论文摘要
本研究对伞裙追寄蝇正常发育、滞育的蛹进行RNA测序,并对筛选出来的滞育关联基因进行KEGG通路富集分析,从分子水平解析伞裙追寄蝇滞育发育机理。本研究以正常发育、滞育40d的伞裙追寄蝇蛹为研究对象,分别抽提RNA,合成cDNA,构建cDNA文库,文库检测合格后进行Illummina Hiseq测序。根据测序结果,共获取unigene58 050个,平均长度为1 109bp。采用对正常发育组和滞育组进行差异表达分析,分别获得差异表达基因上调及下调分别为4 355个和3 158个。深入分析比对结果,将在padj<0.05且|log2～（FoldChange）|>1的unigene定义为滞育关联基因,共有846个基因为滞育关联基因。应用KEGG KAAS在线pathway比对分析工具对滞育关联基因进行通路富集分析,结果发现这些基因主要集中在碳水化合物代谢、氨基酸代谢、脂质代谢等途径中。
论文目录
文章来源
类型: 国内会议
作者: 张博,韩海斌,刘敏,宋米霞,刘爱萍
关键词: 伞裙追寄蝇,滞育,转录组测序,滞育关联基因,分析
来源: 中国植物保护学会2019年学术年会 2019-10-23
年度: 2019
分类: 基础科学
专业: 生物学
单位: 中国农业科学院草原研究所
分类号: Q78
页码: 218
总页数: 1
文件大小: 31k
下载量: 25
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