论文摘要
目的:基于生物信息学和网络药理学方法探究枸杞子（LF）促进虹膜色素上皮细胞定向分化治疗视网膜色素变性（RP）的分子网络调控机制。方法:在中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）检索LF的主要活性成分及其可能的作用靶点;从GEO数据库下载GSE81058基因表达谱数据,采用R软件构建虹膜色素上皮细胞（IPE）和视网膜色素上皮细胞（RPE）差异表达基因火山图和聚类热图;采用STRING数据库构建LF成分-靶点和IPE-RPE差异表达基因的蛋白质-蛋白质交互网络（PPI）,运用Cytoscape提取交集网络基因;通过DAVID数据库对交集基因进行基因本体和信号通路分析;采用cytoHubba分析LF作用于IPE的关键靶点。结果:共获得LF的化学成分188个,其中主要的入血活性成分36个,这些活性成分可能作用的靶点201个;IPE与RPE主要的差异表达基因有142个,其中上、下调基因各71个;发掘得到105个与LF促进IPE分化以治疗RP的相关基因靶点;LF作用于这些靶点涉及的生物学过程包括调节细胞分化、调节视网膜层形成等,相关的分子功能主要涉及转录共激活剂活性、离子通道活性等,主要富集于细胞质、高尔基体、细胞核等区域;LF作用于IPE涉及的分子机制包括调控PI3K-Akt信号通路、神经活性配体-受体相互作用通路等;LF促进IPE分化主要作用于SPP1、MMP9等十个关键靶点。结论:IPE与RPE具有明显差异的基因表达谱,LF的有效活性成分可作用于这些差异表达基因,促进IPE细胞分化为RPE,从而治疗RP。本研究可为细胞移植与中医药联合的中西医结合疗法应用于RP的临床治疗提供科学依据。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 宋厚盼,曾梅艳,陈小娟,陈新怡,彭俊,周亚莎,杨毅敬,杨焘,蔡雄,彭清华
关键词: 视网膜色素变性,生物信息学,网络药理学,虹膜色素上皮细胞,视网膜色素上皮细胞,枸杞子
来源: 中国临床药理学与治疗学 2019年12期
年度: 2019
分类: 医药卫生科技
专业: 眼科与耳鼻咽喉科
单位: 湖南中医药大学中医诊断学湖南省重点实验室,湖南中医药大学中医学院,湖南中医药大学医学院
基金: 国家自然科学基金项目(81804150,81703920),中国博士后科学基金资助项目(2019M662790),湖南省自然科学基金项目(2019JJ50442,2019JJ40226),中医药防治眼耳鼻咽喉疾病湖南省重点实验室开放基金项目(2018YZD05),湖南中医药大学中医学一流学科开放基金项目(2018ZYX26,2018ZYX20)
分类号: R774.1
页码: 1402-1414
总页数: 13
文件大小: 6121K
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标签：视网膜色素变性论文; 生物信息学论文; 网络药理学论文; 虹膜色素上皮细胞论文; 视网膜色素上皮细胞论文; 枸杞子论文;