果蝇不同细胞组分转录本多样性

果蝇不同细胞组分转录本多样性

论文摘要

真核生物基因通过可变转录起始位点、可变剪切和可变多聚腺苷酸化产生多个转录本异构体(transcript isoform)。由于不同转录本异构体的翻译情况有时会有较大的不同,这就导致转录本的多样性和蛋白产物之间的对应关系比较复杂。本文中,笔者收集了果蝇早期胚胎细胞转录组数据和翻译组数据,并通过系统的分析展示了不同细胞组分转录本组成异同。通过对转录组数据和翻译组数据进行比较分析,一共发现766个基因的转录本相对表达水平在果蝇不同细胞组分中发生了改变,这表明在果蝇中大量基因的不同转录本的翻译效率差异可能很大。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 数据
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 高通量数据分析
  •     1.2.2 主要表达转录本分析
  • 2 结果与讨论
  •   2.1 数据比对结果
  •   2.2 相关性分析结果
  •   2.3 不同细胞组分主要表达转录本分析结果
  •   2.4讨论
  • 3结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 刘秋芳,李华

    关键词: 转录本异构体,转录组,翻译组,果蝇

    来源: 生物加工过程 2019年02期

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 上海交通大学生物医学工程学院

    基金: 国家自然科学基金(31501054)

    分类号: Q78

    页码: 166-170

    总页数: 5

    文件大小: 509K

    下载量: 62

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