矮牵牛PhWRIL1基因功能的分析

矮牵牛PhWRIL1基因功能的分析

论文摘要

矮牵牛PhWRIL1(Petunia hybrida WRINKLED Like 1)基因属于AP2/ERF(APETALA2/ETHYLENE-RESPONSIVE ELEMENT-BINDING FACTOR)家族ANT(AINTEGUMENTA)组的basalANT亚组。AP2基因家族可分为euAP2和ANT组,其中ANT含有10-aa和1-aa这两段插入,而euAP2缺失这两段插入。ANT组又可以进一步分为euANT和basalANT亚组,euANT亚组在N端的R1结构域上游有3个保守基序(euANT2,3和4基序),而basalANT亚组没有这3个基序,并且euANT亚组的R1结构域上游序列的长度比basal ANT亚组的长。AP2基因家族的euAP2组基因主要调控植物花发育过程花分生组织的特性和花器官的分化。euANT亚组基因主要参与调控细胞增殖和器官生长,花器官发育,促进体细胞胚胎发生和异位器官形成等过程。basalANT组与eu ANT亚组亲缘关系很近,现在已知的主要功能是调控油脂生物合成,但尚未有关于与euANT支亲缘关系很近的AP2/ERF基因basalANT进化支基因超量表达对离体培养中不定芽再生影响的研究。研究矮牵牛basalANT组的PhWRIL1基因的功能特别是在离体再生方面的功能不仅有助于认识basalANT亚组基因在矮牵牛的植物生长发育中的作用,同时对利用基因工程手段对矮牵牛的性状进行改造、提高矮牵牛的观赏性具有重要意义。本实验通过构建矮牵牛basalANT组的PhWRIL1基因的超表达以及定点敲除的表达载体,并对T1代转基因植株和E1(Genome Editing 1)代突变体的表型以及离体培养结果进行观察分析来研究矮牵牛basalANT组PhWRIL1基因的功能。取得了以下研究成果:1.矮牵牛PhWRIL1(WRINKLED Like 1)基因的克隆和序列分析以矮牵牛自交系‘Mitchell Diploid’(MD)为材料,通过EST(expressed sequence tagged)数据库搜索和RACE技术从矮牵牛中克隆了一个AP2/ERF家族基因PhWRIL1,进行测序得到其cDNA序列。PhWRIL1基因的CDS(Coding Sequence)长945 bp,编码314个氨基酸的蛋白质,编码框两端有161 bp的3’-UTR(3’-untranslated region)和196 bp的5’-UTR(5’-untranslated region)。序列分析和进化树分析表明,PhWRIL1属于basalANT类基因。2.矮牵牛PhWRIL1基因组织特异性分析实时荧光定量PCR分析表明PhWRIL1 mRNA在矮牵牛多种器官中累积,其中在矮牵牛根、茎、花蕾中的PhWRIL1比茎尖、叶中的表达量更高。3.PhWRIL1超量表达载体转化矮牵牛的T1代转基因植株的表型观察超量表达PhWRIL1的矮牵牛转基因植株呈现明显的矮化表型,植株生长发育不良,叶和花明显比对照小,但开花时间并未因外源基因的表达而明显延迟。用2.5μmol/L 6-BA(6-苄氨基腺嘌呤)对T1代PhWRIL1超量表达转基因株系矮牵牛进行离体培养,PhWRIL1超量表达转基因植株叶片外植体再生不定芽的能力受到强烈的抑制。4.PhWRIL1定点敲除载体转化矮牵牛和E1代突变体表型观察在PhWRIL1基因5’端靠近翻译起始位点的区域选择一个靶点,构建敲除PhWRIL1的植物表达载体,农杆菌介导法转化矮牵牛,经过Basta筛选并通过PCR检测分别获得了单碱基突变和片段缺失的突变体株系,然后得到种子进行播种以获得用于表型观察的E1代突变体株系。观察发现:与对照相比,PhWRIL1基因敲除的矮牵牛转基因植株有矮化现象,叶片表面积较小,开花时间延迟。使用0.5μmol/L 6-BA对矮牵牛E1代突变体株系进行离体培养,PhWRIL1定点敲除载体E1代突变体株系外植体再生芽数和培养物质量要低于对照外植体的再生芽数和培养物质量,说明PhWRIL1定点敲除突变体再生不定芽的能力受到抑制。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 第1章 文章综述
  •   1.1 矮牵牛概述
  •   1.2 AP2/ERF基因家族命名,结构及分类
  •   1.3 AP2组euAP2组基因的相关功能
  •   1.4 AP2组ANT组基因的相关功能
  •     1.4.1 ANT组euANT亚组基因的相关功能
  •     1.4.2 ANT组basalANT亚组基因的相关功能
  •   1.5 CRISPR/Cas9技术
  •     1.5.1 CRISPR/Cas9的概述
  •     1.5.2 CRISPR/Cas9技术在其他植物中的应用
  •     1.5.3 CRISPR/Cas9技术在矮牵牛中的应用
  • 第2章 引言
  •   2.1 研究背景及意义
  •   2.2 技术路线
  • 第3章 矮牵牛PhWRIL1超量表达载体的构建和T1代转基因植株的表型观察
  •   3.1 实验材料与试剂
  •     3.1.1 植物材料
  •     3.1.2 主要仪器设备与耗材
  •     3.1.3 主要化学试剂及试剂盒
  •     3.1.4 自配的主要试剂和常用培养基配方
  •     3.1.5 矮牵牛转化基本培养基
  •   3.2 实验方法
  •     3.2.1 植物材料的处理和种植
  •     3.2.2 简并引物和特异引物的设计及合成
  •     3.2.3 矮牵牛cDNA第一链的合成
  •     3.2.4 3'RACE和 5'RACE PCR扩增
  •     3.2.5 PCR扩增目标DNA片段的回收
  •     3.2.6 目标DNA片段与克隆载体pMD19-T连接
  • 2法制备大肠杆菌DH5α 感受态细胞'>    3.2.7 CaCl2法制备大肠杆菌DH5α 感受态细胞
  •     3.2.8 连接产物转化大肠杆菌感受态细胞
  •     3.2.9 阳性克隆培养与鉴定、测序
  •     3.2.10 阳性菌液测序及序列分析
  •     3.2.11 超表达载体的构建
  •     3.2.12 农杆菌GV3101冻融法感受态的制备
  •     3.2.13 电击杯的处理及农杆菌电转化感受态细胞的转化
  •     3.2.14 农杆菌介导矮牵牛的转化
  •     3.2.15 PhWRIL1超量表达转基因植株的表型观察
  •     3.2.16 PhWRIL1超量表达转基因植株的再生能力测定
  •     3.2.17 总RNA提取和实时RT-PCR分析
  •   3.3 结果与分析
  •     3.3.1 矮牵牛PhWRIL1基因的克隆和序列分析
  •     3.3.2 PhWRIL1基因在矮牵牛各种组织中的表达分析
  •     3.3.3 PhWRIL1超表达载体的构建
  •     3.3.4 PhWRIL1-OX(overexpression)转基因株系的表型观察
  •     3.3.5 PhWRIL1的超量表达抑制叶片外植体再生不定芽
  •   3.4 讨论
  • 第4章 矮牵牛PhWRIL1定点敲除载体的构建和E1代突变体表型观察
  •   4.1 实验材料和试剂
  •     4.1.1 植物材料
  •     4.1.2 主要仪器设备与耗材
  •     4.1.3 主要化学试剂及试剂盒
  •     4.1.4 常用试剂配制和各类培养基
  •   4.2 实验方法
  •     4.2.1 植物材料的处理和种植
  •     4.2.2 矮牵牛PhWRIL1定点敲除载体构建
  •     4.2.3 农杆菌介导的遗传转化
  •     4.2.4 CATB法提取矮牵牛基因组DNA
  •     4.2.5 突变体的鉴定
  •     4.2.6 E1代突变体植株的表型观察
  •     4.2.7 再生能力测定
  •   4.3 结果与分析
  •     4.3.1 矮牵牛PhWRIL1定点敲除载体的构建
  •     4.3.2 转基因植株的获得
  •     4.3.3 E0代突变体的鉴定
  •     4.3.4 E1代突变体植株的纯合突变体的鉴定
  •     4.3.5 E1代突变体植株的表型观察
  •     4.3.6 E1代突变体再生能力测定
  •   4.4 讨论
  • 第5章 总结
  •   5.1 主要结果
  •   5.2 下一步计划
  • 参考文献
  • 缩略词表
  • 致谢
  • 发表论文及参加课题一览表
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 梁玲鸽

    导师: 郭余龙

    关键词: 矮牵牛,表达分析,表型观察,不定芽再生

    来源: 西南大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,生物学,园艺

    单位: 西南大学

    分类号: Q943.2;S681.9

    总页数: 77

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