2014-2017年中国部分地区PEDV流行株S基因遗传进化分析

2014-2017年中国部分地区PEDV流行株S基因遗传进化分析

论文摘要

参考GenBank中PEDV经典CV777毒株基因组序列设计特异性引物,采用RT-PCR方法对临床采集的疑似PEDV样品进行S基因扩增、克隆和测序,拼接获得30条完整S基因序列,并进行遗传进化及同源性分析。结果显示,获得的30条PEDV S基因与25个参考株S基因的核苷酸相似性介于93.6%~99.8%;且各流行毒株与经典毒株比较,具有多处的点突变、插入和缺失。与其他参考株相比,S1区存在157个氨基酸突变位点,占总数的65.7%(157/239),暗示PEDV的S1区域比S2区域易发生变异;表明目前中国PEDV流行株已经发生了变异,在一定程度揭示了免疫猪群仍然发病的原因。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 病料样品
  •   1.2 主要试剂
  •   1.3 引物设计与合成
  •   1.4 样品中RNA的提取及c DNA合成
  •   1.5 PCR扩增
  •   1.6 S1和S2基因的克隆与序列分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 临床样品检测结果
  •   2.2 S1、S2基因扩增结果
  •   2.3 S基因序列同源性及氨基酸差异性分析
  •   2.4 S基因的遗传演化关系
  • 3 讨论与结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 郑慧华,张鸿鑫,韩昊莹,乔涵,赵宇,陈红英

    关键词: 基因,遗传进化分析,变异

    来源: 安徽农业大学学报 2019年02期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 河南农业大学牧医工程学院,郑州市猪重大疫病防控重点实验室

    基金: 河南省产学研合作计划项目(152107000003)资助

    分类号: S852.651

    DOI: 10.13610/j.cnki.1672-352x.20190320.008

    页码: 249-255

    总页数: 7

    文件大小: 300K

    下载量: 63

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