人血清结合珠蛋白的生物信息学分析

人血清结合珠蛋白的生物信息学分析

论文摘要

目的:对人血清结合珠蛋白(Hp)的生物信息学进行分析研究。方法:利用在线生物信息分析软件分析预测人血清Hp,利用生物信息学方法对人血清Hp的理化性质、跨膜区域、核定位序列、蛋白亲疏水性、信号肽、蛋白二、三级机构、蛋白互作及功能(GO)注释进行分析预测。结果:人血清Hp由406个氨基酸组成,等电点为6.13的酸性蛋白,是一种胞内蛋白,不具有跨膜区域,无核酸定位序列,为亲水性蛋白,具有信号肽序列。二级结构主要由α螺旋、β折叠和延伸链及无规则卷曲组成;三级结构预测模型可信度高,拉曼图谱表明预测结构稳定;蛋白互作和GO结果显示,Hp主要在炎性反应、抗氧化作用、细胞凋亡的正向调控、结合游离血红蛋白、受体介导的胞吞作用、蛋白水解以及细菌防御等过程中发挥重要作用。Hp与游离血红蛋白(Hb)结合形成Hp-Hb复合物,阻断血红蛋白诱导的氧化损伤。结论:通过生物信息学方法得到的人血清Hp预测结构具有可靠性,Hp在炎症反应、抗菌抗氧化作用以及促进血管生成等方便发挥重要功能,是血管内溶血性疾病的重要诊断指标。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 方法
  • 2 结果与分析
  •   2.1 人血清Hp的理化性质分析
  •   2.2 人血清Hp跨膜区域分析
  •   2.3 人血清Hp核定位序列预测分析
  •   2.4 人血清Hp亲疏水性预测分析
  •   2.5 人血清Hp信号肽预测分析
  •   2.6 人血清Hp二级结构预测分析
  •   2.7 人血清Hp三级结构预测分析
  •   2.8 人血清Hp相互作用蛋白预测分析
  •   2.9 人血清Hp功能注释分析
  • 3 讨论
  • 4 结语
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李秀荣,孙雪,任怡然,高瀛岱

    关键词: 结合珠蛋白,溶血,生物信息学

    来源: 中国医学装备 2019年10期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,基础科学

    专业: 生物学,基础医学

    单位: 中国医学科学院血液病医院(血液学研究所)实验血液学国家重点实验室

    分类号: R341;Q811.4

    页码: 89-93

    总页数: 5

    文件大小: 2546K

    下载量: 153

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    人血清结合珠蛋白的生物信息学分析
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