论文摘要
基于NCBI数据库,对文蛤过氧化氢酶基因（MmeCAT）进行生物信息学分析,旨在为文蛤过氧化氢酶的结构与功能的研究提供理论基础。结果表明,该基因编码511个氨基酸。文蛤过氧化氢酶分子量为58 181.29 Da,分子式为C2588H3928O767N730S20,理论等电点为8.05,属亲水蛋白。带负电荷氨基酸残基数（Asp+Glu）为63个,带正电荷氨基酸残基数（Arg+Lys）为65个。假设所有半胱氨酸全部形成胱氨酸,其消光系数为63 175 mol/L,相应的吸光度为1.086;假设所有的半胱氨酸均未形成胱氨酸时,消光系数为62 800 mol/L,相应的吸光度为1.079;其半衰期为30 h,脂肪族氨基酸指数为57.28,不稳定系数为27.77（<40）,可知文蛤过氧化氢酶为稳定蛋白质。亚细胞定位于过氧化物酶体,存在71个磷酸化位点和51个糖基化位点,无信号肽。二级结构以无规卷曲和α-螺旋为主,在物种进化上具有高度的保守性保守结构域预测表明,该基因编码蛋白可能属于典型单功能过氧化氢酶的第三分支。研究文蛤过氧化氢酶结构,能够为文蛤抗逆性品种选育提供理论基础。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 张志东,张雨,陈爱华,吴杨平,曹奕,陈素华,田镇,李秋洁
关键词: 文蛤,过氧化氢酶,生物信息学分析
来源: 生物信息学 2019年04期
年度: 2019
分类: 基础科学,农业科技
专业: 水产和渔业
单位: 江苏省海洋水产研究所,上海海洋大学水产与生命学院
基金: 江苏省渔业科技类重大项目(No.D2018-1),江苏省科技厅苏北专项(No.SZ-YC2018064),江苏省水产三新工程保种项目(No.BZ2018),南通市科技局基础科学研究项目(No.JC2018026)
分类号: S917.4
页码: 249-255
总页数: 7
文件大小: 10239K
下载量: 216