微生物群落结构和功能论文-梁宗林,秦亚玲,王沛,王保军,刘征华

微生物群落结构和功能论文-梁宗林,秦亚玲,王沛,王保军,刘征华

导读:本文包含了微生物群落结构和功能论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:酸性矿山排水,高通量测序,微生物多样性,群落结构

微生物群落结构和功能论文文献综述

梁宗林,秦亚玲,王沛,王保军,刘征华[1](2019)在《云南省蒙自酸性矿山排水微生物群落结构和功能》一文中研究指出为探究酸性矿山排水生态系统不同环境中的微生物群落和功能,全面了解酸性矿山排水的形成和发展规律,采用高通量测序技术研究云南省蒙自某矿区酸矿水坑和周边溪水中的原核微生物群落组成,并结合样本理化特征分析影响群落结构的主要因素,进而解析菌群的环境功能。研究发现酸矿水坑中主要有广古菌门、变形菌门(包括α、γ和δ变形菌纲)、硝化螺菌门、厚壁菌门、放线菌门和酸杆菌门等类群,与周边溪水的群落结构具有明显差异。群落多样性与pH呈显着正相关,而热原体纲(Thermoplasmata)与pH呈负相关,可对群落结构起主导作用。酸矿水坑不同样本中均具有高丰度的亚铁原体属Ferroplasma (6.60%–86.34%),酸硫杆菌属Acidithiobacillus是酸矿水和沉积泥中主要的铁、硫氧化细菌,而专性铁氧化的钩端螺旋菌属Leptospirillum的丰度较低,铁卵形菌属Ferrovum几乎只存在于酸矿水中;此外,嗜酸或耐酸的异养菌广泛分布于酸矿水和沉积泥中,它们可促进铁、硫氧化菌的生长及催化矿石溶解。结果表明,pH通过影响微生物多样性和菌群分布而对酸性矿山排水环境微生物群落结构造成重大影响。(本文来源于《生物工程学报》期刊2019年11期)

刘鹏远,张海坤,陈琳,孙延瑜,王彩霞[2](2019)在《黄渤海海草分布区日本鳗草根际微生物群落结构特征及其功能分析》一文中研究指出日本鳗草(Zostera japonica)是亚洲特有的海草种类,具有重要生态价值。近年来,黄渤海海草分布区中的日本鳗草海草床持续退化,引起了研究人员的广泛关注。【目的】基于根际微生物的分布与日本鳗草的健康生长密切相关的设想,本文旨在探究黄渤海海草分布区日本鳗草根际细菌群落结构多样性并分析其与海草健康生长的内在联系。【方法】选取黄渤海海草分布区中东营、威海、大连3个地点的日本鳗草根际与非草区表层沉积物,采用高通量测序技术(Illumina HiSeq PE300)解析根际微生物群落特征,并结合相关环境参数分析其环境功能。【结果】日本鳗草根际表层沉积物中主要存在的细菌类群有:变形菌门(Proteobacteria)所占比例为41.1%,蓝细菌门(Cyanobacteria)占15.4%,拟杆菌门(Bacteroidetes)占12.6%,放线菌门(Actinobacteria)占9.3%。不同地点之间以及样品类型(海草床根际与非根际)之间的微生物群落存在显着差异,主要表现为根际富含硫酸盐还原菌和固氮菌。环境因素:TN (total nitrogen)、TC (total carbon)、TOC (total organic carbon)、黏土(Clay)、砷(As)与根际群落组成与分布显着相关。【结论】从功能的角度来看,不同地点、不同样品类型之间的差异物种多与硫、氮代谢相关,硫酸盐还原菌对维持日本鳗草的生态健康起关键作用;日本鳗草根际微生物群落分布与环境因子、空间分布有一定相关性。(本文来源于《微生物学报》期刊2019年08期)

温昕承昊[3](2019)在《峰峰矿区叁种植物根围土壤微生物群落结构及功能多样性研究》一文中研究指出随着我国经济的快速发展,对矿产资源消耗量与日俱增,也对矿区周边生态环境造成了严重破坏。矿产资源开采利用过程中,大量重金属元素外泄,通过地表径流作用进入周边区域,导致矿区周围土壤不同程度的重金属污染。由于重金属污染具有长期性、不可逆性和累积性,所以由重金属引发的环境问题受到广泛关注。而土壤微生物作为植物—土壤生态系统的重要组成部分,其群落活性与土壤健康状况关系密切,群落活动对植物生长发育具有重要促进作用,是生物修复的基础,对土壤微环境也存在监测功能,在整个生态系统的结构优化与功能塑造方面占有重要地位。研究重金属污染矿区微生物的结构和功能特征,可以阐明微生物的生态功能,对污染区生境恢复和植物保护具有重要意义。本文选择河北峰峰矿区作为研究样地,采集冬青(Ilex chinensis)、构树(Broussonetia papyrifera)、小檗(Berberis kawakamii)3种常见绿化植被根围土壤,利用磷脂脂肪酸(PLFA)和BIOLOG方法分析土壤微生物群落与功能多样性,结合土壤环境因子,探讨植物与土壤对微生物群落的影响,为重金属污染区域生态环境恢复提供依据。主要试验结果如下:1、峰峰矿区土壤微生物群落结构与功能代谢在植被间差异显着。土壤磷脂脂肪酸含量表现为:小檗>构树>冬青;不同碳源利用强度表现为:小檗>构树≈冬青。小檗土壤环境更适合微生物生存,是矿区恢复的理想植被。2、峰峰矿区土壤微生物群落结构与功能代谢的时空分布存在异质性。2017年土壤微生物群落结构丰富,碳源利用强度大;随着土层加深,土壤中PLFA种类、含量减少,碳源利用率降低,微生物活性表现为:0-20cm土层>20-40cm土层。3、峰峰矿区土壤微生物以细菌为优势种,其群落结构表现为:细菌>放线菌>真菌>厌氧菌>原生生物。从土壤中检测到72种磷脂脂肪酸,其中15:0 anteiso是显着影响冬青土壤微生物的PLFA;15:0 iso、16:0 10-methyl是显着影响构树土壤微生物的PLFA;16:0 iso、16:1ω7c和18:1ω7c是显着影响小檗土壤微生物的PLFA。4、峰峰矿区土壤微生物主要利用碳源类型为碳水化合物和氨基酸类,对酚酸类和胺类利用最少。其中,冬青土壤微生物主要利用碳源为:D-半乳糖酸γ-内酯、α-环式糊精、2-羟基苯甲酸、L-天门冬酰胺、L-苯丙氨酸和L-苏氨酸;构树土壤微生物主要利用碳源为:β-甲基-D-葡萄糖苷、D-木糖/戊醛糖、i-赤藓糖醇和1-磷酸葡萄糖;小檗土壤微生物主要利用碳源为:D-半乳糖酸γ-内酯、肝糖、衣康酸、4-羟基苯甲酸、L-丝氨酸、L-苏氨酸和甘氨酰-L-谷氨酸。5、峰峰矿区土壤重金属含量较高,其中Cd元素含量显着高于国家叁级土壤标准,其余重金属元素含量均符合国家环境质量标准。通过PCA分析发现,pH、有机碳、全磷和土壤酶活是峰峰矿区主要影响因子,可以反映矿区土壤营养状况。6、有机碳、土壤酶活与细菌群落显着正相关,氨氮与全部土壤微生物群落显着负相关;pH、磷酸酶与碳水化合物显着正相关,有机碳、脲酶与大部分碳源显着正相关。有机碳和土壤酶活是影响矿区土壤微生物群落的关键因素。7、峰峰矿区土壤微生物群落结构与功能存在相关性。细菌、真菌群落与碳水化合物、多聚物类碳源显着正相关,革兰氏阳性菌与羧酸、胺类碳源显着正相关。(本文来源于《河北大学》期刊2019-06-01)

唐佳代[4](2019)在《贵州传统小曲微生物群落结构及功能酵母的筛选》一文中研究指出贵州省至今仍留存并使用着传统小曲制作工艺。传统小曲受制曲环境和工艺影响较大,小曲质量稳定性差,解析小曲中微生物组成对成品酒的品控与现代化生产具有重要意义。关于小曲微生物的相关研究报道较少,贵州小曲微生物群落结构更缺乏关注和研究。本研究以贵州遵义、兴仁、威宁等地区生产的小曲为研究对象,基于高通量测序分析其微生物群落结构,并通过纯培养法分析微生物组成,采用26S rRNA D1/D2区测序法对酵母菌进行分子生物学鉴定。采用气相色谱仪对酵母菌发酵米酒中乙醇和高级醇含量进行测定,筛选出低产高级醇功能酵母。本文主要的结论有:(1)高通量测序结果显示贵州小曲中有丰富的微生物资源,贵州小曲样品中主要的细菌属为芽孢杆菌Bacillus、肠杆菌Enterobacter、乳酸杆菌Lactobacillus、片球菌Pediococcus和不动杆菌Acinetobacter,主要真菌属为根霉Rhizopus、曲霉Aspergillus、节担菌Wallemia、覆膜孢酵母Saccharomycopsis、Xeromyces、红曲霉Monascus、毛霉Mucor、丝孢毕赤酵母Hyphopichia、Rhizomucor和青霉Penicillium。高通量测序方法有助于研究者掌握样本中微生物分布情况,获悉有利于酿造的微生物和需要防治的有害微生物,为功能微生物的挖掘奠定理论基础。(2)采用纯培养法分离各小曲中微生物表明黔北小曲酵母菌和霉菌丰度最高。分离出66株酵母菌,经26S rRNA D1/D2区测序鉴定为酿酒酵母Saccharomyces cerevisiae,异常威克汉姆酵母Wickerhamomyces anomalus,葡萄牙棒孢酵母Clavispora lusitaniae,Saccharomycopsis malanga,阿萨丝孢酵母Trichosporon asahii,伯顿丝孢毕赤酵母Hyphopichia burtonii,Cryptococcus neoformans,扣囊覆膜孢酵母Saccharomycopsis fibuligera和Komagataella pastoris。其中扣囊覆膜孢酵母S.fibuligera为优势酵母菌,C.lusitaniae、K.pastoris和T.asahii系首次从酿酒小曲中分离得到。(3)经气相色谱法测定各酵母发酵米酒乙醇和高级醇含量,并与前人研究结果对比,选择酿酒酵母S.cerevisiae FBKL2.8022和FBKL2.8012为本研究的低产高级醇且酒化力良好的功能酵母菌。FBKL2.8022和FBKL2.8012发酵米酒中乙醇含量分别为11.70%vol和11.29%vol;高级醇含量分别为277.75 mg/L和257.53 mg/L。(本文来源于《贵州大学》期刊2019-06-01)

潘麒嫣[5](2019)在《发酵床对圈养绿狒狒肠道微生物群落结构和功能的影响》一文中研究指出本研究以绿狒狒(Papio anubis)为例,在上海动物园制做了发酵床来替代传统的硬质地面。2月中旬至3月下旬,我们监测了发酵床、笼舍和外部游客通道等处的环境温度变化、动物对发酵床的利用、采用16S rDNA扩增子技术分析发酵床中4个不同深度的微生物群落和使用宏基因组测序技术分析发酵床笼舍与普通笼舍地面微生物及其所饲养绿狒狒肠道微生物,综合评估发酵床对绿狒狒的影响。结果显示,绿狒狒从行为、消化机能(基于粪便的判断)、精神状态等方面始终保持正常的状态。发酵床经历一个高温发酵期后,逐渐进入稳定期。绿狒狒改变以往挤在取暖设备附近的行为,大部分时间都在发酵床上活动,翻动发酵床寻找并采食里面滋生的各种甲虫和蠕虫。发酵床垫料表层的细菌群落结构最为复杂,OTU数量、Chaol指数和Shannon指数都高于其他3个深度。在绿狒狒挖掘最大深度范围内,共检测到13个属的有益菌,总相对丰度为42.26%;潜在致病菌有4个属,总相对丰度为11.08%。发酵床笼舍和普通笼舍比较分析结果显示:普通笼舍地面微生物在以致病菌为主的金黄杆菌属(Chryseobacterium)的相对丰度显着高于发酵床笼舍,因此发酵床笼舍比普通笼舍更不易造成致病菌的积累。在属水平上,普通笼舍组在以致病菌为主的密螺旋体属(Treponema)和颤杆菌克属(Oscilibacter)的相对丰度显着高于发酵床笼舍组,因此,发酵床笼舍饲养的绿狒狒更不易患菌群失调而导致的疾病。基于KEGG代谢通路,发酵床笼舍组绿狒狒肠道菌群在能量代谢、氨基酸代谢和肽聚糖生物合成方面的功能基因高于普通笼舍组,推测与绿狒狒活跃行为提高有关,微生物除了为机体供能外,也帮助它们抵御一些疾病的发生。基于CAZy数据库,木聚糖水解酶和果胶酶的高分布,提高了发酵床笼舍组绿狒狒对饲料的吸收效果;其次,CBM50、GH73和GH25家族的高分布保护发酵床笼舍组绿狒狒免受病原菌侵害,同时促进了抗病力的提高。综上所述,发酵床养殖模式通过益生菌繁殖的占位优势抑制了病原菌的繁殖和传播,利用益生菌发酵产生的高温提高笼舍的地面温度,并调节绿狒狒肠道健康,提高机体免疫力。(本文来源于《东北林业大学》期刊2019-05-01)

柯添添[6](2019)在《高砷地下水系统微生物群落结构和砷转化功能微生物多样性》一文中研究指出在砷的迁移转化过程中,微生物在其中扮演了很重要的角色。砷污染环境中土着微生物的群落结构特征和砷生物转化微生物的群落组成受到世界学者越来越多的关注。本文以内蒙古河套盆地高砷含水层中微生物群落为研究对象。通过采集不同区域的地下水和沉积物中的微生物样,分析这些样品的地球化学特征,研究样品中微生物群落结构特征和砷转化功能微生物群落组成,主要得到以下几点认识:(1)高砷地下水和低砷地下水中的微生物群落有显着差异。高砷地下水中微生物多样性和丰富度都高于低砷地下水。高砷样品中Chao范围为541~1933,而低砷样品中只有447~868。高砷地下水中主要的微生物是Sphingomonas、Pseudomonas Nitrospira、Rheinheimera,而低砷地下水中主要的微生物是Acinetobac、Thiovirga、Sulfurimonas,这些微生物主要跟N、S、As、Fe的生物地球化学循环有关。(2)地下水中微生物主要门是 Proteobacteria、Saccharibacteria、Bacteroidetes、Firmicrtes、Parcubacteria,主要属是Acinetobacter、Thiovirga、Aquabacterium、Hydrogenophaga、Sphingomonas。这些属在不同位置差异较大,Acinetobacter 主要分布在高砷地下水中,Aquabacterium在各口井中都有发现。ORP、TOC、SO42-、As(Ⅲ)、As(Ⅴ)和Mn是影响地下水微生物群落的主要环境因子。(3)沉积物中微生物的主要属Pseudomonas、Micrococcaceae、Massilia、Bacteroidales。pH、Mn、As、含水率、SO42-、NH4+、和 C/N 是影响沉积物中微生物群落的主要环境因子。地下水和沉积物中微生物群落结构在门和属水平上都有显着性差异;沉积物中微生物的多样性和物种丰富度都低于地下水中的微生物。(4)在内蒙河套盆地中,绝大多数砷功能微生物是未知的,已知的主要为Proteobacteria、Firmicutes和Actinobacteria。这些功能微生物除了可以还原砷、异化还原砷、氧化砷、甲基化砷外,还会参与硝酸盐还原,硫酸盐还原,铁还原。地下水的四种砷功能基因中,arsC和arrA基因的多样性和丰富度都远大于aioA和 arsM 基因。pH、ORP、TOC、SO42-、As(V)、As(Ⅲ)和 Mn 是影响砷功能微生物群落结构的主要环境因子。(本文来源于《中国地质大学(北京)》期刊2019-05-01)

刘嘉佩[7](2019)在《北极黄河站邻近海域微生物群落结构和功能分析》一文中研究指出微生物多样性和群落结构对于研究北极海水生态系统具有重要意义。本研究在北极斯瓦尔巴德附近的表层海水中九个不同地点进行了取样,通过荧光计数,稀释培养技术,生理试验和16S rDNA基因鉴定方法,研究了北冰洋表层海水中可培养浮游细菌的丰度,形态特征和多样性;选取其中的5个站点,使用基于16S rDNA基因的高通量方法来研究细菌和古细菌的多样性和丰度,并使用PICRUSt分析来确定表面海水中的功能序列基因;还使用基于内部转录间隔区(ITS)的高通量方法来研究5个站点真菌的多样性和丰度,并且还使用FUNGuild来确定表层海水中的真菌的功能。可培养的浮游细菌结果表明:(1)BJ1-BJ9的平均细菌数为2.88×10~8cells·L~(-1);(2)AB08,AB09和AB17菌株为革兰氏阳性菌株;(3)海洋可培养细菌主要由放线菌,黄杆菌和γ-变形菌组成,其中以假单胞菌占71%,是优势类群。高通量测序结果表明,细菌群落和结构中变形菌是所有样本中的主要分类群,其次是拟杆菌,放线菌,Planctomycetes,Verrucomicrobia,Cyanobacteria,Chloroflexi,HKB19,Acidobacteria,Firmicutes和Armatimonadetes。α-和γ-变形菌是变形菌门中的主要分类群。在BJ7位点,β-变形菌和γ-变形菌比其他种类的变形菌更多。Crenarchaeota是古细菌中最丰富的门。PICRUSt功能预测结果显示,关于碳循环的功能基因的拷贝读数最丰富,甲烷代谢占优势,磷酸盐和次磷酸盐代谢功能基因最少。在真菌的相关分析中,共得到240,786个合格reads和1928个操作分类单位(OTU)。仅有514个OTU被指定为真菌。真菌群落和结构表明子囊菌(44.36%)是所有样本中的主要门,其次是担子菌门(17.86%)和接合菌门(0.05%)。酿酒酵母(Aschaycycetes)是子囊菌(Ascomycota)中的主要类,而微生物菌纲(Microbotryomycetes)在担子菌(Basidiomycota)中占主导地位。在NCBI数据库中匹配后,大多数序列被归类为兼性海洋真菌。功能组显示,腐生(saprotrophs)是真菌最常见的营养模式。北极海域是一个独特的海域,拥有丰富的微生物资源。该海域微生物具有特殊的生理生化特性和环境适应机制,具有重要的研究意义。本研究针对该海域的微生物群落结构和功能进行分析,为该地区的微生物生态研究奠定了重要的基础。(本文来源于《浙江海洋大学》期刊2019-05-01)

温远光,李海燕,周晓果,朱宏光,李运筹[8](2019)在《马尾松×红锥异龄混交林对土壤微生物群落结构和功能的影响》一文中研究指出探讨马尾松(Pinus massoniana)纯林改造成马尾松×红锥(Castanopsis hystrix)异龄混交林对土壤微生物群落结构和功能的长期生态效应,为马尾松人工林质量的精准提升提供理论依据。以60 a生的马尾松纯林和改造后的异龄混交林为对象,比较分析纯林和异龄混交林土壤微生物群落结构和功能差异,以及土壤微生物类群与土壤酶活性和土壤性质的相关性。两种林分土壤磷脂脂肪酸(PLFAs)含量均大于0.01 nmol·g-1的标记种类为27种,其中25种PLFAs标记含量均为纯林高于异龄混交林;马尾松纯林土壤微生物群落、细菌、真菌、放线菌、丛枝菌根真菌、革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌的PLFAs均显着或极显着高于异龄混交林;马尾松纯林土壤微生物群落的PLFAs多样性均高于异龄混交林,其中土壤PLFAs丰富度和均匀度指数差异不显着,而香农威纳指数、Simpson指数差异显着;马尾松纯林改造为异龄混交林后,土壤β-1,4-葡萄糖苷酶、N-乙酰-β-氨基葡萄糖苷酶、酚氧化酶、过氧化物酶活性均呈现不同程度的降低,而土壤酸性磷酸酶和脲酶活性增加;相关分析表明,不同土壤微生物类群均与β-1,4-葡萄糖苷酶、N-乙酰-β-氨基葡萄糖苷酶、酚氧化酶、过氧化物酶呈正相关,与酸性磷酸酶和脲酶呈负相关;与土壤有机质、有效钾呈极显着正相关,而与土壤含水量、土壤微生物生物量氮呈显着负相关。马尾松×红锥异龄混交林对土壤微生物群落结构和功能的长期生态效应不明显,异龄混交林结构简单,物种多样性少,土壤有机质低,以及雨季土壤含水量过高是其土壤微生物群落多样性和土壤酶活性低于纯林的主要原因。(本文来源于《广西科学》期刊2019年02期)

蔡秋华,黄俊杰,林云红,熊茜,左进香[9](2019)在《草木灰对烤烟根际土壤微生物群落结构及功能多样性的影响》一文中研究指出施用草木灰旨在改善土壤微生物群落结构,减少由土壤自身衰退而引发的土传病害,更好的维持土壤生态系统的平衡。通过田间小区试验,采用平板培养法和BIOLOG技术研究施用草木灰对烤烟根际土壤微生物数量和功能多样性的影响。研究结果表明:施用草木灰显着增加了烤烟根际细菌、放线菌和微生物总量(P<0.05),真菌数量虽略有降低但差异并不明显;移栽后35、55、75天的3个时间段均有一致规律。同时,上述3个时间段烤烟根际微生物群落碳源利用率(AWCD)和对6类碳源的利用程度也以施用草木灰处理显着高于对照。施用草木灰后,烟株各时期根际土壤微生物群落Shannon指数(H)、Simpson指数(D)、均匀度指数(E)、丰富度指数(S)(P<0.05)均有所提高,其中移栽后35天时差异显着。根际微生物群落的PCA分析表明,增施草木灰处理和对照在主成分坐标体系中差异十分明显,草木灰处理集中在第1主成分正方向,而未施用的对照则集中在第1主成分负方向,表明土壤微生物功能多样性差异显着。上述说明增施草木灰在改善烟株根际土壤微生物群落结构及功能多样性方面有明显效果。(本文来源于《中国农学通报》期刊2019年11期)

杨莉莉[10](2019)在《叁种抗生素和铜单一及复合污染对土壤微生物群落结构和功能的影响》一文中研究指出随着畜禽养殖行业的发展,中国逐渐成为世界上最大的抗生素生产和使用国。由于抗生素在饲料中的过量使用,及其被畜禽摄入后不能完全被动物体吸收,因此大部分抗生素以原药、代谢物的形式排泄出来。重金属在畜禽的生长发育过程具有重要作用,畜禽饲料中会添加一定量的重金属,但饲料中的重金属往往添加量大于需求量,不能被吸收的重金属会随畜禽粪便排出体外。随畜禽粪便的农用,抗生素和重金属进入土壤并积累产生复合污染。为分析抗生素与重金属单一和复合污染对土壤活性的影响,本研究选用抗生素磺胺二甲嘧啶(sulfadimidine,SM2)、恩诺沙星(enrofloxacin,ENR)、土霉素(oxytetracycline,OTC)和重金属铜(copper,Cu)作为污染物,分别为4水平(ENR、OTC、SM2各4个质量含量:0、0.05、0.20、0.80 mmol?kg~(-1))和2水平(Cu质量含量为0、1.60 mmol?kg~(-1)),按照摩尔比1:2、1:8、1:32设计实验方案;将土壤微生物作为研究对象,传统手段结合现代分子生物学技术,研究不同实验周期下(7 d、14 d、21 d、28 d)微生物群落结构、功能基因(叁种碳循环基因:cbbM、cbbLR、cbblG,四种氮循环基因:apr、narG、nirS、nifH)、抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)的变化,评价这叁种抗生素及Cu的生态毒理效应,为环境危险评价提供科学依据。具体结果如下:(1)抗生素单一污染时,SM2处理组与CK组相比,cbbM基因在7 d、28 d时含量下降明显,cbbLR基因在0.8SM2(SM2染毒浓度为0.80 mmol?kg~(-1))处理下,基因含量在实验前期下降,实验后期恢复至CK组水平;抗生素种类对基因含量也有不同影响,如cbbLG基因,ENR单一污染时,其含量在14 d、21 d增加明显,在28 d恢复至CK组水平(除0.2ENR外),OTC单一污染,其含量均高于CK组;ENR、OTC低浓度组(0.05、0.2 mmol?kg~(-1))对RubisCO酶活性有激活,高浓度组在实验后期会抑制酶活性。在叁种抗生素单一污染均发现,ARGs含量是会明显增加的。末端限制性片段长度多态性(terminal restriction fragment length polymorphism,T-RFLP)实验中,抗生素单一污染对不同长度片段影响较大,不同抗生素对同一片段影响不同,14 d时SM2单一污染组中,随抗生素浓度增加,片段66 bp比例逐渐降低,由65%(0.05SM2)降到47%(0.8SM2),在OTC单一污染组中,随抗生素浓度增加,片段66 bp比例先减少后增加,由73%(0.05OTC)降到45%(0.2OTC)再增到64%(0.8OTC)。(2)Cu单一污染时,大多数浓度处理组Cu对土壤氮、碳循环过程具有促进作用,四种氮循环基因(apr、narG、nirS、nifH)含量均有一定增加,对于RubisCO,除14 d时酶活性降低(抑制率33.33%)外,其余叁个时期酶活性均比对照组增强;Cu还对土壤ARGs的含量起到促进作用,表明Cu可能是导致ARG环境中传播的潜在因素。(3)抗生素和Cu复合污染时,SM2和Cu复合污染处理在7 d时,narG基因含量随染毒浓度的增加而降低,14 d时narG基因含量随染毒浓度的增加而增加。不同的基因对复合污染的反应也不尽相同,如ENR与Cu复合污染,在28 d时,0.2ENR+Cu处理组中narG基因含量与CK组相比均有明显降低,而nirS基因含量明显增加。RubisCO活性的实验中,在实验后期,叁种抗生素和Cu复合污染均表现为协同作用,对酶活性的激活作用减弱。T-RFLP实验中,复合污染时对某些微生物影响很大,如14 d时片段51 bp在SM2+Cu、OTC+Cu复合污染时,随抗生素浓度增加,含量降低,最低至0。土壤中的重金属与抗生素对ARGs存在复合选择压力,OTC和Cu复合污染时,高浓度组0.8OTC+Cu比0.05OTC+Cu、0.2OTC+Cu对tetM的影响大。(本文来源于《山东农业大学》期刊2019-03-27)

微生物群落结构和功能论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

日本鳗草(Zostera japonica)是亚洲特有的海草种类,具有重要生态价值。近年来,黄渤海海草分布区中的日本鳗草海草床持续退化,引起了研究人员的广泛关注。【目的】基于根际微生物的分布与日本鳗草的健康生长密切相关的设想,本文旨在探究黄渤海海草分布区日本鳗草根际细菌群落结构多样性并分析其与海草健康生长的内在联系。【方法】选取黄渤海海草分布区中东营、威海、大连3个地点的日本鳗草根际与非草区表层沉积物,采用高通量测序技术(Illumina HiSeq PE300)解析根际微生物群落特征,并结合相关环境参数分析其环境功能。【结果】日本鳗草根际表层沉积物中主要存在的细菌类群有:变形菌门(Proteobacteria)所占比例为41.1%,蓝细菌门(Cyanobacteria)占15.4%,拟杆菌门(Bacteroidetes)占12.6%,放线菌门(Actinobacteria)占9.3%。不同地点之间以及样品类型(海草床根际与非根际)之间的微生物群落存在显着差异,主要表现为根际富含硫酸盐还原菌和固氮菌。环境因素:TN (total nitrogen)、TC (total carbon)、TOC (total organic carbon)、黏土(Clay)、砷(As)与根际群落组成与分布显着相关。【结论】从功能的角度来看,不同地点、不同样品类型之间的差异物种多与硫、氮代谢相关,硫酸盐还原菌对维持日本鳗草的生态健康起关键作用;日本鳗草根际微生物群落分布与环境因子、空间分布有一定相关性。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

微生物群落结构和功能论文参考文献

[1].梁宗林,秦亚玲,王沛,王保军,刘征华.云南省蒙自酸性矿山排水微生物群落结构和功能[J].生物工程学报.2019

[2].刘鹏远,张海坤,陈琳,孙延瑜,王彩霞.黄渤海海草分布区日本鳗草根际微生物群落结构特征及其功能分析[J].微生物学报.2019

[3].温昕承昊.峰峰矿区叁种植物根围土壤微生物群落结构及功能多样性研究[D].河北大学.2019

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微生物群落结构和功能论文-梁宗林,秦亚玲,王沛,王保军,刘征华
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