基于高通量测序对四川怀远特色发酵食品微生物群落结构分析

基于高通量测序对四川怀远特色发酵食品微生物群落结构分析

论文摘要

为了研究四川怀远特色传统发酵食品的微生物多样性,利用Illumina HiSeq 2500高通量测序平台,对当地豆腐帘子和冻糕的微生物群落结构进行了系统分析.结果表明,豆腐帘子的菌群主要隶属于变形菌门(Proteobacteria)和担子菌门(Basidiomycota),检测出40个细菌属和21个真菌属,主要优势微生物是Acinetobacter和Trichosporon.冻糕的菌群主要隶属于厚壁菌门(Firmicutes)和子囊菌门(Ascomycota),检测出36个细菌属和23个真菌属,主要优势微生物是Lactobacillus和Kazachstania.

论文目录

  • 1 引 言
  • 2 材料与方法
  •   2.1 材 料
  •   2.2 方 法
  •     2.2.1 样品DNA提取及PCR扩增
  •     2.2.2 高通量建库测序
  •     2.2.3 高通量测序数据预处理
  •     2.2.4 高通量测序数据分析
  • 3 结果与分析
  •   3.1 样品OTU聚类分析
  •   3.2 样品OTU物种统计
  •   3.3 样品微生物在门水平的组成
  •   3.4 样品微生物在属水平的分布
  •     3.4.1 豆腐帘子微生物群落结构分析
  •     3.4.2 冻糕微生物群落结构分析
  •   3.5 样品OTU-Venn图
  • 4 讨 论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 刘筱雪,袁文娟,丁涛,熊粟栗,张杰,白林含

    关键词: 高通量测序,传统发酵食品,微生物群落结构,多样性

    来源: 四川大学学报(自然科学版) 2019年03期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑

    专业: 生物学,轻工业手工业

    单位: 四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室

    基金: 国家国际科技合作专项(2015DFR31060)

    分类号: TS201.3

    页码: 537-543

    总页数: 7

    文件大小: 2125K

    下载量: 415

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