基于网络药理学与分子对接方法探讨昆明山海棠的毒性机制

基于网络药理学与分子对接方法探讨昆明山海棠的毒性机制

论文摘要

目的利用网络药理学结合分子对接技术探讨昆明山海棠引起不良反应的毒性机制。方法系统检索昆明山海棠文献,全面筛选其活性成分并汇总相关不良反应,通过中药系统药理学数据库与分析平台、Swiss数据库以及STITCH数据库预测昆明山海棠活性成分-作用靶点,利用美国比较毒理基因组学数据库建立不良反应-作用靶点。合并获得交集基因,将相关毒性潜在靶点导入STRING数据库获取蛋白相互作用,利用DAVID平台进行GO生物功能过程和KEGG代谢通路富集分析。利用Systems Dock平台将昆明山海棠的特征性成分与关键毒性靶点进行分子对接。结果筛选得到21个昆明山海棠的生物活性成分,通过构建毒性蛋白相互作用关系(PPI)网络获取相关毒性靶点47个。对毒性靶点PPI网络的富集分析结果显示,昆明山海棠的毒性靶点可能与p53信号通路、PI3K-Akt信号通路等密切相关。分子对接研究证实昆明山海棠中大多数活性成分与毒性靶点有着较好的结合活性。结论初步验证了昆明山海棠引起不良反应的毒性机制,为进一步开展毒性中药致不良反应的作用机制研究提供了新思路和新方法。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 昆明山海棠活性化学成分的收集
  •   1.2 昆明山海棠活性成分-靶点预测
  •   1.3 昆明山海棠相关毒性靶点的筛选
  •   1.4 昆明山海棠活性成分-毒性靶点网络构建及关键毒性靶点的挖掘
  •   1.5 GO生物功能过程和KEGG代谢通路富集分析
  •   1.6 分子对接验证
  • 2 结果
  •   2.1 昆明山海棠活性化学成分及作用靶点预测
  •   2.2 昆明山海棠引起不良反应的毒性靶点预测
  •   2.3 昆明山海棠关键毒性靶点的挖掘
  •   2.4 GO生物功能过程和KEGG代谢通路富集分析结果
  •   2.5 分子对接结果
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 张丹,董一珠,吕锦涛,张晓朦,林志健,张冰

    关键词: 网络药理学,分子对接,昆明山海棠,靶点,毒性机制

    来源: 北京中医药大学学报 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技

    专业: 中药学

    单位: 北京中医药大学中药学院,北京中医药大学中药药物警戒与合理用药研究中心

    基金: 国家自然科学基金项目(No.81874349),北京中医药大学新教师启动基金项目(No.2019-JYB-XJSJJ007),北京中医药大学自主课题项目(No.2019-JYB-XS-072),中医药传承与创新“百千万”人才工程(歧黄工程)歧黄学者项目~~

    分类号: R285

    页码: 1006-1015

    总页数: 10

    文件大小: 2344K

    下载量: 605

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