导读:本文包含了基因芯片检测论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:基因芯片,病原菌,微生物,异烟肼,成分,利福平,通量。
基因芯片检测论文文献综述
孙桂英,赵刚,沈燕,徐密琴,高胜利[1](2019)在《基因芯片技术对结核分枝杆菌利福平及异烟肼的耐药性检测研究》一文中研究指出目的考察基因芯片技术检测结核分枝杆菌(Mtb)对利福平(RFP)与异烟肼(INH)耐药性的效果。方法选取苏州市吴江区第一人民医院感染科发现的痰液涂片阳性的结核病患者纳入研究。采用基因芯片技术检测Mtb对RFP与INH的耐药性,并与传统药敏试验结果进行对比,同时采用DNA测序进行验证。结果基因芯片检测RFP耐药的符合率为97.47%,灵敏度为94.90%,特异度为97.81%,阳性预测值为85.32%,阴性预测值为99.31%,Kappa值为0.952;检测INH耐药的符合率为94.45%,灵敏度为78.16%,特异度为99.84%,阳性预测值为99.38%,阴性预测值为93.25%,Kappa值为0.823;检测MDR的符合率为97.83%,灵敏度为82.50%,特异度为99.47%,阳性预测值为94.29%,阴性预测值为98.16%,Kappa值为0.927;经DNA测序验证,基因芯片检测RFP与INH耐药准确率分别为99.52%与99.76%。结论 rpoB531、526位点突变与katG315位点突变可能是苏州吴江地区Mtb产生RFP和INH耐药的关键性分子机制,基因芯片技术能快速且高准确度地检测出这些位点的突变情况,对INH耐药检测的灵敏度尚有较大提升空间。(本文来源于《国际检验医学杂志》期刊2019年23期)
杨艳兵,胡海英,吴茱萸,张丽娜,周敬奎[2](2019)在《基因芯片技术在成人下呼吸道感染病原学检测中的临床应用及评价》一文中研究指出目的调查了解成人下呼吸道感染的病原谱,评价基因芯片检测技术在成人下呼吸道感染病学检测中的临床应用价值。方法留取因下呼吸道感染住院的成人患者下呼吸道标本,分别进行常规培养及29种病原体基因芯片法检测,并对检测结果进行统计分析。结果共入组451例患者,A组(18~45岁)63例,B组(45~60岁)95例,C组(>60岁)293例;基因芯片法病毒的总检出率为77.61%,C组较高,但差异无统计学意义(χ~2=4.97,P>0.05)。基因芯片法细菌的总检出率为59.20%,阳性菌以肺炎链球菌为主,A组患者检出率较高,但差异无统计学意义(χ~2=1.38,P>0.05);阴性菌以流感嗜血杆菌及鲍曼不动杆菌为主,流感嗜血杆菌在B组患者检出率较高,但差异无统计学意义(χ~2=5.73,P>0.05),非发酵菌在C组患者检出率较高,但差异无统计学意义(χ~2=4.72,P>0.05),肠杆菌科细菌在C组患者检出率较高,差异有统计学意义(χ~2=9.83,P<0.05)。基因芯片法白色念珠菌的总检出率为28.60%, C组较高,差异有统计学意义(χ~2=7.06,P<0.05)。基因芯片检测与流感病毒感染临床诊断对比,总符合率为80.93%,敏感度18.75%,特异度94.34%,阳性预测值41.67%,阴性预测值84.34%;与传统细菌培养结果对比,总符合率为83.59%,敏感度50.45%,特异度94.41%,阳性预测值74.67%。结论病毒检出率较高,阳性菌以肺炎链球菌为主,阴性菌以流感嗜血杆菌及鲍曼不动杆菌为主,不典型病原体较少见;病毒、阴性菌及真菌在>60岁患者检出率较高;与传统培养法及流感临床拟诊相比,基因芯片检测技术有较高的符合率、特异度及阴性预测值。(本文来源于《广东医学》期刊2019年21期)
陈茹,段燕喻,高小博,刘志玲,阳静[3](2019)在《建立多重液相基因芯片方法快速检测狐狸、水貂成分》一文中研究指出基于xMAP液相芯片新型生物技术平台,分别以狐狸线粒体DNA D-loop区序列、水貂线粒体DNA细胞色素b基因序列为模板设计特异扩增引物和探针,并对探针进行锁核酸修饰,建立了二重xMAP液相基因芯片方法,用于快速检测狐狸和水貂源性成分。该法能准确鉴定鉴别狐狸和水貂DNA,对其他18种动物物种DNA均呈检测阴性,对狐狸、水貂DNA的检测低限分别为2. 8pg/μl、0. 9pg/μl,对肉类混样检出限为0. 05%(m/m)。对目标源性DNA含量为1%(V/V)的32份饲料与食品核酸添加样本均呈对应目标检测阳性。结果表明,该方法特异性强、灵敏度高,适用于食品与饲料领域相关原料和产品的质量与安全检验。(本文来源于《中国生物工程杂志》期刊2019年11期)
李元政,胡文忠,龙娅,冯可,萨仁高娃[4](2019)在《基因芯片检测技术及其在食源性病原微生物检测中的应用》一文中研究指出基因芯片是将寡核苷酸探针阵列固定在微小芯片载体上,通过核酸杂交与计算机数据分析可对待测样品的遗传信息进行大规模检测。它作为一种新型微量检测分析技术,以其可同时、快速、精准地分析数以千计基因组信息的本领而显示出了巨大的潜力。基因芯片检测技术在临床医学、食品检测与安全、植物病理学等领域得到非常广泛的应用。本文综述了基因芯片检测技术的分类及发展,系统的将基因芯片按探针长度、载体材料、制作方法、芯片功能、应用领域等不同的分类方法分为寡核苷酸芯片、硅芯片、原位合成芯片、基因表达谱芯片或各种专用型芯片等多种不同的芯片,并对其主要检测程序进行了总结,对基因芯片检测技术在食源性病原微生物研究中的应用,分析其存在的问题并进行展望,以期为之后基因芯片检测技术在食源性病原微生物检测与研究等提供一定理论基础研究。(本文来源于《中国食品科学技术学会第十六届年会暨第十届中美食品业高层论坛论文摘要集》期刊2019-11-13)
林颖,周枫,黄利芬,张群慧,王兴君[5](2019)在《十五项耳聋基因芯片联合一代测序检测聋儿家庭的致聋变异分析》一文中研究指出目的应用十五项耳聋基因芯片联合一代测序技术对非综合征型耳聋家庭易感基因进行检测,揭示常见的耳聋分子病因构成,并验证基因芯片技术的准确性及有效性。方法对广州市两个特殊听障机构的80组聋儿家庭(共241例)进行病史采集、听力评估,应用十五项耳聋基因芯片技术进行GJB2(c.35delG,c.176del16bp,c.235delC及c.299_300delAT),GJB3(c.538C>T),SLC26A4(c.919-2A>G,c.2168A>G,c.1229C>T,c.1975G>C,c.1174A>T,c.1226G>A,c.2027T>A和c.IVS15+5G>A)和MT-RNR1 (m.1555A>G,m.1494C>T)的检测,并用Sanger法对变异阳性家庭进行序列测定。结果在80组聋儿家庭中,基因芯片检测出GJB2及SLC26A4基因变异共62例,总检出率为25.73%(62/241),GJB2 c.235delC(34/62)与SLC26A4 c.919-2A>G(16/62)热点变异居多。Sanger法测序结果显示:携带GJB2及SLC26A4基因共73例,总检出率为30.30%(73/241),其中GJB2 49例,SLC26A4 24例;基因芯片检测出的基因变异经一代测序验证,符合率达100%;除基因芯片包含的位点外,还检测出部分GJB2 c.109G>A、c.79G>A、c.341A>G变异,及SLC26A4 c.259G>T、c.754T>C变异。结论十五项耳聋基因芯片联合一代测序技术可以提高非综合征型耳聋的变异检出率,此基因芯片准确率高,适合快速、大规模检测;广州市此特殊听障机构的耳聋相关基因热点变异仍以GJB2 c.235delC与SLC26A4 c.919-2A>G最常见。(本文来源于《中华耳科学杂志》期刊2019年05期)
刘莹[6](2019)在《基因芯片法与常规检测法在食源性疾病中的应用对比分析》一文中研究指出目的对比分析基因芯片法与常规检测法在食源性疾病中的应用效果。方法收集2016年4月到2018年8月收治的诊断为食源性疾病的患者98例为研究对象,收集患者的新鲜粪便,根据检测方法不同分为对照组与观察组,观察组应用基因芯片法进行病原菌的检测,对照组则应用常规培养法进行病原菌的检测。,观察比较两组的病原菌检测阳性率和检测时间等相关指标。结果在98例患者中,观察组采用基因芯片法检测出病原菌58例(副溶血弧菌9例,痢疾杆菌32例,沙门菌10例,大肠埃希菌2例,金黄色葡萄球菌5例),病原菌检出率为58.2%。对照组采用常规培养法检测出病原菌32例(副溶血弧菌5例,痢疾杆菌19例,沙门菌4例,金黄色葡萄球菌4例),病原菌检出率为32.7%。基因芯片法和培养法对病原菌、痢疾杆菌的检出率差异存在统计学意义(P<0.05)。观察组采用基因芯片法用于食源性疾病患者的病原菌检测时间明显短于常规培养法,差异有统计学意义(P<0.05)。结论基因芯片技术能够快速检出食源性疾病病原菌,可以替代常规培养法对病原菌进行检测,在食源性疾病的早期诊断和治疗中具有重要的临床价值。(本文来源于《食品安全质量检测学报》期刊2019年19期)
郭志平,陈晓红,吴国兰,翁丽珍,黄明翔[7](2019)在《基因芯片技术检测初治涂阴肺结核患者肺泡灌洗液的临床意义》一文中研究指出目的分析基因芯片技术检测初治涂阴肺结核患者肺泡灌洗液的临床意义。方法应用基因芯片技术对200份初步诊断初治涂阴肺结核患者肺泡灌洗液标本进行菌属鉴定,鉴定为结核分枝杆菌者进一步行异烟肼和利福平耐药相关基因检测,同时以BACTEC MGIT960液体快速培养及药敏结果为对照,比较2种检测方法的差异性。结果 200份肺泡灌洗液标本中,基因芯片技术鉴定出2份鸟分枝杆菌及8份胞内分枝杆菌,结果与BACTEC MGIT960液体快速培养一致。基因芯片异烟肼耐药相关基因inh A及kat G基因突变检出率与960液体药敏异烟肼耐药检出率相同(18. 4%,9/49),比较差异无统计学意义(P> 0. 05);以960液体药敏结果为金标准,基因芯片检测异烟肼耐药相关基因kat G或inh A突变的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值及kappa值分别为88. 9%、97. 5%、88. 9%、97. 5%及0. 864。在8例960液体药敏结果利福平耐药患者中,基因芯片均检测到rpo B基因突变。结论对于痰结核菌涂片阴性,高度疑似肺结核患者,可通过纤支镜进行肺泡灌洗,利用基因芯片技术对灌洗液进行检测,可早期快速诊断肺结核、NTM肺病及明确异烟肼和利福平耐药情况,为临床后续治疗提供依据,值得临床推广应用。(本文来源于《临床合理用药杂志》期刊2019年26期)
方桂桔,张灿辉,刘志新,吴廷文[8](2019)在《高通量检测基因芯片测序技术对COPD合并社区获得性肺炎病原体检测可行性研究》一文中研究指出目的探讨高通量检测基因芯片测序技术对慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)合并社区获得性肺炎病原体检测可行性。方法选择2017年1月至2018年5月在我院接受治疗的128例疑似COPD并发社区获得性肺炎患者进行研究。所有患者均在使用抗生素前采集合格痰标本、肺泡灌洗液标本,均同时进行病原学临床检测和高通量测序,并对高通量测序的结果采用PCR方法进行确认,然后对基于高通量测序的慢阻肺合并肺炎病原体检测方法进行评估。参照《中国成人社区获得性肺炎诊断和治疗指南(2016年版)》中致病原的主要检测方法及其相应的诊断标准为金标准,对临床检验及高通量检测基因芯片测序技术的诊断效能进行分析。结果临床检测对COPD合并社区获得性肺炎病原体检测诊断效能:灵敏度=81.52%,特异度=63.89%,准确度=76.56%,阳性预测值=85.23%,阴性预测值=57.50%。高通量检测基因芯片测序对COPD并发社区获得性肺炎病原体检测诊断效能:灵敏度=91.43%,特异度=82.61%,准确度=89.84%,阳性预测值=96.00%,阴性预测值=82.61%。高通量检测灵敏度、特异度、准确度、阳性预测值、阴性预测值等诊断效能指标均明显高于临床检测(P<0.05)。高通量病原体检出阳性率明显高于临床检验(P<0.05),在肺炎链球菌及流感嗜血杆菌方面差异无统计学意义(P>0.05),在人腺病毒方面高通量病原体检出阳性率明显高于临床检验(P<0.05)。结论高通量检测基因芯片测序技术对COPD合并社区获得性肺炎病原体检测灵敏度、特异度、准确度、阳性预测值、阴性预测值等诊断效能指标均明显高于临床检测,该方法操作方便、诊断价值较高。(本文来源于《临床肺科杂志》期刊2019年09期)
张新翊[9](2019)在《基因芯片技术在食品检测中的应用》一文中研究指出本文围绕基因芯片技术,就其在食品中营养成分、原料、微生物及转基因食品检测中的应用作探讨,望能为此领域研究提供借鉴与帮助。(本文来源于《食品安全导刊》期刊2019年24期)
苏霞,周宏专,常彦嫣,齐颀,林路路[10](2019)在《5种常见犬腹泻病毒基因芯片检测方法的建立》一文中研究指出为建立一种简便、快速、高效的可同时区分犬腺病毒1型(canine adenovirus type 1,CAV-1)、犬腺病毒2型(canine adenovirus type 2,CAV-2)、犬冠状病毒(canine coronavirus,CCV)、犬瘟热病毒(canine distemper virus,CDV)、犬细小病毒(canine parvovirus,CPV) 5种常见犬腹泻病毒的基因芯片诊断方法,本研究以CAV-1、CAV-2、CCV、CDV、CPV 5种犬腹泻病毒为靶病毒,根据NCBI上收录的病毒基因序列在其保守区域内设计引物,在此基础上根据变异区域设计针对每种病毒的探针2~3条,优化检测体系的各反应条件,确定该检测方法的特异性与敏感性,建立可同时区分5种病毒的基因芯片检测方法。结果显示,建立的基因芯片检测方法可同时检测以上述5种犬腹泻病毒,其中PCR的退火温度为55℃、延伸时间为1 min 15 s;探针与PCR产物的杂交温度40℃、杂交时间2.5 h时,该方法对CAV-1、CAV-2、CCV、CDV和CPV 5种病毒标准品的检测限分别为0.2 fg/μL、2 fg/μL、2 fg/μL、20 pg/μL和0.02 fg/μL,具有较高的灵敏性;同时对犬副流感病毒进行特异性试验,发现无阳性信号出现,具有较强的特异性;对14份临床腹泻样品检测结果显示,基因芯片方法对CAV-1、CAV-2、CCV、CDV和CPV 5种病毒的阳性检出率分别为28.57%、50.00%、64.28%、14.28%和85.71%,并且基因芯片检测方法的敏感性较PCR要高10~100倍。以上结果表明,本研究建立的基因芯片检测方法具有特异、敏感等特点,对临床中犬类混合感染病毒检测具有一定的诊断意义。(本文来源于《中国畜牧兽医》期刊2019年08期)
基因芯片检测论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
目的调查了解成人下呼吸道感染的病原谱,评价基因芯片检测技术在成人下呼吸道感染病学检测中的临床应用价值。方法留取因下呼吸道感染住院的成人患者下呼吸道标本,分别进行常规培养及29种病原体基因芯片法检测,并对检测结果进行统计分析。结果共入组451例患者,A组(18~45岁)63例,B组(45~60岁)95例,C组(>60岁)293例;基因芯片法病毒的总检出率为77.61%,C组较高,但差异无统计学意义(χ~2=4.97,P>0.05)。基因芯片法细菌的总检出率为59.20%,阳性菌以肺炎链球菌为主,A组患者检出率较高,但差异无统计学意义(χ~2=1.38,P>0.05);阴性菌以流感嗜血杆菌及鲍曼不动杆菌为主,流感嗜血杆菌在B组患者检出率较高,但差异无统计学意义(χ~2=5.73,P>0.05),非发酵菌在C组患者检出率较高,但差异无统计学意义(χ~2=4.72,P>0.05),肠杆菌科细菌在C组患者检出率较高,差异有统计学意义(χ~2=9.83,P<0.05)。基因芯片法白色念珠菌的总检出率为28.60%, C组较高,差异有统计学意义(χ~2=7.06,P<0.05)。基因芯片检测与流感病毒感染临床诊断对比,总符合率为80.93%,敏感度18.75%,特异度94.34%,阳性预测值41.67%,阴性预测值84.34%;与传统细菌培养结果对比,总符合率为83.59%,敏感度50.45%,特异度94.41%,阳性预测值74.67%。结论病毒检出率较高,阳性菌以肺炎链球菌为主,阴性菌以流感嗜血杆菌及鲍曼不动杆菌为主,不典型病原体较少见;病毒、阴性菌及真菌在>60岁患者检出率较高;与传统培养法及流感临床拟诊相比,基因芯片检测技术有较高的符合率、特异度及阴性预测值。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
基因芯片检测论文参考文献
[1].孙桂英,赵刚,沈燕,徐密琴,高胜利.基因芯片技术对结核分枝杆菌利福平及异烟肼的耐药性检测研究[J].国际检验医学杂志.2019
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[10].苏霞,周宏专,常彦嫣,齐颀,林路路.5种常见犬腹泻病毒基因芯片检测方法的建立[J].中国畜牧兽医.2019