异源双链分析论文_陈杰,郑可,张文燕,孙林雍,唐源

导读:本文包含了异源双链分析论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:分枝,电泳,高效,基因,杆菌,凝胶,地中海。

异源双链分析论文文献综述

陈杰,郑可,张文燕,孙林雍,唐源[1](2016)在《毛细管电泳基因扫描和凝胶电泳异源双链分析在免疫球蛋白/T细胞受体基因重排检测中的应用研究》一文中研究指出目的探讨免疫球蛋白轻链IgK及T细胞抗原受体(TCRγ)基因重排更有效的检测方法。方法收集四川大学华西医院病理科2013~2014年淋巴组织增生性病变石蜡样本共139例,采用BIOMED-2系统扩增,分别使用毛细管电泳基因扫描和凝胶电泳异源双链分析两种方法进行IgK和TCRγ基因重排检测,比较不同方法之间的检出率。结果 81例行IgK基因重排检测,其中59例病理诊断为B细胞淋巴瘤,毛细管电泳基因扫描检出阳性47例(79.66%),凝胶电泳异源双链分析检出阳性34例(57.63%),二者差异有统计学意义(P=0.01)。58例行TCRγ基因重排检测,其中26例病理诊断为T细胞淋巴瘤,毛细管电泳基因扫描检出阳性21例(80.77%),凝胶电泳异源双链检出阳性17例(65.38%),差异无统计学意义(P=0.211)。结论毛细管电泳基因扫描在抗原受体基因重排检测中比凝胶电泳异源双链分析有更好的检测灵敏度。(本文来源于《西部医学》期刊2016年11期)

张霞,赵德华,秦殊,石瑞如,张国龙[2](2013)在《异源双链分析法用于结核和牛分枝杆菌的鉴别》一文中研究指出目的牛分枝杆菌存在pncA基因C169G和oxyR基因G285A突变,而结核分枝杆菌则无此突变,本研究利用DHPLC和SURVEYOR酶法测定这两个位点是否有突变,探讨异源双链分析法在结核分枝杆菌、牛分枝杆菌鉴别中的临床应用价值。方法 SURVEYOR酶法和DHPLC法分析结核分枝杆菌与牛分枝杆菌的pncA及oxyR基因。结果 DHPLC图谱和SURVEYOR酶法电泳图谱在牛分枝杆菌和结核分枝杆菌显着不同,很容易将二者区分开来。结论 DHPLC法和SURVEYOR酶法灵敏,简便,快速,在结核与牛分枝杆菌的鉴别中优于传统的培养鉴别方法。(本文来源于《医药论坛杂志》期刊2013年06期)

赵德华,张霞[3](2012)在《异源双链分析法用于结核和牛分枝杆菌的鉴别》一文中研究指出目的牛分枝杆菌与结核分枝杆菌由于99%以上的基因序列相同,从分子生物学角度很难鉴别。本工作从牛分枝杆菌存在pncA基因C169G突变和oxyR基因G285A的不同出发,利用DHPLC和SURVEYOR酶法进行测定,以探讨异源双链分析基因突变检测的新方法在这两种分枝杆菌鉴别中的应用。(本文来源于《中华医学会第七次全国中青年检验医学学术会议论文汇编》期刊2012-05-03)

赵菁,周韧[4](2009)在《联合SSCP和异源双链分析检测70例DLBCL中BCL-6基因突变的初步分析》一文中研究指出弥漫大B淋巴瘤(DLBCL)的遗传学异常是非常常见的,大多数病例发生免疫球蛋白重链和轻链基因重排,免疫球蛋白重链可变区发生点突变。近年来研究发现癌基因也可发生类似的点突变,如BCL-6基因的第一内显子(第一个非编码外显子下游100bp)存在点突变。这一现象与免疫球蛋白重链基因超突变(本文来源于《2009年浙江省病理学学术年会论文汇编》期刊2009-10-22)

穆锦江[5](2008)在《异源双链泳动分析丙型肝炎病毒准种及变异研究》一文中研究指出目的探讨慢性丙型肝炎病毒(HCV)患者体内准种的多样性及动态变化过程与病程进展的关系。方法应用异源双链泳动技术(HMA)研究在干扰素治疗压力下慢性HCV患者体内准种的变化。结果慢性HCV患者无论对干扰素应答情况如何,其体内HCV准种的数量无明显变化;治疗前占支配地位的准种株群在不同感染者体内的比例并不相同,随着抗病毒治疗的进行,不断有新的异质性程度更高的准种株出现,打破原有的平衡比例。结论慢性HCV患者对干扰素治疗有无应答,取决于变异株的异质性程度,而不是变异株数量。(本文来源于《中华医院感染学杂志》期刊2008年06期)

姚均,张福杰,赵红心,潘品良,冯鑫[6](2007)在《检测HIV-1耐药株的异源双链泳动分析技术的建立及临床应用》一文中研究指出目的探讨利用异源双链泳动分析技术(HMA)检测HIV-1耐药株的可行性和临床应用。方法从接受高效抗逆转录病毒治疗(HAART)的HIV-1感染者血浆中抽提RNA,采用套式RT-PCR方法扩增HIV-1的PR和RT基因片段,并对扩增的基因片段进行异源双链泳动分析。结果本方法对血清中HIV-1RNA含量2000copies/ml以上的样本都能有效扩增。在18例参加HAART治疗的HIV感染者中,17例的HMA结果在聚丙烯酰氨凝胶电泳上,没有出现有意义的异源双链泳动带。1例发现有异源双链二聚体,这1例后经序列测定证实,确定有耐药位点的基因变异。结论异源双链泳动分析技术能够及时、间接地反映HIV-1在治疗过程中耐药株的存在。该方法的建立能在临床上为临床医生制定治疗方法提供参考依据。(本文来源于《传染病信息》期刊2007年03期)

李强[7](2007)在《基于DHPLC同源及异源双链分析的β珠蛋白基因已知突变和多态性位点的快速分型》一文中研究指出背景与目的β地中海贫血(简称β地贫)是世界上最常见的常染色体单基因隐性遗传病之一。β地贫在全球许多地区具有很高的发生率,目前公认的原因是由于疟疾选择的结果。因此地贫主要分布在疟疾高发的热带亚热带地区,从地中海沿岸和非洲大部分地区到中东、印度次大陆、中国南方、东南亚、并延伸至印度尼西亚和太平洋地区,而美国、中美和南美等国因移民原因也成为高发地区。β地贫是我国长江以南各省区高发的血液遗传病,广东、广西、海南、江西、台湾和香港等地尤为突出,受累人口多达2亿以上。β地贫是由于β-珠蛋白基因突变导致β-珠蛋白肽链缺如(β°)或合成不足(β~+)而引起的遗传性溶血性贫血病。β地贫的分子病理具有高度的异质性,主要为11号染色体上β-珠蛋白基因点突变、小的缺失或插入。目前全世界已报道的基因突变类型达200多种,不同种族人群有其自身的常见突变类型。重型β地贫是致死性疾病,患者必需通过定期输血和去铁治疗来维持生命,因此,β地贫仍是这些高发地区最关心和最棘手的公共健康问题之一。对于一个地贫高发的地区或国家而言,控制该病的最有效途径是在遗传流行病学研究的基础上制订预防计划,通过实施大人群的筛查和高风险夫妇的产前诊断来防止重症患儿的出生。β地贫的基因诊断和产前诊断先后经历了DNA点杂交、限制性内切酶酶谱分析、限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)连锁分析、寡核苷酸探针杂交(Allele Specific Oligonucleotide,ASO)和基因芯片(Gene Chip)等技术。目前,用于诊断β地贫的分子生物学方法主要为经典的反向点杂交(Reverse Dot Blot,RDB)技术。但上述方法存在操作烦琐,对引物标记、探针合成及标记技术要求较高,诊断速度慢,不适合进行大人群筛查,容易出现假阳性和假阴性结果并进一步导致误诊或者漏诊等缺点。高效液相色谱技术(Denaturing high-performance liquid chromatography,DHPLC)已被证明是一种精确、高效、经济、高通量自动化的检测已知点突变及筛查未知突变的方法。其敏感性和特异性可达96%~100%,明显高于常用的DGGE、CCM、CSGE、SSCP等变异检测技术,目前只有基于毛细管电泳技术发展起来的荧光单链构像多态性分析(F-SSCP)在敏感性和特异性方面能与DHPLC相媲美。另外,若同时选多个温度条件进行分析还能进一步增加DHPLC的变异检出率。本研究的目的是基于DHPLC上述特点,建立一种快速、高灵敏度、准确、经济、高通量自动化的β地贫诊断方法,用于已知β地贫点突变的快速基因诊断和产前诊断以及发现新的突变位点或单核苷酸多态性位点(Single NucleotidePolymorphisms,SNPs)。设计与方法针对中国人群β地贫已知35种突变类型及其在β珠蛋白基因中的位置,设计三对涵盖所有突变热点区的特异性聚合酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)引物,通过条件优化实现在同一条件下的常规PCR扩增。PCR产物在DHPLC半变性条件下,对同源双链或异源双链进行分析,不同基因型表现为洗脱峰峰型的差异和/或保留时间长短的差异。795例基因组DNA样品作为本方法学建立的基础,其中包括407例经RDB确诊的患者基因组DNA样品和388例正常人基因组DNA样品。随机抽取其中的319例基因组DNA样品进行测序分析,作为盲法对照实验,用于评价本方法的准确性。这319例DNA样品包括258例β地贫点突变或点突变复合多态性位点的DNA样品和61例正常DNA样品。此外,经DHPLC分析获得的与已知突变峰型不同的样品,通过DNA测序以期发现新突变或SNP位点。本方法建立及评价完成后,将其用于β地贫的临床产前诊断,并与RDB诊断方法的结果进行比对,得出本方法的实用性。结果与讨论本研究共检测分析了795例DNA样品,这些样品中包含了20种不同β珠蛋白基因突变类型和8个多态性位点。通过DHPLC方法检测分析,得到了68种不同的特异性洗脱峰标准图谱。在盲法对照实验中,得到了与DHPLC检测方法完全一致的分析结果。同时在实验过程中,我们还检测到了4例用常规分析手段未检测出的新突变,这4例新突变均为首次报道。此外还发现一例-98突变,但其是否对β地贫构成贡献有待进一步研究。应用DHPLC对9例中国家系进行产前诊断的结果与RDB方法诊断结果完全一致。本研究建立的基于DHPLC的β地贫已知突变基因诊断技术是一种高通量、高灵敏度、自动化、快速、准确、经济的点突变检测技术。该方法用于诊断β地贫,消除了目前广泛应用的RDB检测方法存在的假阳性及假阴性问题,并能用于β地贫未知突变的检出。鉴于对本技术方法的双盲评价结果,该技术完全可应用于临床遗传学实验诊断,并将对β地贫的基因诊断和产前诊断以及防止重症患儿出生做出重要贡献。(本文来源于《第一军医大学》期刊2007-04-25)

Ponti,R.,Quaglino,P.,Novelli,M.,M.G.,Bernengo,刘艳[8](2005)在《通过多重PCR/异源双链分析皮肤T细胞淋巴瘤(蕈样肉芽肿/Sézary综合征)和良性炎症性疾病患者的T细胞受体γ基因重排:临床、组织学和免疫表现型结果的相关性》一文中研究指出Background: A dominant T- cell clone can be detected by polymerase chain reaction (PCR) in 40- 90% of cutaneous samples from patients with cutaneous T- cell lymphoma (CTCL). Materials and methods: From 1996 to 2003 we analysed 547 cutaneous biopsies performed to exclude CTCL (mycosis fungoides, MF/Sé zary syndrome, SS). The final diagnosis was benign inflammatory disease (BID) in 353 samples (64.5% )- and CTCL in 194 (35.5% ). T- cell receptor (TCR)- γ gene rearrangement was studied by using a multiplex PCR/heteroduplex (HD) analysis. The PCR results were correlated with the clinical picture, the histological pattern and the presence of T- cell lineage antigen loss, using univariate and multivariate logistic regression analyses. Objective: To determine the sensitivity and specificity of the multiplex PCR/HD analysis and to identify which are the clinical, histopathological or immunophenotypical features significantly associated with a positive T- cell clonality. Results: A clonality was demonstrated in 83.5% of CTCL and in 2.3% of BID (P < 0.001). A significantly higher percentage of clonal cases was associated with the cutaneous T- score (71.4% in T1, 76.1% in T2 and 100% in nodular and erythrodermic MF samples) and with the presence of a T- cell lineage antigen loss (93.9% vs. 77.4% ). Moreover, clonality was closely related to an increase in the histopathological score (51.3% in the samples with a score < 5, compared with 92% in the lesions with ≥ 5). No significant difference in the percentage of clonal cases was found between T1/T2 and T3/T4 lesions with a histopathological score ≥ 5. The multivariate logistic regression showed that the density and extent of the cell infiltrate, the degree of epidermotropism and the presence of cytological atypia share an independent predictive value for clonality in T1/T2 samples, even if the highest odds ratios (3.6) were associated with the density of the cell infiltrate. The disease course of T1/T2 patients was analysed according to the PCR findings. All the PCR- negative patients showed a long- standing stable disease course; on the other hand, a disease progression occurred in 12/87 (13.8% ) positive patients. Conclusions: The multiplex PCR/HD analysis is associated with a high diagnostic accuracy (92.7% ) in CTCL patients. The finding of a clonal T- cell rearrangement is more closely associated with the histological pattern (in particular with the density and extent of the cell infiltrate) rather than with the MF cutaneous T- score or immunophenotype.(本文来源于《世界核心医学期刊文摘(皮肤病学分册)》期刊2005年12期)

张静,傅继华,王同展,尤向东,林琳[9](2005)在《山东省HIV异源双链泳动分析法分型体系研究》一文中研究指出[目的]克隆山东省流行的HIV-1优势亚型的代表毒株的包膜蛋白基因,建立用于山东省HIV-1分型的异源双链泳动分析体系。[方法]2003年11~12月将与山东省HIV-1 B′/C、B′和A/E各亚型共享序列最接近的毒株用套式聚合酶链反应(PCR)技术扩增包膜(env)基因,克隆到p GEM-Teasy载体中,构建成用于异源双链泳动分析(HMA)分型的山东标准亚型质粒,并摸索各反应和电泳的最佳条件。[结果]共建立HMA的分型标准质粒11株,建立以标准质粒为分型标准、包含3套可供选择的片段扩增策略的HMA体系,与序列分析比较各亚型代表株的检出率(敏感性)分别达到了B′94%、B/′C 90%、A/E 90%。[结论]建立的HMA分型体系经济、方便、易掌握、结果可靠,值得推广。(本文来源于《预防医学论坛》期刊2005年06期)

黄燕萍,王宇明,兰林,范燚,赵文利[10](2004)在《应用单链构象多态性和异源双链分析研究拉米夫定耐药变异》一文中研究指出目的 应用单链构象多态性/异源双链分析技术研究慢性乙型肝炎患者拉米夫定治疗前后乙肝病毒准种组成的改变。方法 聚合酶链反应扩增6例患者治疗前后共12份血清标本中目的片段并逐一分析。结果 拉米夫定治疗前患者体内乙肝病毒聚合酶基因序列准种组成较复杂,准种数在7-14(平均9.8),均高于治疗后准种数4-8(平均5.7),t=3.98,P<0.05。6例患者治疗前的准种分布中有一种或两种优势准种,但比例较低(33.3%-81.80%);治疗后显着升高(78.80%-90.9%),t=3.24,P<0.05。选择优势克隆测序,6例患者经拉米夫定治疗后2例在酪氨酸-蛋氨酸-天冬氨酸-天冬氨酸(YMDD)序列出现M550V/L528M,3例为M5501变异,1例无变异。结论 采用单链构象多态性/异源双链分析技术对人体内病毒作整体性的研究,可避免其他研究方法的片面性,为发现新的变异点提供机会,进一步解释拉米夫定的耐药机制。(本文来源于《中华检验医学杂志》期刊2004年08期)

异源双链分析论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

目的牛分枝杆菌存在pncA基因C169G和oxyR基因G285A突变,而结核分枝杆菌则无此突变,本研究利用DHPLC和SURVEYOR酶法测定这两个位点是否有突变,探讨异源双链分析法在结核分枝杆菌、牛分枝杆菌鉴别中的临床应用价值。方法 SURVEYOR酶法和DHPLC法分析结核分枝杆菌与牛分枝杆菌的pncA及oxyR基因。结果 DHPLC图谱和SURVEYOR酶法电泳图谱在牛分枝杆菌和结核分枝杆菌显着不同,很容易将二者区分开来。结论 DHPLC法和SURVEYOR酶法灵敏,简便,快速,在结核与牛分枝杆菌的鉴别中优于传统的培养鉴别方法。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

异源双链分析论文参考文献

[1].陈杰,郑可,张文燕,孙林雍,唐源.毛细管电泳基因扫描和凝胶电泳异源双链分析在免疫球蛋白/T细胞受体基因重排检测中的应用研究[J].西部医学.2016

[2].张霞,赵德华,秦殊,石瑞如,张国龙.异源双链分析法用于结核和牛分枝杆菌的鉴别[J].医药论坛杂志.2013

[3].赵德华,张霞.异源双链分析法用于结核和牛分枝杆菌的鉴别[C].中华医学会第七次全国中青年检验医学学术会议论文汇编.2012

[4].赵菁,周韧.联合SSCP和异源双链分析检测70例DLBCL中BCL-6基因突变的初步分析[C].2009年浙江省病理学学术年会论文汇编.2009

[5].穆锦江.异源双链泳动分析丙型肝炎病毒准种及变异研究[J].中华医院感染学杂志.2008

[6].姚均,张福杰,赵红心,潘品良,冯鑫.检测HIV-1耐药株的异源双链泳动分析技术的建立及临床应用[J].传染病信息.2007

[7].李强.基于DHPLC同源及异源双链分析的β珠蛋白基因已知突变和多态性位点的快速分型[D].第一军医大学.2007

[8].Ponti,R.,Quaglino,P.,Novelli,M.,M.G.,Bernengo,刘艳.通过多重PCR/异源双链分析皮肤T细胞淋巴瘤(蕈样肉芽肿/Sézary综合征)和良性炎症性疾病患者的T细胞受体γ基因重排:临床、组织学和免疫表现型结果的相关性[J].世界核心医学期刊文摘(皮肤病学分册).2005

[9].张静,傅继华,王同展,尤向东,林琳.山东省HIV异源双链泳动分析法分型体系研究[J].预防医学论坛.2005

[10].黄燕萍,王宇明,兰林,范燚,赵文利.应用单链构象多态性和异源双链分析研究拉米夫定耐药变异[J].中华检验医学杂志.2004

论文知识图

单链构象多态性分析和异源双链分析产物的异源双链分析显示Ig和T...PCR-异源双链分析结果患者可见两...例AZ一B3片段经HA筛选异常者异常突变型及野生型两种PCR产物的DHPLC检...酶法的电泳图谱

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