一株类禽型H1N1猪流感病毒的进化分析与分子特征

一株类禽型H1N1猪流感病毒的进化分析与分子特征

论文摘要

2017年12月,上海市一养殖场饲养的猪出现咳嗽、呼吸困难、发热及迅速转归等病症。将猪鼻拭子接种鸡胚进行病毒分离,对血凝试验阳性样品在SPF鸡胚上进一步纯化、增殖,分离到1株猪流感病毒(A/swine/Shanghai/1205/2017)。采用RT-PCR对分离毒株进行全基因组扩增测序,利用DNAstar软件,对测序基因片段进行整个阅读框的核苷酸序列同源性比对分析,并用MEGA 6绘制遗传进化树并分析氨基酸位点。结果显示:分离毒株为H1N1亚型,其8个基因片段均属于类禽型H1N1进化分支,没有出现不同基因型流感病毒片段之间的重组;分离株HA蛋白的裂解位点序列为PSIQSR↓G,具有典型低致病性流感病毒的分子特征。本毒株的分离鉴定为分析我国大陆地区的猪流感流行状况和分子特征提供了参考。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 试剂、引物和鸡胚
  •   1.2 样品采集
  •   1.3 病毒初步分离与鉴定
  •   1.4 病毒全基因序列测定与分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 病毒初步分离鉴定
  •   2.2 病毒核苷酸序列同源性分析
  •   2.3 病毒核苷酸遗传演化分析
  •   2.4 病毒分子特征分析
  •     2.4.1 HA抗原位点和受体结合位点分析
  •     2.4.2 糖基化位点分析
  •     2.4.3 致病力和抗药位点分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李鑫,葛菲菲,刘健,李壮壮,吴杰,杨德全,鞠厚斌,周锦萍

    关键词: 猪流感病毒,类禽型,遗传进化树,分子特征

    来源: 中国动物检疫 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 上海市动物疫病预防控制中心,扬州大学生物科学与技术学院

    基金: 上海市科技兴农重点攻关项目(沪农科基字﹝2014﹞第3-2号)

    分类号: S852.651

    页码: 80-87

    总页数: 8

    文件大小: 1657K

    下载量: 137

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