重组UK114蛋白编码基因的序列特征及表达分析

论文摘要

UK114蛋白对调节calpain活性具有重要作用,为了初步研究UK114蛋白的生物学特性,在测序的基础上,克隆和鉴定了UK114蛋白基因,分析该蛋白结构及功能预测。提取山羊肝脏中的总RNA,通过特异性引物扩增,获得UK114蛋白基因的序列,利用生物信息学方法分析了UK114蛋白的理化性质、信号肽、疏水性、糖基化、磷酸化位点,并对其二、三级结构进行预测。结果表明,克隆所得到的重组UK114蛋白基因由414个核苷酸组成,编码137个氨基酸的蛋白,其分子量约为14 ku,等电点为6.19;该蛋白氨基酸组成中丙氨酸含量最高,占15.3%,缺乏组氨酸和色氨酸;该蛋白结构中不存在信号肽,也没有糖基化位点,存在多个磷酸化位点;蛋白质二级结构中α螺旋占到了35.04%,不规则卷曲占到37.23%,β折叠占21.17%;三级结构中α螺旋位于N端,β折叠主要位于C端。该蛋白没有信号肽和糖基化位点,说明该蛋白不是分泌蛋白,不能发生糖基化,说明结构相对来说不是很稳定;有多个磷酸化位点,决定了其功能的多样性和复杂性。研究结果可为后期的蛋白质功能研究提供一定的理论依据。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张晓红,宋彩丽,殷惠军,尹淑琴,常泓

关键词: 基因克隆,生物信息学分析

来源: 山西农业科学 2019年03期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学

单位: 山西农业大学生命科学学院,山西农业大学期刊社

基金: 山西省科技攻关项目(20090311037)

分类号: Q78

页码: 437-441

总页数: 5

文件大小: 308K

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