3株猪流行性腹泻病毒S1基因的克隆及序列分析

3株猪流行性腹泻病毒S1基因的克隆及序列分析

论文摘要

猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)可感染各阶段的猪,使患病动物出现水样腹泻、呕吐,并伴随厌食和精神沉郁等临床症状,对哺乳仔猪危害尤为严重。为了解河南某猪场PEDV流行毒株S1基因的变异情况,以江苏农牧科技职业学院动物药学院实验室保存的感染PEDV临床病料为样本,对其进行S1基因扩增、克隆以及序列分析。对S1基因的进化分析结果显示,该猪场PEDV分离株S1基因推导的氨基酸序列之间的同源性高达99%,BLAST搜索结果显示与AHCZ-2株的相似性最高,将获得序列与经典毒株CV777相比在第57位插入了4个氨基酸NQGV,在第134位插入1个氨基酸D,而在第157、158位缺失2个氨基酸,在中和表位区域共有11处氨基酸突变,与国内其他毒株均位于G2-b进化分支,研究结果为进一步掌握该地PEDV的流行毒株和毒力变异情况提供了理论依据。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 样品的采集
  •   1.2 试剂
  •   1.3 样品处理及RNA提取
  •   1.4 引物的设计
  •   1.5 反转录及基因的PCR扩增
  •   1.6 S1基因的克隆
  •   1.7 序列分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 PEDV S1基因的扩增及克隆
  •   2.2 PEDV S1基因的序列分析
  •   2.3 PEDV S1蛋白遗传进化分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王婧,孙志雯,陈海峰,陈晓兰

    关键词: 猪流行性腹泻病毒,基因,遗传进化

    来源: 江苏农业科学 2019年20期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 江苏农牧科技职业学院

    基金: 江苏省农业三新工程项目(编号:SXGC[2017]249),江苏省泰州市科技支撑计划(农业)项目(编号:TN201711),江苏农牧科技职业学院院级项目(编号:NSF201504-2,NSF201606)

    分类号: S852.651

    DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.20.021

    页码: 99-103

    总页数: 5

    文件大小: 333K

    下载量: 111

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