1型鸭甲肝病毒纳米抗体的筛选与鉴定

1型鸭甲肝病毒纳米抗体的筛选与鉴定

论文摘要

1型鸭甲肝病毒(Duck Hepatitis A Virus Type 1,DHAV-1)临床上主要引起雏鸭急性肝炎,并具有高度致死性。VP1蛋白是DHAV-1主要衣壳蛋白,并诱导机体产生中和抗体。现有最灵敏特异的DHAV-1诊断方法主要是基于单克隆抗体(monoclonal antibodies,mAbs),但mAbs制作成本高,很难大规模生产等因素,限制了其在相关领域的应用。为了寻找传统mAbs的替代抗体,本研究以商品化DHAV-1活疫苗为免疫原免疫双峰驼,成功构建了大小为6×106、插入率为96%的噬菌体展示免疫纳米抗体(Nanobody,Nb)库,以DHAV-1 VP1蛋白为抗原进行了三轮特异性纳米抗体筛选,成功筛选鉴定了一株DHAV-1纳米抗体。在此基础上,本研究成功鉴定了该纳米抗体的线性表位为174PAPTST179,其在DHAV-1毒株之间高度保守,为特异灵敏检测DHAV-1提供了强有力的工具。本研究内容分主要分为以下三部分:1.全长DHAV-1 VP1蛋白的原核表达以DHAV-1传染性克隆为模板,利用PCR扩增VP1基因片段,通过EcoRⅠ和XhoⅠ酶切位点将其分别克隆入pET-32a(+)和pGEX-6P-1原核表达载体,转化到Rosetta(DE3)表达菌株,37℃1mM IPTG诱导3h后,经SDS-PAGE和Western blot鉴定VP1-His和VP1-GST蛋白得到成功表达。2.DHAV-1VP1蛋白纳米抗体的筛选与鉴定以商品化DHAV-1活疫苗为免疫原免疫双峰驼,6次免疫过后,通过ELISA鉴定血清中DHAV-1特异性抗体滴度为1:50000。提取外周血淋巴细胞总RNA,通过RT-PCR得到cDNA,以cDNA为模板,经巢式PCR得到目的VHH基因,通过酶切位点连接到pCANTAB 5E噬菌粒载体,转化雄性大肠杆菌TG1,成功构建了大小为6×106的噬菌体展示免疫纳米抗体库。以VP1-His为靶标,经过3轮富集筛选,成功筛选得到1株特异性针对DHAV-1 VP1的纳米抗体,命名为Nb25。3.Nb25抗原表位的鉴定首先将DHAV-1 VP1基因分五段,通过EcoRⅠ和XhoⅠ酶切位点分别克隆入pGEX-6P-1原核表达载体,转化到Rosetta(DE3)表达菌株,诱导表达后分段蛋白经Dot-blot鉴定,初步鉴定Nb25表位位于172PLPAPTSTTS181之间,然后将肽段172PLPAPTSTTS181分别从N端和C端缩进,将截短的6个肽段进行Dot-blot鉴定,经鉴定174PAPTST179为Nb25精确表位。经同源性对比,该表位在NCBI已发布DHAV-1毒株中高度保守,而在DHAV-2和DHAV-3存在变异。综上所述,本研究成功利用噬菌体展示技术筛选制备了针对DHAV-1的纳米抗体Nb25,并且Nb25具有高度特异性,只与DHAV-1病毒离子反应,与其他病毒不反应。

论文目录

  • 符号说明
  • 中文摘要
  • Abstract
  • 1 引言
  •   1.1 DHAV研究概述
  •     1.1.1 DHAV病原学概述
  •     1.1.2 DHAV-1 流行病学情况
  •   1.2 纳米抗体概述
  •     1.2.1 VHH结构
  •     1.2.2 VHH库种类
  •     1.2.3 VHH及其衍生物的表达
  •   1.3 B细胞表位定位的不同方法
  •   1.4 研究的目的意义
  • 2 材料与方法
  •   2.1 材料
  •     2.1.1 菌(毒)株、质粒
  •     2.1.2 酶和主要试剂
  •     2.1.3 主要仪器
  •     2.1.4 实验所用的溶液及其配制
  •   2.2 方法
  •     2.2.1 DHAV-1 衣壳蛋白VP1的原核表达
  •     2.2.2 DHAV-1 特异性纳米抗体库的构建
  •     2.2.3 DHAV-1 VP1特异性纳米抗体筛选
  •     2.2.4 DHAV-1 VP1特异性纳米抗体的鉴定
  •     2.2.5 纳米抗体Nb25 抗原表位筛选与鉴定
  • 3 结果与分析
  •   3.1 VP1的原核表达
  •     3.1.1 VP1基因PCR扩增
  •     3.1.2 VP1重组原核表达载体酶切鉴定
  •     3.1.3 VP1融合蛋白表达
  •     3.1.4 VP1融合蛋白Western blot分析
  •   3.2 DHAV-1 特异性VHH库的构建70
  •     3.2.1 血清效价测定
  •     3.2.2 文库VHH基因扩增
  •     3.2.3 文库插入率鉴定
  •   3.3 DHAV-1 VP1特异性纳米抗体筛选
  •     3.3.1 VP1特异性VHH富集
  •     3.3.2 可溶性纳米抗体ELISA
  •   3.4 DHAV-1 VP1特异性纳米抗体的鉴定
  •     3.4.1 pET28as-VHH表达载体构建
  •     3.4.2 纳米抗体表达与纯化
  •     3.4.3 VP1特异性纳米抗体反应性和特异性鉴定
  •     3.4.4 IFA
  •   3.5 纳米抗体Nb25 抗原表位筛选与鉴定
  •     3.5.1 VP1分5段PCR扩增
  •     3.5.2 VP1分5 段融合蛋白表达
  •     3.5.3 Nb25 抗原表位鉴定
  •     3.5.4 同源性对比分析
  • 4 讨论
  • 5 结论
  • 6 参考文献
  • 7 致谢
  • 8 攻读硕士学位期间发表论文情况
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 薛文湘

    导师: 姜世金

    关键词: 型鸭甲肝病毒,纳米抗体,噬菌体展示,抗原表位

    来源: 山东农业大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 山东农业大学

    基金: 国家自然科学基金面上项目(31772754),国家重点研发计划项目(2017YFD0500800),山东省现代农业产业技术体系(SDAIT-11-15),山东省双一流建设优势团队项目(SYL2017YSTD11)

    分类号: S852.65

    总页数: 81

    文件大小: 2825K

    下载量: 102

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