冬季河流中抗生素抗性基因和微生物群落相关性研究

冬季河流中抗生素抗性基因和微生物群落相关性研究

论文摘要

为分析冬季河流中tetA、tetB、sul1和sul2抗性基因的分布特征与微生物群落的相关性,用Miseq高通量测序分析和荧光定量PCR技术进行。冬季河流地表水中抗性基因丰度比沉积物中的高2个数量级,磺胺类抗性基因丰度比四环素类的高1个数量级。4种抗性基因总丰度变化范围为3.65×10~2~7.94×10~7copies/L。河流中Proteobacteria和Bacteroidetes为绝对优势菌群,河流地表水与沉积物中优势菌群略有不同。4种抗性基因对样本的影响较大,微生物群落与抗性基因之间相关性较大。4种抗性基因与河流地表水样本均呈正相关,沉积物中仅有sul1与WS1、QS1呈正相关,其他均呈负相关。抗性基因的传播仅与特定的菌群有关,大多数菌属是影响抗性基因分布丰度的主要因素,且对四环素类抗性基因影响的菌群较多。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 样品采集
  •   1.2 水样分析
  •   1.3 样品抽滤及DNA提取
  •   1.4 PCR检测
  •     1.4.1 PCR扩增
  •     1.4.2 抗性基因定性检测
  •     1.4.3 抗性基因定量检测
  •   1.5 微生物群落分析方法
  •   1.6 统计分析
  • 2 结果讨论与分析
  •   2.1 抗生素抗性基因的分布
  •   2.2 微生物菌群分析
  •   2.3 抗性基因和微生物群落相关性分析
  • 3 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 罗晓,张文丽,许曼,张迎,蒋永丰,何磊,钟为章

    关键词: 冬季河流,抗性基因,荧光定量,高通量测序,微生物群落结构

    来源: 环境科学与技术 2019年05期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑

    专业: 环境科学与资源利用

    单位: 河北科技大学环境科学与工程学院,河北科技大学建筑工程学院

    基金: 国家自然科学基金(51708170)

    分类号: X52

    DOI: 10.19672/j.cnki.1003-6504.2019.05.004

    页码: 20-26

    总页数: 7

    文件大小: 2195K

    下载量: 454

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