高选择性拓扑指数论文-吴婷,陈梦瑶,肖凯霞,周艳梅,张庆友

高选择性拓扑指数论文-吴婷,陈梦瑶,肖凯霞,周艳梅,张庆友

导读:本文包含了高选择性拓扑指数论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:化学键识别,高选择拓扑指数,富勒烯,手性中心自动设定

高选择性拓扑指数论文文献综述

吴婷,陈梦瑶,肖凯霞,周艳梅,张庆友[1](2019)在《化学键的高选择性拓扑指数及应用》一文中研究指出基于分子和原子的高选择性拓扑指数,提出了化学键的高选择性拓扑指数bATID.分别采用300余万个化学键的虚拟数据集和实际数据集检验bATID的唯一性,未发现简并,即bATID具有较强的化学键区分能力.进一步将bATID应用于有机化合物的化学键识别,获得了较好结果.如,利用bATID可识别出富勒烯C_(60)的90个化学键为30个6∶6键和60个5∶6键.研究还表明,bATID的化学键识别可应用于手性中心自动设定和自同构群穷举生成的顶点置换.(本文来源于《高等学校化学学报》期刊2019年06期)

武诚诚[2](2016)在《化合物的高选择性拓扑指数开发及唯一性验证》一文中研究指出EAID指数是一个高选择性的拓扑指数,由许禄教授所提出。我们采用超过1400万个分子验证该指数的唯一性,未发现简并。在本论文中简并的定义为:如果两个结构不同的化合物衍生出的某个拓扑指数具有相同值,也就是说这两个分子结构不能被此指数唯一性区分,则称此两个化合物简并。前述的化合物结构包括:含碳原子数1-22的链烷烃的380多万分子,含杂原子的38万多个分子,含1-13个苯环的400多万苯环型化合物和3个实际数据库(NCI,Pubchem,STocks)590多万个分子。然而,当用更大的数据集验证EAID指数唯一性时,出现了简并。在含碳原子数为23和24的2000多万分子的研究中,分别出现了5对和13对简并分子,同时,在对ZINC实际数据库的2000多万化合物分子的研究中出现了10对简并分子。这说明EAID指数对图论结构的唯一性区分仍存在不足,需要对其进一步改进。为了提高指数EAID的选择性,我们基于EAID指数提出了2-EAID指数,并采用前述共计5500多万个分子检验了2-EAID的唯一性。结果显示,只有在ZINC数据库中出现了2对简并分子,其他数据库无简并存在。很显然,与EAID相比,2-EAID指数的选择性得到了显着提高。我们尝试着探究如果将EAID指数与其他指数相结合,是否能提高指数的选择性。具体来说,我们结合Wiener指数和EAID指数衍生了新的拓扑指数,称为3-EAID。在对3-EAID指数进行唯一性测试时,我们不仅采用了2-EAID指数检验的所有数据集,还增加了2个数据集:(1)含25个碳原子的3600多万同分异构体分子;(2)含14个苯环的1500多万化合物。结果表明3-EAID指数可以完全区分所有实际数据库和虚拟数据库中的1.07多亿化合物分子。与其相对照,EAID指数对数据集(1)和(2)的验证结果分别是75和29对简并,2-EAID指数对数据集(1)和(2)的验证结果分别是15和1对简并。本文所用到的虚拟数据库源于实验室的内部程序,其中,饱和链烷烃与含杂原子分子是由我们实验室的结构生成器穷举生成的,苯环型化合物是由我们所发表的一个算法穷举所得的,实际数据库则是通过网络免费下载的。总之,根据我们的文献知识,含23-25个碳原子的链烷烃化合物穷举迄今尚属首次,而3-EAID指数是迄今为止区分能力最强的拓扑指数。截止2015年6月,在美国化学文摘服务社的世界上最大的化学数据库,注册的有机的和无机的化合物分子尚不足1亿。因此,3-EAID指数的化合物结构唯一性表征能力已具有潜在的实际应用价值,如:大型化合物数据库的管理,有机化合物结构的评价,计算机辅助药物合成。(本文来源于《河南大学》期刊2016-06-01)

索净洁,龙海林,李静亚,张丹丹,冯秀林[3](2011)在《高选择性拓扑指数EAID及其唯一性》一文中研究指出EAID是基于扩展连接矩阵而衍生成的拓扑指数,该指数包含各原子之间的连接关系和原子的性质。EAID指数具有高选择性,每个化合物均可以衍生成一个数学不变量,而不出现简并,这将为数据库的检索提供很大的方便。本文改进了EAID算法,克服了其对小分子区分能力的一个缺陷。(本文来源于《第十一届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集》期刊2011-08-05)

李创业,章文军,许禄[4](2006)在《高选择性拓扑指数和网络上化学结构的检索系统》一文中研究指出描述以高选择性拓扑指数EAID为基础构建的结构检索系统。此系统以EAID指数来表征化合物的结构,即每一化合物,运用EAID计算方案得到一个数学的量,以此为基础,来进行化合物结构的检索。由于是一简单数据的比较,所以检索准确快捷,适合于网络传输和交流。现已成功地应用于检索本实验室的结构数据库。另外,文中还介绍了EAID的算法和验证。(本文来源于《计算机与应用化学》期刊2006年10期)

胡昌玉,许禄[5](1996)在《有机化合物结构的唯一性表征方法研究──一个高选择性的拓扑指数》一文中研究指出以扩展连接矩阵EA的幂级数函数为基础,建立了一个新的拓扑指数EATI,该指数对1~22个碳原子的所有3807434个烷烃异构体的指认并不出现简并,且能区分含杂原子的化合物,其唯一性良好。该指数可用于数据库中替代CAS登录号进行结构的编码、管理及检索。(本文来源于《高等学校化学学报》期刊1996年09期)

高选择性拓扑指数论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

EAID指数是一个高选择性的拓扑指数,由许禄教授所提出。我们采用超过1400万个分子验证该指数的唯一性,未发现简并。在本论文中简并的定义为:如果两个结构不同的化合物衍生出的某个拓扑指数具有相同值,也就是说这两个分子结构不能被此指数唯一性区分,则称此两个化合物简并。前述的化合物结构包括:含碳原子数1-22的链烷烃的380多万分子,含杂原子的38万多个分子,含1-13个苯环的400多万苯环型化合物和3个实际数据库(NCI,Pubchem,STocks)590多万个分子。然而,当用更大的数据集验证EAID指数唯一性时,出现了简并。在含碳原子数为23和24的2000多万分子的研究中,分别出现了5对和13对简并分子,同时,在对ZINC实际数据库的2000多万化合物分子的研究中出现了10对简并分子。这说明EAID指数对图论结构的唯一性区分仍存在不足,需要对其进一步改进。为了提高指数EAID的选择性,我们基于EAID指数提出了2-EAID指数,并采用前述共计5500多万个分子检验了2-EAID的唯一性。结果显示,只有在ZINC数据库中出现了2对简并分子,其他数据库无简并存在。很显然,与EAID相比,2-EAID指数的选择性得到了显着提高。我们尝试着探究如果将EAID指数与其他指数相结合,是否能提高指数的选择性。具体来说,我们结合Wiener指数和EAID指数衍生了新的拓扑指数,称为3-EAID。在对3-EAID指数进行唯一性测试时,我们不仅采用了2-EAID指数检验的所有数据集,还增加了2个数据集:(1)含25个碳原子的3600多万同分异构体分子;(2)含14个苯环的1500多万化合物。结果表明3-EAID指数可以完全区分所有实际数据库和虚拟数据库中的1.07多亿化合物分子。与其相对照,EAID指数对数据集(1)和(2)的验证结果分别是75和29对简并,2-EAID指数对数据集(1)和(2)的验证结果分别是15和1对简并。本文所用到的虚拟数据库源于实验室的内部程序,其中,饱和链烷烃与含杂原子分子是由我们实验室的结构生成器穷举生成的,苯环型化合物是由我们所发表的一个算法穷举所得的,实际数据库则是通过网络免费下载的。总之,根据我们的文献知识,含23-25个碳原子的链烷烃化合物穷举迄今尚属首次,而3-EAID指数是迄今为止区分能力最强的拓扑指数。截止2015年6月,在美国化学文摘服务社的世界上最大的化学数据库,注册的有机的和无机的化合物分子尚不足1亿。因此,3-EAID指数的化合物结构唯一性表征能力已具有潜在的实际应用价值,如:大型化合物数据库的管理,有机化合物结构的评价,计算机辅助药物合成。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

高选择性拓扑指数论文参考文献

[1].吴婷,陈梦瑶,肖凯霞,周艳梅,张庆友.化学键的高选择性拓扑指数及应用[J].高等学校化学学报.2019

[2].武诚诚.化合物的高选择性拓扑指数开发及唯一性验证[D].河南大学.2016

[3].索净洁,龙海林,李静亚,张丹丹,冯秀林.高选择性拓扑指数EAID及其唯一性[C].第十一届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集.2011

[4].李创业,章文军,许禄.高选择性拓扑指数和网络上化学结构的检索系统[J].计算机与应用化学.2006

[5].胡昌玉,许禄.有机化合物结构的唯一性表征方法研究──一个高选择性的拓扑指数[J].高等学校化学学报.1996

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