别、年龄、肿瘤大小、肿瘤发生灶、腺囊是否侵犯、美国癌症联合委员会(american joint committeeon cancer, AJCC)的M分期及病理类型比较差异无统计学意义(P>0.05)。TERT启动子突变与未突变甲状腺乳头状癌患儿腺外是否侵犯、AJCC的T分期、AJCC的N分期及甲状腺癌预后评分系统(AMES)分型比较差异有统计学意义(P<0.05)。进一步分析不同AJCC的T分期和AMES分型的甲状腺乳头状癌患儿TERT启动子突变率,结果显示不同AJCC的T分期TERT启动子突变率T1与T4间比较差异有统计学意义(P<0.05);不同AMES分型TERT启动子突变率低危与高危间比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论 TERT启动子突变甲状腺癌患儿肿瘤侵袭力及转移率均高于TERT启动子未突变甲状腺癌患儿,在手术方式选择时,应充分评估,可以考虑行甲状腺全切除及淋巴结清除术。(本文来源于《临床误诊误治》期刊2019年11期)

刘晓柱,李银凤[2](2019)在《拟南芥AtSWEET4基因启动子序列、编码蛋白结构分析及其在病原菌胁迫下表达特性检测》一文中研究指出【目的】分析拟南芥糖运输载体蛋白基因(AtSWEET4)启动子序列及其编码蛋白的结构,并检测病原菌胁迫下AtSWEET4基因的表达特性,为研究AtSWEET4蛋白在拟南芥生长发育和生物胁迫中的作用机制提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法分析AtSWEET4基因启动子序列及其编码蛋白的结构,并采用实时荧光定量PCR(qRTPCR)和β-葡萄糖苷酸酶(GUS)组织染色法检测人工接种菜豆晕疫病菌(Pseudomonas syringae pv. phaseolicola,Psp)NPS3121和丁香假单胞菌番茄致病变种(Pseudomonas syringae pathovar tomato,Pst)DC3000后AtSWEET4基因的表达情况。【结果】AtSWEET4蛋白由251个氨基酸组成,分子量为27.8 kD,分子式为C1300H2038N304O346S11,理论等电点(pI)为8.71,脂肪氨基酸指数为118.76,不稳定指数为38.72,平均亲水性指数为0.629,为稳定的亲水蛋白,且含有7个跨膜结构域,无信号肽,为非分泌型蛋白。AtSWEET4蛋白与芥属的亚麻荠和荠菜SWEET4蛋白亲缘关系最近,其次是十字花科的甘蓝和萝卜SWEET4蛋白,与禾本科的二穗短柄草SWEET4蛋白亲缘关系最远。AtSWEET4基因启动子序列中包含核心元件TATA-box、增强子元件CAAT-box、调控植物生长发育相关元件、激素响应相关元件、非生物胁迫响应相关元件和生物胁迫响应相关元件。Psp NPS3121和Pst DC3000均可诱导AtSWEET4基因表达,但表达模式不同:接种Psp NPS3121后6和12 h的AtSWEET4基因表达明显上调,但至接种后24 h又迅速下降;接种Pst DC3000后AtSWEET4基因表达量逐渐增加。【结论】AtSWEET4基因的启动子序列特征及其编码蛋白结构与其参与植物免疫反应密切相关。(本文来源于《南方农业学报》期刊2019年09期)

李明轩,方琪星,任虹宇,司昊天,马建功[3](2019)在《胶质母细胞瘤中HOXD10基因启动子的甲基化检测及与预后的关系》一文中研究指出目的探讨同源异形盒基因D10(HOXD10)在胶质母细胞瘤中的启动子甲基化状态,并分析其基因启动子甲基化与患者预后的关系。方法选取49例人脑胶质母细胞瘤和30例正常脑组织,采用甲基化特异性PCR技术检测HOXD10基因启动子甲基化状态,免疫组织化学法分别检测HOXD10蛋白表达,分析HOXD10基因启动子甲基化状态与患者临床病理特征的关系。Kaplan-Meier法分析HOXD10基因启动子甲基化状态与患者预后关系,Cox回归模型分析影响患者预后因素,Spearman相关性分析HOXD10基因启动子甲基化与其蛋白表达相关性。结果与正常脑组织相比,胶质母细胞瘤HOXD10启动子甲基化阳性率升高(P<0.05)。HOXD10启动子甲基化状态与患者性别、年龄、KPS无关(P>0.05),肿瘤直径>5 cm患者的HOXD10启动子甲基化阳性率高于肿瘤直径≤5 cm患者(P<0.05),病理分级为高级别(Ⅲ~Ⅳ级)患者HOXD10启动子甲基化阳性率高于病理分级为低级别患者(P<0.05)。胶质母细胞瘤HOXD10启动子甲基化阳性患者PFS和OS均低于阴性患者(P<0.05)。病理分级和HOXD10基因启动子甲基化状态是影响患者预后的独立危险因素(P<0.05)。胶质母细胞瘤HOXD10基因启动子甲基化阳性患者HOXD10蛋白阳性率低于阴性患者(P<0.05)。Spearman相关性分析结果显示,胶质母细胞瘤中HOXD10基因启动子甲基化与其蛋白表达呈负相关(r=-0.731,P<0.05)。结论胶质母细胞瘤中HOXD10基因启动子甲基化阳性率升高,阳性表达患者预后较差,可作为患者预后评估的重要参考指标。(本文来源于《成都医学院学报》期刊2019年04期)

蔡艳,陈良,汪期明[4](2019)在《子宫内膜异位症恶变组织中RASSF2A启动子甲基化的表达差异性检测及其临床意义》一文中研究指出目的通过运用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)检测子宫内膜异位囊肿(EC)组织、子宫内膜异位相关的卵巢癌(EAOC)中RASSF2A基因启动子甲基化(以下简称甲基化)的情况。探讨该基因启动子甲基化在子宫内膜异位恶变组织中的表达及临床意义。方法选取在宁波市妇女儿童医院进行手术治疗患者的石蜡包埋标本。30份正常子宫内膜组织,30份EC组织,30例卵巢透明细胞癌(OCC)组织,30份卵巢子宫内膜样腺癌(OEA)组织,比较甲基化在不同组织类型患者中的表达差异。显微镜观察筛选20份EAOC样本,比较甲基化与各种临床病理特征的关系。结果 OCC组织中RASSF2A启动子甲基化阳性率明显高于EC和正常子宫内膜组织(均P <0.05),OEA组织中RASSF2A启动子甲基化阳性率明显高于EC组织和正常子宫内膜组织(均P<0.05),EC组织中RASSF2A启动子甲基化阳性率高于正常子宫内膜组织(P<0.05)。EAOC组织中RASSF2A基因启动子甲基化率与患者年龄、临床分期、组织学分级及临床病理类型无关(均P> 0.05);RASSF2A基因启动子甲基化程度与淋巴结转移有关(P <0.05)。结论 RASSF2A基因启动子甲基化与子宫内膜异位症恶变存在联系。(本文来源于《现代实用医学》期刊2019年03期)

晁哲,吴望军,邢漫萍,黄丽丽,孙瑞萍[5](2019)在《鸡HSP90AA1基因SNP检测及启动子区CpG岛的甲基化研究》一文中研究指出试验旨在获得鸡热休克蛋白90α(HSP90AA1)基因序列并分析其基因结构和相关遗传变异,检测HSP90AA1基因启动子区CpG岛的甲基化状态,初步探索HSP90AA1基因在肌肉组织生长发育中的作用。以文昌鸡和北京油鸡为试验材料,利用PCR扩增鸡HSP90AA1基因组序列;通过基因测序寻找该基因中的单核苷酸多态性(SNP)位点;使用在线软件MethPrimer预测鸡HSP90AA1基因中CpG岛的位置;应用MassArray质谱法检测鸡胸肌中HSP90AA1基因启动子区CpG岛的甲基化水平,比较分析文昌鸡和北京油鸡HSP90AA1基因的甲基化差异。结果显示,在鸡HSP90AA1基因组中共发现7个SNPs位点,分别位于启动子区(A-189G,C-109T)、第1外显子(A+6G)、第2外显子(C+343T)、第2内含子(A+634G、A+836G)和第7内含子(A+3449G);鸡HSP90AA1基因包含10个外显子和9个内含子,其启动子区存在1个CpG岛,位于-1 802~-469bp处;在HSP90AA1基因启动子区共检测了42个CpG位点的甲基化水平,文昌鸡和北京油鸡中分别有9个(CpG_16.17.18、CpG_21.22.23、CpG_32.33和CpG_57)和4个CpG位点(CpG_1、CpG_5.6和CpG_57)在胸肌生长发育过程中发生甲基化改变。结果表明,文昌鸡与北京油鸡HSP90AA1基因序列信息和启动子区CpG岛的甲基化水平不同,这可能导致两种鸡对于应激反应具有不同的耐受程度。以上试验结果将为文昌鸡和北京油鸡生长发育规律、系统选育等方面的研究提供表观遗传学依据。(本文来源于《中国畜牧兽医》期刊2019年02期)

汤婷,谢实龙,祝旋,徐俊锋,唐俊[6](2019)在《CaMV35S启动子及其在转基因作物中的应用和检测》一文中研究指出花椰菜花叶病毒35S启动子(CaMV35S)是植物基因工程中应用最广泛的启动子之一,它在转基因植物的安全评价及检测研究中具有重要意义。了解CaMV35S启动子的起源及其发展情况,是开展转基因安全评价和检测的前提。文章对CaMV35S启动子的发展历史及其结构、功能作了简要描述,分析总结了CaMV35S启动子在转基因作物中的应用情况和目前对其相应的检测方法。针对目前在转基因作物中检测CaMV35S启动子存在的问题,认为今后转基因相关作物的序列信息及检测数据需要交流和共享,同时各个检测机构或实验室之间需要展开数据共享与共同验证,从而建立针对CaMV35S启动子的相对统一的标准检测方法。(本文来源于《浙江农业学报》期刊2019年01期)

杨存存,杨宗军,张璐,汤潜,刘世国[7](2018)在《子痫前期孕妇外周血CTGF基因启动子甲基化检测》一文中研究指出目的检测子痫前期孕妇外周血中结缔组织生长因子(CTGF)基因启动子区的甲基化水平,探讨其在子痫前期发生发展中的作用。方法收集90例子痫前期病人(子痫前期组)和94例正常妊娠孕妇(正常对照组)的外周血样本,采用甲基化特异性PCR(MSP)技术检测CTGF基因启动子区的甲基化水平,对两组检测结果进行分析比较。结果子痫前期组和正常对照组CTGF基因启动子区甲基化阳性率分别为32.2%和46.8%,子痫前期组CTGF基因甲基化水平低于正常对照组,差异有统计学意义(χ~2=4.087,P<0.05)。结论子痫前期孕妇CTGF基因启动子区呈异常的低甲基化状态,推测其在子痫前期的发生发展过程中具有重要意义。(本文来源于《青岛大学学报(医学版)》期刊2018年06期)

张良,周进学,肖腾,向宏市[8](2018)在《肝细胞癌患者血清中SOX1和VIM启动子的甲基化检测及其临床意义》一文中研究指出目的探究肝细胞癌(HCC)患者血清中性别决定区域Y盒1(SOX1)、波形蛋白(VIM)基因启动子甲基化状态及其临床意义。方法采用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)检测60例未经治疗的HCC患者(HCC组)、50例乙型肝炎后肝硬化患者(LC组)、50例慢性乙型病毒性肝炎患者(CHB组)及50例健康体检者(Control组)的血清SOX1、VIM基因启动子甲基化状态,并分析其与HCC患者临床特征的关系。结果 HCC组患者的血清SOX1、VIM基因启动子甲基化阳性率均高于LC组、CHB组和Control组,差异均有统计学意义(P﹤0.05);LC组和CHB组患者的血清SOX1、VIM基因启动子甲基化阳性率均高于Control组,差异均有统计学意义(P﹤0.05);LC组患者的血清SOX1、VIM基因启动子甲基化阳性率均高于CHB组,但差异均无统计学意义(P﹥0.05)。不同包膜侵犯程度、分化程度、TNM分期、远处转移情况HCC患者的血清SOX1基因启动子甲基化状态比较,差异均有统计学意义(P﹤0.05);不同分化程度、TNM分期、远处转移情况HCC患者的血清VIM基因启动子甲基化状态比较,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。结论血清SOX1基因启动子甲基化状态与HCC患者的包膜侵犯程度、分化程度、TNM分期及远处转移情况有关,VIM基因启动子甲基化状态与HCC患者的分化程度、TNM分期、远处转移情况有关,两者均可作为HCC分子诊断和病情进展的生物标志物。(本文来源于《癌症进展》期刊2018年11期)

舒新红,范红莉,李小燕[9](2018)在《子宫内膜癌患者肿瘤组织和血清中SOX1和VIM启动子的甲基化检测及其临床意义》一文中研究指出目的检测子宫内膜癌(EC)患者血清中性别决定区Y框蛋白1(SOX1)和波形蛋白(VIM)启动子的甲基化情况,并探究其临床意义。方法选择英山县人民医院2013年7月至2015年12月收治的120例EC患者为观察组,另选择50例功能性子宫出血患者作为对照组。采用甲基化特异性PCR(MSP)技术检测血清及肿瘤组织SOX1、VIM基因启动子的甲基化状态;分析血清SOX1、VIM基因启动子甲基化与EC患者临床病理特征的关系;并分析SOX1、VIM单一及联合检测方法的灵敏度、特异度和准确度。结果 (1)EC患者血清SOX1基因启动子甲基化率(71.67%)显着高于对照组(10.00%)(P<0.05),EC患者肿瘤组织SOX1基因启动子甲基化率(95.83%)显着高于对照组(2.00%)(P<0.05)。(2)EC患者血清VIM基因启动子甲基化率(60.83%)显着高于对照组(12.00%)(P<0.05),EC患者肿瘤组织VIM基因启动子甲基化率(94.17%)显着高于对照组(4.00%)(P<0.05)。(3)血清SOX1、VIM基因启动子甲基化水平与EC患者的淋巴结转移情况、病理分期、子宫肌层浸润深度有关(P<0.05),与HCC患者的年龄、肿瘤类型无关(P>0.05)。(4)血清SOX1、VIM启动子甲基化单独及联合诊断的灵敏度依次为71.67%、60.83%和81.67%,特异度依次为90.00%、88.00%和84.00%,准确度依次为77.06%、68.82%和86.47%。与SOX1、VIM单独诊断比较,联合诊断的灵敏度,准确度均显着升高(P<0.05);不同诊断方式的特异度比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论 SOX1和VIM基因甲基化是EC发生的潜在标志物,血清SOX1和VIM基因启动子甲基化联合检测可用于临床EC的筛查及早期诊断。(本文来源于《分子诊断与治疗杂志》期刊2018年05期)

张凤兰,李江[10](2018)在《牙槽骨再生关键基因—FGFR1启动子荧光素酶报告基因的重组与功能检测》一文中研究指出目的:本实验选择调控牙槽骨再生的关键基因--碱性成纤维细胞生长因子受体1(FGFR1)作为靶向,构建FGFR1启动子的分子细胞模型,研究雌二醇及其促进剂对FGFR1启动子的调节作用,从而为临床应用雌二醇及促进剂治疗牙槽骨再生提供理论支持。(本文来源于《第十二次全国口腔修复学学术会议论文汇编》期刊2018-07-22)

启动子检测论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

【目的】分析拟南芥糖运输载体蛋白基因(AtSWEET4)启动子序列及其编码蛋白的结构,并检测病原菌胁迫下AtSWEET4基因的表达特性,为研究AtSWEET4蛋白在拟南芥生长发育和生物胁迫中的作用机制提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法分析AtSWEET4基因启动子序列及其编码蛋白的结构,并采用实时荧光定量PCR(qRTPCR)和β-葡萄糖苷酸酶(GUS)组织染色法检测人工接种菜豆晕疫病菌(Pseudomonas syringae pv. phaseolicola,Psp)NPS3121和丁香假单胞菌番茄致病变种(Pseudomonas syringae pathovar tomato,Pst)DC3000后AtSWEET4基因的表达情况。【结果】AtSWEET4蛋白由251个氨基酸组成,分子量为27.8 kD,分子式为C1300H2038N304O346S11,理论等电点(pI)为8.71,脂肪氨基酸指数为118.76,不稳定指数为38.72,平均亲水性指数为0.629,为稳定的亲水蛋白,且含有7个跨膜结构域,无信号肽,为非分泌型蛋白。AtSWEET4蛋白与芥属的亚麻荠和荠菜SWEET4蛋白亲缘关系最近,其次是十字花科的甘蓝和萝卜SWEET4蛋白,与禾本科的二穗短柄草SWEET4蛋白亲缘关系最远。AtSWEET4基因启动子序列中包含核心元件TATA-box、增强子元件CAAT-box、调控植物生长发育相关元件、激素响应相关元件、非生物胁迫响应相关元件和生物胁迫响应相关元件。Psp NPS3121和Pst DC3000均可诱导AtSWEET4基因表达,但表达模式不同:接种Psp NPS3121后6和12 h的AtSWEET4基因表达明显上调,但至接种后24 h又迅速下降;接种Pst DC3000后AtSWEET4基因表达量逐渐增加。【结论】AtSWEET4基因的启动子序列特征及其编码蛋白结构与其参与植物免疫反应密切相关。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

启动子检测论文参考文献

[1].耿江桥,郭永丽,邰隽,张杰,王生才.端粒酶逆转录酶启动子突变检测在儿童甲状腺癌个体化治疗方案制定中的应用[J].临床误诊误治.2019

[2].刘晓柱,李银凤.拟南芥AtSWEET4基因启动子序列、编码蛋白结构分析及其在病原菌胁迫下表达特性检测[J].南方农业学报.2019

[3].李明轩,方琪星,任虹宇,司昊天,马建功.胶质母细胞瘤中HOXD10基因启动子的甲基化检测及与预后的关系[J].成都医学院学报.2019

[4].蔡艳,陈良,汪期明.子宫内膜异位症恶变组织中RASSF2A启动子甲基化的表达差异性检测及其临床意义[J].现代实用医学.2019

[5].晁哲,吴望军,邢漫萍,黄丽丽,孙瑞萍.鸡HSP90AA1基因SNP检测及启动子区CpG岛的甲基化研究[J].中国畜牧兽医.2019

[6].汤婷,谢实龙,祝旋,徐俊锋,唐俊.CaMV35S启动子及其在转基因作物中的应用和检测[J].浙江农业学报.2019

[7].杨存存,杨宗军,张璐,汤潜,刘世国.子痫前期孕妇外周血CTGF基因启动子甲基化检测[J].青岛大学学报(医学版).2018

[8].张良,周进学,肖腾,向宏市.肝细胞癌患者血清中SOX1和VIM启动子的甲基化检测及其临床意义[J].癌症进展.2018

[9].舒新红,范红莉,李小燕.子宫内膜癌患者肿瘤组织和血清中SOX1和VIM启动子的甲基化检测及其临床意义[J].分子诊断与治疗杂志.2018

[10].张凤兰,李江.牙槽骨再生关键基因—FGFR1启动子荧光素酶报告基因的重组与功能检测[C].第十二次全国口腔修复学学术会议论文汇编.2018

论文知识图

启动子调控下串联IRES及外源基因的载...一8PPA御对野生和突变的刃仰4启动子的影...一7LKFIS对野生和突变的脂联素启动子活...一3KLF15超表达调控PPAYRZ启动子活性研...一10LKF15和ALKF51对脂联素启动子活性的...肝癌细胞P53与下游启动子p21的结合能...

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