黄芪AmMYB44基因的克隆与表达模式分析

黄芪AmMYB44基因的克隆与表达模式分析

论文摘要

以黄芪转录组测序获得的一条MYB基因为基础,进行克隆、生物信息学分析和荧光定量分析。克隆得到cDNA序列1 296 bp,其中包含一个长度为1 200 bp的开放阅读框,编码一个由399个氨基酸组成的蛋白质,命名为AmMYB44。预测黄芪MYB44蛋白的分子量为43.392 kD,等电点为6.39,平均亲水数是-0.459,不稳定系数为46.08,属于不稳定蛋白。实时荧光定量PCR分析显示,AmMYB44基因在干旱和低温条件下的表达均明显上调,但调节幅度存在组织差异、条件差异和处理时间的差异。在AmMYB44启动子上发现了多个与逆境和激素应答相关的顺式作用元件。推测AmMYB44基因在黄芪干旱、低温等非生物胁迫应答中具有重要的调控作用,本研究将促进黄芪的抗旱抗寒分子机制的研究。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 AmMYB44基因的全长序列的克隆
  •   1.2 AmMYB44序列编码蛋白特征分析及进化关系
  •   1.3 AmMYB44基因的组织和逆境表达模式分析
  •   1.4 AmMYB44启动子上的顺式作用元件预测
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 植物材料、载体、菌种及试剂
  •   3.2 全长AmMYB44基因的克隆
  •   3.3 AmMYB44基因生物信息学分析
  •   3.4 AmMYB44基因的组织和逆境表达模式分析
  •   3.5 AmMYB44启动子上的顺式作用元件预测
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李竹韵,焦子迅,陈阳,高飞,周宜君

    关键词: 黄芪,转录因子,克隆,表达模式分析

    来源: 基因组学与应用生物学 2019年08期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,医药卫生科技,农业科技

    专业: 生物学,农作物

    单位: 中央民族大学生命与环境科学学院

    基金: 国家自然科学基金项目(31670335,31770363),国家大学生创新训练计划(URTP2017110023)共同资助

    分类号: Q943.2;S567.239

    DOI: 10.13417/j.gab.038.003605

    页码: 3605-3613

    总页数: 9

    文件大小: 4398K

    下载量: 129

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