导读:本文包含了型特异性引物论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:引物,特异性,多态性,基因,实时,贡酒,分子。
型特异性引物论文文献综述
陈载鑫,何丹,谢岭平,李柳燕,许红丽[1]（2019）在《两种聚合酶在等位基因特异性引物延伸法检测SNP中的应用比较》一文中研究指出目的比较TaqTMHotStarDNA聚合酶和TspTMPlatinum DNA聚合酶在等位基因特异性引物延伸法检测SNP中的应用效果。方法取120例抗血栓治疗患者全血进行DNA提取、多重PCR扩增,将产物分2份,1份用TaqTMHotStarDNA聚合酶进行等位基因特异性引物延伸,1份用TspTMPlatinum DNA聚合酶进行等位基因特异性引物延伸,然后进行杂交反应,用Luminex 200系统检测CYP2C19基因多态性,同时将所有样本送第叁方进行基因测序。结果 TaqTMHotStarDNA聚合酶组检测结果与测序结果完全一致,TspTMPlatinum DNA聚合酶则会出现一些偏差,说明TaqTMHotStarDNA聚合酶参与的检测结果分辨率明显高于TspTMPlatinum DNA聚合酶参与的检测结果。结论两种聚合酶在等位基因特异性引物延伸法检测SNP中均可以取得一定的检测结果,但是为了结果的可靠性建议在检测过程中使用TaqTMHotStarDNA聚合酶。(本文来源于《泰山医学院学报》期刊2019年11期）
陈露露,黄光元,张丹丹,夏志辉[2]（2019）在《基于不等长引物等位特异性PCR的SNP检测方法》一文中研究指出为开发一种便捷的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)的检测方法,本研究以水稻的6种SNP变异形式(A/T, A/G, A/C, T/G, T/C, G/C)为研究对象,在下游引物为共用引物的情况下,首先设计两条长度相差20个核苷酸但3'末端分别与SNP两个等位差异碱基配对的常规上游引物。另外我们还评估在两条上游引物3'端的第2位或第3位碱基引入了错配碱基后观察对特异性的影响。结果表明,经3%的琼脂糖凝胶电泳后,不等长引物等位特异性PCR能区分不同的纯合子及杂合子,未引入错配碱基的引物只检测出A/T,C/G变异类型的SNP;而引物中引入错配碱基的等位PCR具有更高的检出效率,能检测出6种类型中的5种SNP。因此,本研究开发了一种成本低、操作简单、准确度高的SNP检测方法。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年13期）
王颖,方绍庆,曲德鑫,段效辉,高娟娟[3]（2019）在《蚊的Cytb基因特异性引物筛选》一文中研究指出目的设计、评价蚊Cytb基因特异性引物,建立蚊Cytb基因的分子鉴定方法,为了解蚊的亲缘关系和群体遗传差异提供理论基础。方法使用Premier Primer 5软件设计2对Cytb基因引物,以蚊及其他病媒生物的基因组DNA为模板进行PCR扩增,通过PCR产物测序对引物的特异性、灵敏性和稳定性进行评价。结果筛选到的1对引物CytbMOSF1/CytbMOSR1可用于鉴定淡色库蚊、叁带喙库蚊、白纹伊蚊、中华按蚊和鼠、蝇、蜚蠊、蜱、蚤等无交叉反应。该引物对叁带喙库蚊的扩增检测限可达6.8pg/μl,扩增稳定性好。结论设计的Cytb基因引物Cytb MOSF1/CytbMOSR1可进行蚊的分子鉴定,为蚊虫溯源提供数据。(本文来源于《中国国境卫生检疫杂志》期刊2019年02期）
何宏魁,袁木,蔡照润,曹润洁,李安军[4]（2019）在《甲烷囊菌属特异性引物的设计及其在古井贡酒窖泥质量评价中的初步应用》一文中研究指出甲烷囊菌(Methanoculleus)作为优势甲烷菌存在于浓香型白酒的窖泥中,该研究对古井贡酒窖泥中含量最多的30个属的16S rDNA全长代表序列进行傅里叶转换多序列比对(MAFFT),得到114个可能的甲烷囊菌特异性单核苷酸多态性(SNP)位点。对SNP位点在甲烷囊菌属内和属外5000多条序列进一步甄别,找出了3个效果最好的SNP位点,利用其中1个位点和半随机引物-聚合酶链反应(SAP-PCR)技术原理设计了两对特异性引物。以窖泥宏基因组为模板,成功扩增出了甲烷囊菌的相应序列。将引物应用于18个古井窖泥样本的实时定量聚合酶链反应(RT-QPCR)分析,结果表明,老厂优质窖泥中甲烷囊菌的相对含量远远高于新厂普通窖泥(最高达4000多倍)。利用本研究的方法原则上可以设计任意其他菌属在复杂菌群背景下的特异性引物。(本文来源于《中国酿造》期刊2019年03期）
刘倩倩,李俊薇,曹润洁,张会敏,何宏魁[5]（2019）在《耐酸乳酸杆菌物种特异性引物设计及其在古井贡酒窖泥酒醅质量评价中的初步应用》一文中研究指出古井贡酒的酿造过程中,窖泥和酒醅中发现大量耐酵乳杆菌(Lactobacillus acetotolerans),对该菌快速特异性检测非常重要。该文利用L. acetotolerans菌及大量Lactobacillus类似菌种的全基因组序列与PRIMERBLAST方法,设计了几对L. acetotolerans特异性引物,其中2对经过系列验证具有较好的特异性,可结合QPCR技术对不同质量和不同发酵阶段的窖泥进行L. acetotolerans含量的快速检测。结果表明,古井贡酒窖泥中L. acetotolerans含量总体明显低于酒醅,老窖泥中L. acetotolerans含量总体明显低于新窖池窖泥;而酒醅中老厂区和新厂区L. acetotolerans含量平均来看都很高,但样本之间存在明显波动。所用L. acetotolerans特异性引物可对浓香型白酒发酵样本中L. acetotolerans的相对含量测定并辅助评估窖泥酒醅质量。(本文来源于《食品与发酵工业》期刊2019年06期）
郑慧娟,白晓晔,高旭,孙志宏,张和平[6]（2019）在《双歧杆菌属特异性测序引物筛选及优化》一文中研究指出【背景】目前双歧杆菌的益生功能被普遍认可,越来越多的研究开始关注肠道中双歧杆菌的生物多样性。然而双歧杆菌是肠道中的低丰度物种,现有技术尚难以深入研究其多样性。【目的】基于双歧杆菌16SrRNA基因序列筛选一对适用于分析粪便样品中低丰度双歧杆菌属多样性的特异性引物。【方法】依据已有引物的相对位置及其与双歧杆菌属16S rRNA基因序列的匹配率,将引物重组优化得到扩增片段>800 bp的双歧杆菌属特异性引物;通过PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳对引物进行实验筛选和特异性验证;以细菌通用引物(27f/1492r)为参照,通过单分子实时(Single-molecule real-time,SMRT)测序技术对不同引物的3份粪便样品中细菌的DNA扩增子进行测序,在种水平上分析比较不同引物的优劣。【结果】对文献中已有的9对双歧杆菌特异性引物进行重组并优化,其中2对引物的理论特异性较好且扩增产物大于800 bp,它们分别为Bif164-f/Pbi R2和Pbi F1/Pbi R2。PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳实验发现,Bif164-f/Pbi R2的扩增条带明亮且无拖尾。此外,利用SMRT测序平台对引物27f/1492r和Bif164-f/Pbi R2的3份粪便样品中细菌的DNA扩增子进行测序并分析。27f/1492r扩增子的分析结果显示,3份样品依次分别含1、3、4个双歧杆菌种且双歧杆菌的平均相对含量为0.34%;而Bif164-f/Pbi R2扩增子的分析结果显示,3份样品依次分别含2、6和8个双歧杆菌种且双歧杆菌的平均相对含量为98.72%。上述结果表明,Bif164-f/Pbi R2可在种水平上特异地检出粪便中低丰度的双歧杆菌,进而实现样品中双歧杆菌的多样性分析。【结论】筛选出一对双歧杆菌特异性引物Bif164-f/PbiR2,可在种水平上分析粪便样品中低丰度双歧杆菌的生物多样性,同时也验证了理论结合实验进行引物筛选这种方法的可行性。(本文来源于《微生物学通报》期刊2019年07期）
白晓晔,钟智,孙志宏,张和平[7]（2018）在《肠道中乳酸杆菌属特异性定量引物的筛选及验证》一文中研究指出【目的】乳酸杆菌与人和动物的健康有密切关系,它的存在及含量变化可以作为评价宿主健康的指标之一。在乳酸杆菌定量研究中,特异性引物往往是定量成功的关键。然而,已有引物质量参差不齐,难以保证其特异性。本文旨在通过理论与试验的方法快速筛选出用于定量的乳酸杆菌属特异性引物,同时为今后引物筛选和设计提供理论基础。【方法】查阅文献、挑选出12对基于16S rRNA基因序列设计的乳酸杆菌属引物,通过MEGA 6.0软件确定引物相对位置,计算引物匹配率,以引物相对位置和匹配率为依据重新组合引物,获得理论特异性乳酸杆菌属引物,再通过琼脂糖凝胶电泳和QX200Droplet Digital PCR系统对新组合引物的特异性进行检验。【结果】通过理论与试验相结合的方法确定了一对特异性较好的乳酸杆菌属定量引物Lab1,它的扩增产物大小约300 bp。ddPCR系统检验结果发现其特异性和灵敏性较好,还可以有效定量粪便中的乳酸杆菌。【结论】引物设计理论结合特异性试验这种方法可以快速有效地筛选出特异性较好的引物,同时为今后引物筛选和设计提供理论基础。(本文来源于《微生物学报》期刊2018年11期）
曹学涛,裴生伟,张晋,李发弟,李刚[8]（2018）在《绵羊Y染色体特异性引物及SNPs的筛选》一文中研究指出【目的】哺乳动物Y染色体雄性特异区在减数分裂过程中不与X染色体发生重组,遵循严格的父系遗传,是研究父系遗传多样性的重要遗传资源;此外绝大多数Y染色体基因主要或者特异性的在睾丸组织中表达,并在精子发生和雄性繁殖力方面扮演着至关重要的作用。由于Y染色体测序极其困难,造成很多物种Y染色体序列很少。因此本文基于目前现有牛科动物Y染色体引物信息,旨在鉴定绵羊Y染色体特异性引物,比较绵羊Y染色体基因片段与岩羊、牛、山羊和牦牛Y染色体的差异,同时筛选不同绵羊品种在Y染色体基因片段内的SNPs,将找到的Y-SNPs和绵羊的睾丸大小进行相关性分析,为鉴定绵羊Y染色体基因片段奠定基础,并为今后绵羊Y染色体单倍型的构建、绵羊胚胎性别早期鉴定和公绵羊繁殖力相关分子标记的筛选提供科学依据。【方法】根据目前文献公布的29对牛科动物Y染色体特异性引物序列,以母绵羊和水分别作阴性和空白对照,以公绵羊DNA为模板验证引物的雄性特异性;确定绵羊Y染色体特异引物后,利用DNA混合池测序结合限制性长度片段多态性等技术在萨福克羊(n=146)、白萨福克羊(n=91)、东弗里升羊(n=6)、特克塞尔羊(n=72)、南非肉用美利奴羊(n=17)、杜泊羊(n=32)、湖羊(n=55)、藏羊(n=34)、滩羊(n=43)和岩羊(n=14)公羊群体中进行Y-SNPs扫描。用Chromas和DNASTAR等软件分析混合池测序的结果,利用DNAman软件将绵羊Y染色体基因片段与牦牛、山羊、黄牛和岩羊进行同源性分析。同时,测量萨福克羊、白萨福克羊、东弗里升羊、特克塞尔羊、南非肉用美利奴羊、杜泊羊周岁的阴囊围,利用SPSS19.0软件分析SNPs位点与公羊阴囊围的相关性。【结果】在分析的29对引物中,6对引物为绵羊Y染色体特异性引物,分别能扩增出ZFY3、SRY6、USP9Y、UTY、SRY11和ZFY6片段。17对引物未能出现扩增条带,6对引物在母羊DNA中出现扩增条带。通过比对发现绵羊6个基因片段与岩羊、牛、山羊、牦牛的同源性在81.51%—98.84%。此外,首次在萨福克和白萨福克羊群体的SRY11片段中鉴定得到一个G>A的突变,通过Hpy188I酶切分析发现在萨福克羊、白萨福克羊中有2种基因型(AA、GG),在其他7个绵羊品种中只有GG基因型。在白萨福克羊群体中,GG基因型的频率为0.747,AA基因型的频率为0.253;在萨福克羊群体中GG基因型的频率为0.986,AA基因型的频率为0.014;说明在萨福克羊和白萨福克羊群体中,GG基因型为优势基因型。关联分析显示在白萨福克羊群体中,GG基因型个体周岁的阴囊围显着的高于AA基因型(P=0.029)。【结论】鉴定得到6个绵羊Y染色体基因片段,它们与牛、山羊、牦牛和岩羊具有较高的同源性,表明Y染色体基因在进化过程中具有一定的保守性。首次在萨福克和白萨福克羊群体SRY11片段中找到一个Y-SNP(G>A),其与白萨福克羊周岁的睾丸大小紧密相关。(本文来源于《中国农业科学》期刊2018年15期）
王学政,季福玲,刘志胜,鲁艳芹,赵飞[9]（2018）在《一种用于实时荧光PCR法检测肉制品中鼠源性成分特异性引物的研发》一文中研究指出目的研发一种用于实时荧光PCR法检测肉制品中鼠源性成分的特异性引物。方法通过比对NCBI中多种物种的脱氧核糖核酸细胞色素b(mitochondrial deoxyribonucleic acid cytochrome b,Cytb)基因全序列,设计针对鼠源性成分的特异性引物。采用DNA提取试剂盒提取鼠DNA,以其为模板,通过设计的特异性引物进行实时荧光PCR扩增,试验重复3次。同时验证该引物的特异性,并对羊肉卷、牛肉卷和猪肉片样品进行检测。结果通过设计的特异性引物进行3次实时荧光PCR扩增的Cp平均值为16.47,标准差为0.430,熔解曲线具有明显的单一主峰,且重合度良好。仅鼠源DNA模板的PCR产物可见115 bp的目的条带,其他物种DNA模板均未扩增出该目的条带。羊肉卷、牛肉卷和猪肉片样品中均未检测出鼠源性成分。结论本实验设计的引物可用于实时荧光PCR法对肉制品中鼠源性成分的检测,且特异性较好。(本文来源于《中国生物制品学杂志》期刊2018年07期）
张杨,吴仁人,张一敏,贾乐华[10]（2018）在《禽类特异性引物在珠江叁角洲地区的适用性研究》一文中研究指出以珠江叁角洲地区为目标研究区域,采集不同地区猪、牛、人、狗、鸽、羊及家禽等72份粪便样品,进行DNA提取,并选取8种针对鸡肠道内优势菌群而开发出的特异性引物进行地区适用性验证。结果表明:粪便DNA提取试剂盒提取的DNA纯度符合后续PCR扩增实验要求。Faecalibaterium通用引物FAU-F/FAU-R(1~#)检出率为87%(63/72),对禽类、反刍动物及哺乳动物等都具有较好地检出效果。鸡的特异性Faecalibaterium引物Fach-F1/Fach-R1、Fach-F2/Fach-R2(2~#、3~#)、特异性短杆菌引物LA35F/LA35R(4~#)、特异性拟杆菌引物ch Bact-F1/ch Bact-R16、CP2-9F/CP2-9R(5~#、7~#)灵敏度较差;鸡的拟杆菌特异性引物q C160F-HU/q Bac265R-H(6~#)、鸡的梭状芽胞杆菌特异性引物CP3-49F/CP3-49R(8~#)特异性较差,在珠江叁角洲地区都不具备较好的适用性。然而,当源解析的目标由鸡扩大至禽类,6~#及8~#引物的特异性分别提高至81%和72%,满足珠叁角地区禽类粪便污染源解析的适用条件。(本文来源于《生态科学》期刊2018年03期）
型特异性引物论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
为开发一种便捷的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)的检测方法,本研究以水稻的6种SNP变异形式(A/T, A/G, A/C, T/G, T/C, G/C)为研究对象,在下游引物为共用引物的情况下,首先设计两条长度相差20个核苷酸但3'末端分别与SNP两个等位差异碱基配对的常规上游引物。另外我们还评估在两条上游引物3'端的第2位或第3位碱基引入了错配碱基后观察对特异性的影响。结果表明,经3%的琼脂糖凝胶电泳后,不等长引物等位特异性PCR能区分不同的纯合子及杂合子,未引入错配碱基的引物只检测出A/T,C/G变异类型的SNP;而引物中引入错配碱基的等位PCR具有更高的检出效率,能检测出6种类型中的5种SNP。因此,本研究开发了一种成本低、操作简单、准确度高的SNP检测方法。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
型特异性引物论文参考文献
[1].陈载鑫,何丹,谢岭平,李柳燕,许红丽.两种聚合酶在等位基因特异性引物延伸法检测SNP中的应用比较[J].泰山医学院学报.2019
[2].陈露露,黄光元,张丹丹,夏志辉.基于不等长引物等位特异性PCR的SNP检测方法[J].分子植物育种.2019
[3].王颖,方绍庆,曲德鑫,段效辉,高娟娟.蚊的Cytb基因特异性引物筛选[J].中国国境卫生检疫杂志.2019
[4].何宏魁,袁木,蔡照润,曹润洁,李安军.甲烷囊菌属特异性引物的设计及其在古井贡酒窖泥质量评价中的初步应用[J].中国酿造.2019
[5].刘倩倩,李俊薇,曹润洁,张会敏,何宏魁.耐酸乳酸杆菌物种特异性引物设计及其在古井贡酒窖泥酒醅质量评价中的初步应用[J].食品与发酵工业.2019
[6].郑慧娟,白晓晔,高旭,孙志宏,张和平.双歧杆菌属特异性测序引物筛选及优化[J].微生物学通报.2019
[7].白晓晔,钟智,孙志宏,张和平.肠道中乳酸杆菌属特异性定量引物的筛选及验证[J].微生物学报.2018
[8].曹学涛,裴生伟,张晋,李发弟,李刚.绵羊Y染色体特异性引物及SNPs的筛选[J].中国农业科学.2018
[9].王学政,季福玲,刘志胜,鲁艳芹,赵飞.一种用于实时荧光PCR法检测肉制品中鼠源性成分特异性引物的研发[J].中国生物制品学杂志.2018
[10].张杨,吴仁人,张一敏,贾乐华.禽类特异性引物在珠江叁角洲地区的适用性研究[J].生态科学.2018
论文知识图
