烟草NtPP2C37-like基因的克隆及表达分析

烟草NtPP2C37-like基因的克隆及表达分析

论文摘要

2C型丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶(PP2C-type protein phosphatases, PP2C)是ABA信号转导途径中的关键组分,在植物生长发育、细胞周期调节及应对逆境胁迫的过程中发挥重要的作用。本研究利用本实验室构建的‘云烟87’转录组数据库,从‘云烟87’烟草中克隆到一个NtPP2C37-like基因,该基因开放阅读框为1 275 bp,编码425个氨基酸残基。通过对NtPP2C37-like蛋白质进行相关分析,该蛋白不存在信号肽,可能属于非分泌蛋白;不具有跨膜结构,不属于跨膜蛋白。同源性分析结果显示,说明NtPP2C37-like蛋白与茄科植物有高度同源性。本研究获得了烟草NtPP2C37-like基因完整ORF,这为将来深入研究烟草NtPP2C37-like基因功能提供了科学依据。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 烟草NtPP2C37-like基因ORF的克隆
  •   1.2 烟草NtPP2C37-like基因氨基酸的理化性质分析
  •   1.3 烟草NtPP2C37-like蛋白的保守结构域、跨膜结构、信号肽及亚细胞定位的预测与分析
  •   1.4 烟草NtPP2C37-like蛋白质高级结构预测分析
  •   1.5 烟草NtPP2C37-like蛋白系统进化树构建
  •   1.6 NtPP2C37-like的组织表达分析
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 试验材料
  •   3.2 烟草总RNA提取与cDNA链的合成
  •   3.3 烟草NtPP2C37-like基因引物设计及扩增
  •   3.4 烟草NtPP2C37-like基因cDNA的克隆
  •   3.5 烟草NtPP2C37-like基因基因生物信息学分析
  •   3.6 烟草NtPP2C37-like基因荧光定量PCR试验
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 何晓健,张柳,程亚东,杨焕文,毛自朝

    关键词: 烟草,生物信息学

    来源: 分子植物育种 2019年15期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农作物

    单位: 云南农业大学农学与生物技术学院,红云红河烟草(集团)有限责任公司,云南农业大学烟草学院

    基金: 国家烟草专卖局项目(Ts-03-20110024),中国烟草总公司云南省科技项目(09YN02,2011YN03)共同资助

    分类号: S572;Q943.2

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.004973

    页码: 4973-4977

    总页数: 5

    文件大小: 1703K

    下载量: 55

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