导读:本文包含了差异表达序列标签论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:序列,差异,标签,毛囊,信息学,卵泡,乌骨鸡。
差异表达序列标签论文文献综述
苏立宁,李华,刘东军,旭日干[1]（2012）在《内蒙古绒山羊皮肤毛囊差异表达序列标签的筛选及分析》一文中研究指出旨在筛选和分析内蒙古绒山羊与毛和绒生长相关的差异基因,本研究采用mRNA差异显示技术(DDRT-PCR)研究内蒙古绒山羊胎儿期不同日龄皮肤中控制初级毛囊和次级毛囊不同分化的差异表达序列标签。结果,共筛选了15条差异表达序列标签(dbEST登录号JK711022-JK711036),其中3条ESTs与毛囊发育有关,5条ES-Ts与次级毛囊和皮脂腺的发育有关。生物信息分析显示,JK711036与甲状腺激素受体相互作用蛋白12(TRIP12)基因有关,其他ESTs功能未知。结果表明,胎儿期初级毛囊和次级毛囊在多种代谢途径上都存在差异表达的基因,这将为进一步研究山羊毛和绒的形成分子机制奠定基础。(本文来源于《畜牧兽医学报》期刊2012年09期）
邹波,季平,孙守娟,漆小娟[2]（2011）在《舌鳞癌干细胞相关差异表达序列标签的生物信息学分析》一文中研究指出目的:对利用抑制消减杂交技术获得的舌鳞癌干细胞相关表达序列标签(Expressed squence tag,EST)进行电子克隆及序列分析。方法:利用互联网上的公共数据库及生物信息学分析软件对获得的舌鳞癌干细胞相关差异表达序列标签进行核酸序列和蛋白质序列分析,探索克隆差异表达基因的研究方法和策略。结果:通过电子延伸得到1个1 705 bp的cDNA序列;核酸序列分析显示,该cDNA定位在1号染色体,含有1个编码146个氨基酸的完整开放阅读框;对氨基酸序列进行结构域预测显示其存在1个与Translin超家族同源的区域;BLAST比对显示该氨基酸序列与Translin相关蛋白X(Translin associatedprotein X,TRAX)具有较高的同源性。结论:利用生物信息学技术获得了舌鳞癌相关表达序列标签的基本信息,为深入研究该表达序列标签的功能奠定基础。(本文来源于《重庆医科大学学报》期刊2011年10期）
杨华,杨永林,王宁,李辉,沈敏[3]（2011）在《应用mRNA差异显示技术筛选绵羊皮肤毛囊差异表达序列标签》一文中研究指出为寻找与绵羊羊毛生长相关的基因,应用mRNA差异显示技术(DD-PCR)筛选拔毛皮肤与正常皮肤表达水平有差异的cDNA,用Northern blot证实差异显示基因片段,对差异基因进行测序和同源比较。经差异显示分析,共找到差异表达的序列片段21个;经2次扩增、克隆、Northern Blot分析,最终确定2个差异条带SQ70和SQ75。对这两个差异条带进行测序及生物信息学分析,发现SQ70是绵羊皮肤中与组织修复相关的EST片段,而SQ75是绵羊皮肤或者是毛囊中高表达的未知EST片段。以上结果表明,SQ70和SQ75可能是与绵羊羊毛生长密切相关的基因表达产物,对于这两个ESTs具体的生物学功能有待于进一步研究。(本文来源于《中国草食动物》期刊2011年02期）
李亮,赵小玲,李琴,朱庆[4]（2010）在《利用mRNA差异显示技术筛选丝羽乌骨鸡肝脏差异表达序列标签》一文中研究指出为了找出可能与丝羽乌骨鸡独特性状形成相关的基因,本研究运用差异显示PCR技术等对丝羽乌骨鸡与快大型肉鸡肝脏组织中差异表达的基因进行筛选,并通过生物信息学方法对所筛选出的差异表达序列标签进行分析。结果,本研究共筛选得到10条丝羽乌骨鸡与快大型肉鸡肝脏差异表达序列标签(dbEST登录号:CN606328~CN606329、CN606331~CN606338)。生物信息学分析结果显示:10条ESTs中,CN606332和CN606336是家鸡的18S rRNA基因部分序列,CN606333与编码家鸡热休克蛋白70的基因(HSPA5)同源,CN606328、CN606331与家鸡已有核酸数据库中的cDNA克隆或EST具有较高相似性,但功能未知。其他5条表达序列标签在家鸡核酸数据库中未发现相似序列,但分别与其他物种的细胞膜蛋白基因、γ-谷氨酰转肽酶(gamma-glutamyl transpeptidase)基因、ATP-binding cassette transporter基因、推定蛋白MGC27019基因以及异常纺锤型小脑畸形症(abnormalspindle microcephaly,ASPM)蛋白基因有不同程度的相似性。本研究结果表明,丝羽乌骨鸡与快大型肉鸡可能在多种代谢途径上都存在差异表达的基因,通过进一步深入研究这些差异表达基因,可以为研究丝羽乌骨鸡独特性状的形成提供重要的信息。(本文来源于《畜牧兽医学报》期刊2010年04期）
王芹,岳井银,李进,宋力,刘强[5]（2009）在《辐射抗性小鼠与其亲代差异基因的表达序列标签》一文中研究指出目的寻找IRM-2小鼠体内存在的与辐射抗性相关的基因。方法提取IRM-2小鼠和其亲代小鼠脾细胞总RNA,利用mRNA差异显示技术挑选差异表达片段,对每一条差异带进行特异PCR扩增、克隆和测序。结果获得IRM-2小鼠独有而亲代小鼠均无的cDNA差异带75条,经测序获得52条差异cDNA序列。与GenBank基因库同源性比较,得到21条与小鼠已知基因不同源的表达序列标签(EST)。结论21条EST提示IRM-2小鼠体内可能存在辐射抗性相关基因,为进一步分离和鉴定辐射抗性相关基因奠定了基础。(本文来源于《苏州大学学报(医学版)》期刊2009年01期）
和凤美,朱永平,张义正[6]（2008）在《叁七根差异基因表达序列标签生物信息学分析》一文中研究指出本研究利用生物信息学方法,对从叁七根抑制消减杂交cDNA文库中随机挑选的91个EST序列进行了分析。结果表明:91个克隆组装分析后有4个重迭群和83个单拷贝EST,代表了87个基因。已知功能的基因序列共58个,占66%,按基因功能分类为10类,其中大多基因与代谢途径和分泌途径有关。未知功能基因序列29个,占33%。对33个氨基酸序列可通读的EST进行跨膜结构和信号肽分析,结果表明:9个克隆有信号肽,其中3个克隆有跨膜结构,可能为膜蛋白,6个克隆可能为分泌蛋白。功能位点分析结果表明:大多数基因与胞外分泌,调节细胞凋亡和细胞周期,信号传导有关。功能结构域分析结果表明:除9个克隆没有预测到功能结构域外,其它克隆的结构域与信号传导,转录调控,电子传递,协迫,光合作用,蛋白折迭等有关。亚细胞定位大多数位于细胞质和细胞核。(本文来源于《山东农业大学学报(自然科学版)》期刊2008年04期）
宋焱艳[7]（2008）在《大鼠肝癌变进程中差异表达序列标签的初步筛选及分析》一文中研究指出目的:采用mRNA差异显示反转录聚合酶链式反应技术(DDRT-PCR)筛选大鼠肝癌变不同时期的差异表达序列标签(Express sequence tags, ESTs),探索肝癌发生和发展的分子机理。方法:用二乙基亚硝胺(Diethylnitrosamine, DENA)作诱癌剂建立SD大鼠肝癌变不同时期的动物模型。自给药起,分别在14d、28d、56d、77d、105d、112d处死大鼠,取其肝组织,用mRNA差异显示技术(DDRT-PCR)研究不同病理时期差异表达的基因,克隆与测序后用生物信息学方法对测序结果进行分析。结果:获得12条差异表达片段。其中有3个片段(EST-1,EST-3,EST-5)在大鼠ESTs数据库和基因组数据库中均未找到同源序列,可能是新基因片段;有1个差异表达片段EST-12在大鼠ESTs数据库中未找到同源序列,但与基因组数据库中的蛋白激酶C- alpha基因有95%的同源性,可以认为是该基因的同源序列,可作为大鼠新的EST;有2个差异表达片段EST-7和EST-11分别与大鼠BN/SsNHsdMCW线粒体基因片段和酪氨酸/色氨酸单加氧酶激酶基因片段同源性达100%,可以认为分别是上述二种基因的部分序列,但BN/SsNHsdMCW线粒体基因编码蛋白尚未知晓;其余6个差异表达片段(EST-2、EST、EST-6、EST-8、EST-9和EST-10)在大鼠已知ESTs数据库和基因组数据库中的均找到与其同源达97%以上的序列,可以认为是已知基因的同源序列。结论:初步筛选出12个肝癌变进程中差异表达的ESTs,其中9个为已知基因片段, 3个为新基因片段。EST-7与大鼠线粒体BN/SsNHsdMCW基因片段同源性达100%,可以认为是该基因的一段序列。本研究首次发现线粒体BN/SsNHsdMCW基因在大鼠肝癌变各时期的差异表达情况。(本文来源于《河南师范大学》期刊2008-04-01）
李波[8]（2007）在《鹅卵泡差异显示表达序列标签（ESTs）的筛选及分析》一文中研究指出本研究以产蛋期扬州鹅为研究材料,采用Oligo(dT_(10))M(A/G/C)为锚定引物与23个随机引物之间共69个组合的RT-PCR反应对成熟卵泡总RNA进行DDRT-PCR分析,并利用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳结合银染技术分离DDRT-PCR产物,共获得差异条带18条。经过PCR再扩增、电泳检测和纯化,共得到差异显示的cDNA片段10条。经二次PCR与第一次PCR结果比较,再经Dot-blot验证后得到7条差异表达cDNA片段,委托上海杰瑞生物工程有限公司克隆测序,获得5个表达序列标签,且经1.5%琼脂糖电泳检测显示这些条带比非差异显示条带弱,推测差异表达的基因表达丰度低。五个差异显示ESTs去除载体序列后用Blast检索发现:在这5条差异表达片段中,EST_YZGF01与人甲硫氨酸腺苷基转移酶II(MAT II)同源,同源性为95%,EST_YZGF02与鸡mKIAA0840 protein基因同源,同源性为94%。其余EST_YZGF03、EST_YZGF04、EST_YZGF05个与已知基因或序列无任何同源性,可能是尚未发现的新基因。最小的排卵前卵泡(SPF) MAT IIβ亚基表达水平的上升可能通过增加E2合成途径的原料来增加E2水平,或上调抗凋亡基因的表达而利于卵泡的选择。而FBXL-7可能通过参与SCF复合体的形成,降解一种转录的激活因子或抑制因子而参与卵泡的选择。(本文来源于《扬州大学》期刊2007-05-01）
刘永刚,熊远着,左波,蒋思文,邓昌彦[9]（2006）在《梅山猪、大白猪和梅大杂交猪背最长肌中差异表达的14个表达序列标签的分离、鉴定及组织表达分析(英文)》一文中研究指出为了揭示猪杂种优势的分子机理,利用mRNA差异显示技术研究梅山猪,大白猪和梅大杂交猪背最长肌中基因表达的差异,分离14条在杂种与纯种背最长肌中差异表达的表达序列标签(EST),并用半定量RT-PCR鉴定。核苷酸序列分析表明,这14个EST与已知的基因或表达序列标签没有明显的同源性,随后这14条EST被提交到GenBank数据库。组织表达谱分析揭示了这些EST在心、脾、肝、肾、小肠、卵巢、肺等绝大多数组织中表达,说明这些基因对生命过程很重要。这些研究结果表明梅山×大白杂交组合的杂种与纯种之间的不同基因差异表达的方向存在巨大差异,猪杂种优势可能是在一定阶段有诸多不同的必不可少的基因向各种方向差异表达共同作用的结果。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2006年03期）
金红建,邵健忠,项黎新[10]（2005）在《表达序列标签数据库搜索克隆斑马鱼QM基因及其数字化差异显示分析》一文中研究指出QM基因是一种与肿瘤抑制、细胞生长、分化、发育和凋亡等有关的重要基因,已在人类及许多物种中得到了克隆,但鱼类中尚无报道。我们利用表达序列标签数据库和电子克隆等技术,成功克隆了斑马鱼QM基因,并对该基因的结构进行了系统分析。结果显示,斑马鱼QM基因cDNA全长769bp,含648bp开放阅读框架,编码215个氨基酸,5’UTR25bp,3’UTR122bp,所编码的QM多肽分子量24.6kDa,等电点(pI)10.6,含潜在的蛋白酶C磷酸化位点、N-酰基化位点和酰胺化位点。比较斑马鱼QM和人等13个物种QM的同源性,发现其氨基酸序列相似性为66%~92%。数字化差异显示分析结果表明,QM基因在斑马鱼胚胎及成体多种组织中均有广泛表达。研究结果为今后利用生物信息学快速克隆新的鱼类功能基因打下了方法学基础,也为进一步研究鱼类QM基因功能提供了依据。(本文来源于《水产学报》期刊2005年05期）
差异表达序列标签论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的:对利用抑制消减杂交技术获得的舌鳞癌干细胞相关表达序列标签(Expressed squence tag,EST)进行电子克隆及序列分析。方法:利用互联网上的公共数据库及生物信息学分析软件对获得的舌鳞癌干细胞相关差异表达序列标签进行核酸序列和蛋白质序列分析,探索克隆差异表达基因的研究方法和策略。结果:通过电子延伸得到1个1 705 bp的cDNA序列;核酸序列分析显示,该cDNA定位在1号染色体,含有1个编码146个氨基酸的完整开放阅读框;对氨基酸序列进行结构域预测显示其存在1个与Translin超家族同源的区域;BLAST比对显示该氨基酸序列与Translin相关蛋白X(Translin associatedprotein X,TRAX)具有较高的同源性。结论:利用生物信息学技术获得了舌鳞癌相关表达序列标签的基本信息,为深入研究该表达序列标签的功能奠定基础。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
差异表达序列标签论文参考文献
[1].苏立宁,李华,刘东军,旭日干.内蒙古绒山羊皮肤毛囊差异表达序列标签的筛选及分析[J].畜牧兽医学报.2012
[2].邹波,季平,孙守娟,漆小娟.舌鳞癌干细胞相关差异表达序列标签的生物信息学分析[J].重庆医科大学学报.2011
[3].杨华,杨永林,王宁,李辉,沈敏.应用mRNA差异显示技术筛选绵羊皮肤毛囊差异表达序列标签[J].中国草食动物.2011
[4].李亮,赵小玲,李琴,朱庆.利用mRNA差异显示技术筛选丝羽乌骨鸡肝脏差异表达序列标签[J].畜牧兽医学报.2010
[5].王芹,岳井银,李进,宋力,刘强.辐射抗性小鼠与其亲代差异基因的表达序列标签[J].苏州大学学报(医学版).2009
[6].和凤美,朱永平,张义正.叁七根差异基因表达序列标签生物信息学分析[J].山东农业大学学报(自然科学版).2008
[7].宋焱艳.大鼠肝癌变进程中差异表达序列标签的初步筛选及分析[D].河南师范大学.2008
[8].李波.鹅卵泡差异显示表达序列标签（ESTs）的筛选及分析[D].扬州大学.2007
[9].刘永刚,熊远着,左波,蒋思文,邓昌彦.梅山猪、大白猪和梅大杂交猪背最长肌中差异表达的14个表达序列标签的分离、鉴定及组织表达分析(英文)[J].农业生物技术学报.2006
[10].金红建,邵健忠,项黎新.表达序列标签数据库搜索克隆斑马鱼QM基因及其数字化差异显示分析[J].水产学报.2005
论文知识图
